Protein–RNA interactions for Protein: Q99394

TRS33, Trafficking protein particle complex subunit 33, yeastyeast

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRS33Q99394 SDH1YKL148C 1923 nt13.96□□□□□ -0.18
TRS33Q99394 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.95□□□□□ -0.18
TRS33Q99394 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.95□□□□□ -0.18
TRS33Q99394 IRC15YPL017C 1500 nt13.94□□□□□ -0.18
TRS33Q99394 RKM5YLR137W 1104 nt13.89□□□□□ -0.19
TRS33Q99394 ART5YGR068C 1761 nt13.88□□□□□ -0.19
TRS33Q99394 GFD2YCL036W 1701 nt13.87□□□□□ -0.19
TRS33Q99394 GIS3YLR094C 1509 nt13.82□□□□□ -0.2
TRS33Q99394 SCC4YER147C 1875 nt13.81□□□□□ -0.2
TRS33Q99394 RTS2YOR077W 699 nt13.74□□□□□ -0.21
TRS33Q99394 TIR4YOR009W 1464 nt13.74□□□□□ -0.21
TRS33Q99394 PET9YBL030C 957 nt13.73□□□□□ -0.21
TRS33Q99394 NPL3YDR432W 1245 nt13.64□□□□□ -0.23
TRS33Q99394 YCH1YGR203W 447 nt13.61□□□□□ -0.23
TRS33Q99394 YMR057CYMR057C 372 nt13.61□□□□□ -0.23
TRS33Q99394 CUE1YMR264W 612 nt13.58□□□□□ -0.24
TRS33Q99394 PCH2YBR186W 1695 nt13.56□□□□□ -0.24
TRS33Q99394 YOR139CYOR139C 393 nt13.54□□□□□ -0.24
TRS33Q99394 YSC84YHR016C 1407 nt13.54□□□□□ -0.24
TRS33Q99394 FPS1YLL043W 2010 nt13.53□□□□□ -0.24
TRS33Q99394 YOL037CYOL037C 354 nt13.53□□□□□ -0.24
TRS33Q99394 GUT2YIL155C 1950 nt13.52□□□□□ -0.24
TRS33Q99394 SEC11YIR022W 504 nt13.52□□□□□ -0.25
TRS33Q99394 YHL050CYHL050C 2094 nt13.51□□□□□ -0.25
TRS33Q99394 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.51□□□□□ -0.25
TRS33Q99394 RRT12YCR045C 1476 nt13.47□□□□□ -0.25
TRS33Q99394 YJL152WYJL152W 360 nt13.44□□□□□ -0.26
TRS33Q99394 PIB2YGL023C 1908 nt13.42□□□□□ -0.26
TRS33Q99394 YIL100WYIL100W 354 nt13.35□□□□□ -0.27
TRS33Q99394 YLR281CYLR281C 468 nt13.33□□□□□ -0.28
TRS33Q99394 WHI5YOR083W 888 nt13.33□□□□□ -0.28
TRS33Q99394 YLR236CYLR236C 324 nt13.31□□□□□ -0.28
TRS33Q99394 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.28□□□□□ -0.28
TRS33Q99394 YNL195CYNL195C 786 nt13.25□□□□□ -0.29
TRS33Q99394 RTF1YGL244W 1677 nt13.21□□□□□ -0.29
TRS33Q99394 NCP1YHR042W 2076 nt13.14□□□□□ -0.31
TRS33Q99394 RRD1YIL153W 1182 nt13.14□□□□□ -0.31
TRS33Q99394 BOP3YNL042W 1191 nt13.12□□□□□ -0.31
TRS33Q99394 PAC11YDR488C 1602 nt13.12□□□□□ -0.31
TRS33Q99394 PTK1YKL198C 1989 nt13.11□□□□□ -0.31
TRS33Q99394 DED1YOR204W 1815 nt13.09□□□□□ -0.31
TRS33Q99394 NME1NME1 340 nt13.08□□□□□ -0.32
TRS33Q99394 IDH1YNL037C 1083 nt13.07□□□□□ -0.32
TRS33Q99394 GBP2YCL011C 1284 nt13.06□□□□□ -0.32
TRS33Q99394 PUS2YGL063W 1113 nt13.05□□□□□ -0.32
TRS33Q99394 YPR011CYPR011C 981 nt13.05□□□□□ -0.32
TRS33Q99394 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.03□□□□□ -0.32
TRS33Q99394 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.03□□□□□ -0.32
TRS33Q99394 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.03□□□□□ -0.32
TRS33Q99394 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.03□□□□□ -0.32
TRS33Q99394 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.03□□□□□ -0.32
TRS33Q99394 LCB1YMR296C 1677 nt13.02□□□□□ -0.33
TRS33Q99394 FMT1YBL013W 1206 nt13□□□□□ -0.33
TRS33Q99394 DSK2YMR276W 1122 nt12.98□□□□□ -0.33
TRS33Q99394 TCD2YKL027W 1344 nt12.94□□□□□ -0.34
TRS33Q99394 IMP2'YIL154C 1041 nt12.94□□□□□ -0.34
TRS33Q99394 FMP52YER004W 696 nt12.93□□□□□ -0.34
TRS33Q99394 YGR139WYGR139W 339 nt12.91□□□□□ -0.34
TRS33Q99394 MXR2YCL033C 507 nt12.91□□□□□ -0.34
TRS33Q99394 PCM1YEL058W 1674 nt12.9□□□□□ -0.34
TRS33Q99394 FMP45YDL222C 930 nt12.9□□□□□ -0.34
TRS33Q99394 YDR433WYDR433W 441 nt12.87□□□□□ -0.35
TRS33Q99394 ADH2YMR303C 1047 nt12.85□□□□□ -0.35
TRS33Q99394 LPX1YOR084W 1164 nt12.82□□□□□ -0.36
TRS33Q99394 CWP1YKL096W 720 nt12.81□□□□□ -0.36
TRS33Q99394 ERV46YAL042W 1248 nt12.8□□□□□ -0.36
TRS33Q99394 SIM1YIL123W 1431 nt12.79□□□□□ -0.36
TRS33Q99394 LYS4YDR234W 2082 nt12.77□□□□□ -0.36
TRS33Q99394 SOR2YDL246C 1074 nt12.77□□□□□ -0.37
TRS33Q99394 SOR1YJR159W 1074 nt12.77□□□□□ -0.37
TRS33Q99394 YFL054CYFL054C 1941 nt12.77□□□□□ -0.37
TRS33Q99394 BIO4YNR057C 714 nt12.74□□□□□ -0.37
TRS33Q99394 SNF6YHL025W 999 nt12.73□□□□□ -0.37
TRS33Q99394 YKR040CYKR040C 504 nt12.72□□□□□ -0.37
TRS33Q99394 FRD1YEL047C 1413 nt12.71□□□□□ -0.37
TRS33Q99394 SPT8YLR055C 1809 nt12.7□□□□□ -0.38
TRS33Q99394 NVJ2YPR091C 2313 nt12.65□□□□□ -0.38
TRS33Q99394 YCL042WYCL042W 360 nt12.65□□□□□ -0.38
TRS33Q99394 YIH1YCR059C 777 nt12.62□□□□□ -0.39
TRS33Q99394 YLL053CYLL053C 459 nt12.56□□□□□ -0.4
TRS33Q99394 RNQ1YCL028W 1218 nt12.56□□□□□ -0.4
TRS33Q99394 CRR1YLR213C 1269 nt12.53□□□□□ -0.4
TRS33Q99394 ERF2YLR246W 1080 nt12.52□□□□□ -0.41
TRS33Q99394 SWE1YJL187C 2460 nt12.52□□□□□ -0.41
TRS33Q99394 ATF2YGR177C 1608 nt12.49□□□□□ -0.41
TRS33Q99394 SPP1YPL138C 1062 nt12.49□□□□□ -0.41
TRS33Q99394 MIC10YCL057C-A 294 nt12.45□□□□□ -0.42
TRS33Q99394 DIC1YLR348C 897 nt12.44□□□□□ -0.42
TRS33Q99394 FTR1YER145C 1215 nt12.43□□□□□ -0.42
TRS33Q99394 GAL1YBR020W 1587 nt12.4□□□□□ -0.42
TRS33Q99394 TRM5YHR070W 1500 nt12.39□□□□□ -0.43
TRS33Q99394 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.39□□□□□ -0.43
TRS33Q99394 SNG1YGR197C 1644 nt12.39□□□□□ -0.43
TRS33Q99394 HEM12YDR047W 1089 nt12.37□□□□□ -0.43
TRS33Q99394 PTH1YHR189W 573 nt12.37□□□□□ -0.43
TRS33Q99394 YFL067WYFL067W 528 nt12.34□□□□□ -0.43
TRS33Q99394 DDR2YOL052C-A 186 nt12.28□□□□□ -0.44
TRS33Q99394 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.27□□□□□ -0.45
TRS33Q99394 ANP1YEL036C 1503 nt12.25□□□□□ -0.45
TRS33Q99394 CCA1YER168C 1641 nt12.24□□□□□ -0.45
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