Protein–RNA interactions for Protein: Q99258

RIB3, 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase, yeastyeast

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIB3Q99258 GFD2YCL036W 1701 nt11.55□□□□□ -0.56
RIB3Q99258 PCH2YBR186W 1695 nt11.53□□□□□ -0.56
RIB3Q99258 SEC11YIR022W 504 nt11.53□□□□□ -0.56
RIB3Q99258 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.52□□□□□ -0.57
RIB3Q99258 SHU1YHL006C 453 nt11.51□□□□□ -0.57
RIB3Q99258 HOM6YJR139C 1080 nt11.5□□□□□ -0.57
RIB3Q99258 RTS2YOR077W 699 nt11.5□□□□□ -0.57
RIB3Q99258 PAC11YDR488C 1602 nt11.49□□□□□ -0.57
RIB3Q99258 PET9YBL030C 957 nt11.47□□□□□ -0.57
RIB3Q99258 GUT2YIL155C 1950 nt11.47□□□□□ -0.57
RIB3Q99258 YSC84YHR016C 1407 nt11.43□□□□□ -0.58
RIB3Q99258 MNP1YGL068W 585 nt11.39□□□□□ -0.59
RIB3Q99258 YCH1YGR203W 447 nt11.39□□□□□ -0.59
RIB3Q99258 CUE1YMR264W 612 nt11.36□□□□□ -0.59
RIB3Q99258 TIR4YOR009W 1464 nt11.36□□□□□ -0.59
RIB3Q99258 RKM5YLR137W 1104 nt11.34□□□□□ -0.59
RIB3Q99258 YMR057CYMR057C 372 nt11.34□□□□□ -0.59
RIB3Q99258 YHL050CYHL050C 2094 nt11.34□□□□□ -0.59
RIB3Q99258 RRT12YCR045C 1476 nt11.32□□□□□ -0.6
RIB3Q99258 YNL195CYNL195C 786 nt11.3□□□□□ -0.6
RIB3Q99258 YIL100WYIL100W 354 nt11.28□□□□□ -0.6
RIB3Q99258 PIB2YGL023C 1908 nt11.25□□□□□ -0.61
RIB3Q99258 RTF1YGL244W 1677 nt11.24□□□□□ -0.61
RIB3Q99258 FPS1YLL043W 2010 nt11.2□□□□□ -0.62
RIB3Q99258 YJL152WYJL152W 360 nt11.19□□□□□ -0.62
RIB3Q99258 YLR236CYLR236C 324 nt11.19□□□□□ -0.62
RIB3Q99258 YKL097CYKL097C 411 nt11.18□□□□□ -0.62
RIB3Q99258 BOP3YNL042W 1191 nt11.17□□□□□ -0.62
RIB3Q99258 NPL3YDR432W 1245 nt11.16□□□□□ -0.62
RIB3Q99258 NVJ2YPR091C 2313 nt11.13□□□□□ -0.63
RIB3Q99258 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.12□□□□□ -0.63
RIB3Q99258 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.1□□□□□ -0.63
RIB3Q99258 PTK1YKL198C 1989 nt11.05□□□□□ -0.64
RIB3Q99258 YOL037CYOL037C 354 nt11□□□□□ -0.65
RIB3Q99258 NCP1YHR042W 2076 nt10.97□□□□□ -0.65
RIB3Q99258 YFL054CYFL054C 1941 nt10.88□□□□□ -0.67
RIB3Q99258 WHI5YOR083W 888 nt10.86□□□□□ -0.67
RIB3Q99258 LCB1YMR296C 1677 nt10.85□□□□□ -0.67
RIB3Q99258 RRD1YIL153W 1182 nt10.8□□□□□ -0.68
RIB3Q99258 IDH1YNL037C 1083 nt10.8□□□□□ -0.68
RIB3Q99258 YLR281CYLR281C 468 nt10.79□□□□□ -0.68
RIB3Q99258 YOR139CYOR139C 393 nt10.79□□□□□ -0.68
RIB3Q99258 GBP2YCL011C 1284 nt10.79□□□□□ -0.68
RIB3Q99258 SPT8YLR055C 1809 nt10.76□□□□□ -0.69
RIB3Q99258 SIM1YIL123W 1431 nt10.75□□□□□ -0.69
RIB3Q99258 FMP52YER004W 696 nt10.74□□□□□ -0.69
RIB3Q99258 TCD2YKL027W 1344 nt10.74□□□□□ -0.69
RIB3Q99258 PCM1YEL058W 1674 nt10.73□□□□□ -0.69
RIB3Q99258 DED1YOR204W 1815 nt10.7□□□□□ -0.7
RIB3Q99258 FMT1YBL013W 1206 nt10.65□□□□□ -0.7
RIB3Q99258 CWP1YKL096W 720 nt10.64□□□□□ -0.71
RIB3Q99258 BOR1YNL275W 1731 nt10.63□□□□□ -0.71
RIB3Q99258 SNF6YHL025W 999 nt10.62□□□□□ -0.71
RIB3Q99258 ADH2YMR303C 1047 nt10.62□□□□□ -0.71
RIB3Q99258 LYS4YDR234W 2082 nt10.62□□□□□ -0.71
RIB3Q99258 IMP2'YIL154C 1041 nt10.61□□□□□ -0.71
RIB3Q99258 YDR433WYDR433W 441 nt10.59□□□□□ -0.71
RIB3Q99258 BIO4YNR057C 714 nt10.59□□□□□ -0.71
RIB3Q99258 PUS2YGL063W 1113 nt10.58□□□□□ -0.72
RIB3Q99258 SWE1YJL187C 2460 nt10.58□□□□□ -0.72
RIB3Q99258 DSK2YMR276W 1122 nt10.57□□□□□ -0.72
RIB3Q99258 MXR2YCL033C 507 nt10.54□□□□□ -0.72
RIB3Q99258 YCL042WYCL042W 360 nt10.52□□□□□ -0.73
RIB3Q99258 FMP45YDL222C 930 nt10.5□□□□□ -0.73
RIB3Q99258 ERF2YLR246W 1080 nt10.49□□□□□ -0.73
RIB3Q99258 SOR2YDL246C 1074 nt10.47□□□□□ -0.73
RIB3Q99258 SOR1YJR159W 1074 nt10.47□□□□□ -0.73
RIB3Q99258 YPR011CYPR011C 981 nt10.47□□□□□ -0.73
RIB3Q99258 YIH1YCR059C 777 nt10.43□□□□□ -0.74
RIB3Q99258 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.43□□□□□ -0.74
RIB3Q99258 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.43□□□□□ -0.74
RIB3Q99258 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.43□□□□□ -0.74
RIB3Q99258 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.43□□□□□ -0.74
RIB3Q99258 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.43□□□□□ -0.74
RIB3Q99258 CRR1YLR213C 1269 nt10.43□□□□□ -0.74
RIB3Q99258 HSP60YLR259C 1719 nt10.42□□□□□ -0.74
RIB3Q99258 YLL053CYLL053C 459 nt10.42□□□□□ -0.74
RIB3Q99258 YKR040CYKR040C 504 nt10.4□□□□□ -0.74
RIB3Q99258 RNQ1YCL028W 1218 nt10.4□□□□□ -0.74
RIB3Q99258 YJL225CYJL225C 5277 nt10.39□□□□□ -0.75
RIB3Q99258 LPX1YOR084W 1164 nt10.39□□□□□ -0.75
RIB3Q99258 HEM12YDR047W 1089 nt10.38□□□□□ -0.75
RIB3Q99258 ERV46YAL042W 1248 nt10.38□□□□□ -0.75
RIB3Q99258 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.37□□□□□ -0.75
RIB3Q99258 FRD1YEL047C 1413 nt10.36□□□□□ -0.75
RIB3Q99258 ATF2YGR177C 1608 nt10.36□□□□□ -0.75
RIB3Q99258 UME6YDR207C 2511 nt10.36□□□□□ -0.75
RIB3Q99258 MIC10YCL057C-A 294 nt10.35□□□□□ -0.75
RIB3Q99258 GLK1YCL040W 1503 nt10.34□□□□□ -0.75
RIB3Q99258 RAX1YOR301W 1308 nt10.33□□□□□ -0.76
RIB3Q99258 YFL067WYFL067W 528 nt10.32□□□□□ -0.76
RIB3Q99258 SNG1YGR197C 1644 nt10.3□□□□□ -0.76
RIB3Q99258 FTR1YER145C 1215 nt10.3□□□□□ -0.76
RIB3Q99258 FUR4YBR021W 1902 nt10.29□□□□□ -0.76
RIB3Q99258 DDR2YOL052C-A 186 nt10.29□□□□□ -0.76
RIB3Q99258 TRM5YHR070W 1500 nt10.28□□□□□ -0.76
RIB3Q99258 CCA1YER168C 1641 nt10.28□□□□□ -0.76
RIB3Q99258 GAL1YBR020W 1587 nt10.26□□□□□ -0.77
RIB3Q99258 DIC1YLR348C 897 nt10.26□□□□□ -0.77
RIB3Q99258 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.22□□□□□ -0.77
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