Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Mcoln1Q99J21 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Mcoln1Q99J21 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Mcoln1Q99J21 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Mcoln1Q99J21 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Mcoln1Q99J21 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Mcoln1Q99J21 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Mcoln1Q99J21 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Mcoln1Q99J21 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Mcoln1Q99J21 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Mcoln1Q99J21 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Mcoln1Q99J21 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Mcoln1Q99J21 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Mcoln1Q99J21 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Mcoln1Q99J21 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Mcoln1Q99J21 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Mcoln1Q99J21 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Mcoln1Q99J21 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Mcoln1Q99J21 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Mcoln1Q99J21 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Mcoln1Q99J21 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Mcoln1Q99J21 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Mcoln1Q99J21 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Mcoln1Q99J21 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Mcoln1Q99J21 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Mcoln1Q99J21 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mcoln1Q99J21 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Mcoln1Q99J21 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Mcoln1Q99J21 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Mcoln1Q99J21 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Mcoln1Q99J21 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Mcoln1Q99J21 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Mcoln1Q99J21 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Mcoln1Q99J21 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mcoln1Q99J21 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mcoln1Q99J21 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Mcoln1Q99J21 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Mcoln1Q99J21 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Mcoln1Q99J21 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Mcoln1Q99J21 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Mcoln1Q99J21 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Mcoln1Q99J21 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Mcoln1Q99J21 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Mcoln1Q99J21 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Mcoln1Q99J21 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Mcoln1Q99J21 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Mcoln1Q99J21 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Mcoln1Q99J21 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Mcoln1Q99J21 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mcoln1Q99J21 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mcoln1Q99J21 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mcoln1Q99J21 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mcoln1Q99J21 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Mcoln1Q99J21 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Mcoln1Q99J21 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mcoln1Q99J21 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mcoln1Q99J21 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Mcoln1Q99J21 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mcoln1Q99J21 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mcoln1Q99J21 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mcoln1Q99J21 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mcoln1Q99J21 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mcoln1Q99J21 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mcoln1Q99J21 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Mcoln1Q99J21 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Mcoln1Q99J21 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mcoln1Q99J21 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mcoln1Q99J21 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Mcoln1Q99J21 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mcoln1Q99J21 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mcoln1Q99J21 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mcoln1Q99J21 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Mcoln1Q99J21 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mcoln1Q99J21 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Mcoln1Q99J21 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mcoln1Q99J21 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mcoln1Q99J21 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mcoln1Q99J21 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mcoln1Q99J21 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mcoln1Q99J21 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Mcoln1Q99J21 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mcoln1Q99J21 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mcoln1Q99J21 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mcoln1Q99J21 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mcoln1Q99J21 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mcoln1Q99J21 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mcoln1Q99J21 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Mcoln1Q99J21 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mcoln1Q99J21 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mcoln1Q99J21 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mcoln1Q99J21 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mcoln1Q99J21 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mcoln1Q99J21 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mcoln1Q99J21 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mcoln1Q99J21 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mcoln1Q99J21 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mcoln1Q99J21 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mcoln1Q99J21 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mcoln1Q99J21 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Mcoln1Q99J21 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms