Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox6cQ9CPQ1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox6cQ9CPQ1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox6cQ9CPQ1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox6cQ9CPQ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox6cQ9CPQ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox6cQ9CPQ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox6cQ9CPQ1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox6cQ9CPQ1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox6cQ9CPQ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox6cQ9CPQ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox6cQ9CPQ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox6cQ9CPQ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox6cQ9CPQ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox6cQ9CPQ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox6cQ9CPQ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox6cQ9CPQ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox6cQ9CPQ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox6cQ9CPQ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox6cQ9CPQ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox6cQ9CPQ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cox6cQ9CPQ1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cox6cQ9CPQ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cox6cQ9CPQ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cox6cQ9CPQ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cox6cQ9CPQ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cox6cQ9CPQ1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cox6cQ9CPQ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cox6cQ9CPQ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cox6cQ9CPQ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cox6cQ9CPQ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cox6cQ9CPQ1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cox6cQ9CPQ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cox6cQ9CPQ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cox6cQ9CPQ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cox6cQ9CPQ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox6cQ9CPQ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox6cQ9CPQ1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox6cQ9CPQ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox6cQ9CPQ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox6cQ9CPQ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox6cQ9CPQ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox6cQ9CPQ1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox6cQ9CPQ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox6cQ9CPQ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cox6cQ9CPQ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox6cQ9CPQ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox6cQ9CPQ1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox6cQ9CPQ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox6cQ9CPQ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cox6cQ9CPQ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cox6cQ9CPQ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cox6cQ9CPQ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cox6cQ9CPQ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cox6cQ9CPQ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cox6cQ9CPQ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cox6cQ9CPQ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cox6cQ9CPQ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cox6cQ9CPQ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cox6cQ9CPQ1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox6cQ9CPQ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox6cQ9CPQ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox6cQ9CPQ1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox6cQ9CPQ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox6cQ9CPQ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox6cQ9CPQ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox6cQ9CPQ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox6cQ9CPQ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox6cQ9CPQ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox6cQ9CPQ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox6cQ9CPQ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox6cQ9CPQ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox6cQ9CPQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox6cQ9CPQ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox6cQ9CPQ1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cox6cQ9CPQ1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cox6cQ9CPQ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox6cQ9CPQ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox6cQ9CPQ1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox6cQ9CPQ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox6cQ9CPQ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cox6cQ9CPQ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox6cQ9CPQ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox6cQ9CPQ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox6cQ9CPQ1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox6cQ9CPQ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox6cQ9CPQ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox6cQ9CPQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox6cQ9CPQ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox6cQ9CPQ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox6cQ9CPQ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox6cQ9CPQ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox6cQ9CPQ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox6cQ9CPQ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox6cQ9CPQ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox6cQ9CPQ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox6cQ9CPQ1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox6cQ9CPQ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cox6cQ9CPQ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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