Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cox6cQ9CPQ1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cox6cQ9CPQ1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox6cQ9CPQ1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cox6cQ9CPQ1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cox6cQ9CPQ1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cox6cQ9CPQ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cox6cQ9CPQ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cox6cQ9CPQ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cox6cQ9CPQ1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cox6cQ9CPQ1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cox6cQ9CPQ1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cox6cQ9CPQ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cox6cQ9CPQ1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cox6cQ9CPQ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cox6cQ9CPQ1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cox6cQ9CPQ1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cox6cQ9CPQ1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cox6cQ9CPQ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cox6cQ9CPQ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cox6cQ9CPQ1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cox6cQ9CPQ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cox6cQ9CPQ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cox6cQ9CPQ1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cox6cQ9CPQ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox6cQ9CPQ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cox6cQ9CPQ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cox6cQ9CPQ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cox6cQ9CPQ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cox6cQ9CPQ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cox6cQ9CPQ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cox6cQ9CPQ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cox6cQ9CPQ1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cox6cQ9CPQ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cox6cQ9CPQ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cox6cQ9CPQ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cox6cQ9CPQ1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cox6cQ9CPQ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cox6cQ9CPQ1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cox6cQ9CPQ1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cox6cQ9CPQ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cox6cQ9CPQ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cox6cQ9CPQ1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cox6cQ9CPQ1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cox6cQ9CPQ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cox6cQ9CPQ1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cox6cQ9CPQ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cox6cQ9CPQ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cox6cQ9CPQ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cox6cQ9CPQ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cox6cQ9CPQ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cox6cQ9CPQ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cox6cQ9CPQ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cox6cQ9CPQ1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cox6cQ9CPQ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cox6cQ9CPQ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cox6cQ9CPQ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cox6cQ9CPQ1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cox6cQ9CPQ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cox6cQ9CPQ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cox6cQ9CPQ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cox6cQ9CPQ1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cox6cQ9CPQ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cox6cQ9CPQ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cox6cQ9CPQ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cox6cQ9CPQ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cox6cQ9CPQ1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cox6cQ9CPQ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cox6cQ9CPQ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cox6cQ9CPQ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cox6cQ9CPQ1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cox6cQ9CPQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cox6cQ9CPQ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cox6cQ9CPQ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cox6cQ9CPQ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cox6cQ9CPQ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cox6cQ9CPQ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cox6cQ9CPQ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cox6cQ9CPQ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cox6cQ9CPQ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cox6cQ9CPQ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cox6cQ9CPQ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cox6cQ9CPQ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cox6cQ9CPQ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cox6cQ9CPQ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cox6cQ9CPQ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cox6cQ9CPQ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cox6cQ9CPQ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cox6cQ9CPQ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cox6cQ9CPQ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cox6cQ9CPQ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cox6cQ9CPQ1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cox6cQ9CPQ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox6cQ9CPQ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox6cQ9CPQ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox6cQ9CPQ1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox6cQ9CPQ1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox6cQ9CPQ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox6cQ9CPQ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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