Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep41Q99NF3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep41Q99NF3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep41Q99NF3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep41Q99NF3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep41Q99NF3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep41Q99NF3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep41Q99NF3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep41Q99NF3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep41Q99NF3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep41Q99NF3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep41Q99NF3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep41Q99NF3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep41Q99NF3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep41Q99NF3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep41Q99NF3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep41Q99NF3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep41Q99NF3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep41Q99NF3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep41Q99NF3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep41Q99NF3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep41Q99NF3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cep41Q99NF3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cep41Q99NF3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cep41Q99NF3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep41Q99NF3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep41Q99NF3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cep41Q99NF3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep41Q99NF3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep41Q99NF3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep41Q99NF3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep41Q99NF3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep41Q99NF3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep41Q99NF3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep41Q99NF3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep41Q99NF3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep41Q99NF3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep41Q99NF3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cep41Q99NF3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep41Q99NF3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep41Q99NF3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep41Q99NF3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep41Q99NF3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep41Q99NF3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cep41Q99NF3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cep41Q99NF3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cep41Q99NF3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep41Q99NF3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cep41Q99NF3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cep41Q99NF3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cep41Q99NF3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep41Q99NF3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep41Q99NF3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep41Q99NF3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep41Q99NF3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep41Q99NF3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep41Q99NF3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep41Q99NF3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep41Q99NF3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep41Q99NF3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep41Q99NF3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep41Q99NF3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep41Q99NF3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep41Q99NF3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep41Q99NF3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep41Q99NF3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cep41Q99NF3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cep41Q99NF3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep41Q99NF3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep41Q99NF3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep41Q99NF3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cep41Q99NF3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep41Q99NF3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep41Q99NF3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep41Q99NF3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep41Q99NF3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep41Q99NF3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep41Q99NF3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep41Q99NF3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep41Q99NF3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep41Q99NF3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep41Q99NF3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep41Q99NF3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep41Q99NF3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep41Q99NF3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep41Q99NF3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep41Q99NF3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep41Q99NF3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep41Q99NF3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep41Q99NF3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cep41Q99NF3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep41Q99NF3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep41Q99NF3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep41Q99NF3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep41Q99NF3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep41Q99NF3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep41Q99NF3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cep41Q99NF3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep41Q99NF3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep41Q99NF3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms