Protein–RNA interactions for Protein: Q925N2

Sfxn2, Sideroflexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn2Q925N2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sfxn2Q925N2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sfxn2Q925N2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sfxn2Q925N2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sfxn2Q925N2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sfxn2Q925N2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sfxn2Q925N2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sfxn2Q925N2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sfxn2Q925N2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sfxn2Q925N2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sfxn2Q925N2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sfxn2Q925N2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sfxn2Q925N2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sfxn2Q925N2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sfxn2Q925N2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sfxn2Q925N2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sfxn2Q925N2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sfxn2Q925N2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sfxn2Q925N2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sfxn2Q925N2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sfxn2Q925N2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sfxn2Q925N2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sfxn2Q925N2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sfxn2Q925N2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sfxn2Q925N2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sfxn2Q925N2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sfxn2Q925N2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sfxn2Q925N2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sfxn2Q925N2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sfxn2Q925N2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sfxn2Q925N2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sfxn2Q925N2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sfxn2Q925N2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sfxn2Q925N2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sfxn2Q925N2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sfxn2Q925N2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sfxn2Q925N2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sfxn2Q925N2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sfxn2Q925N2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sfxn2Q925N2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sfxn2Q925N2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sfxn2Q925N2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sfxn2Q925N2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sfxn2Q925N2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sfxn2Q925N2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sfxn2Q925N2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sfxn2Q925N2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sfxn2Q925N2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sfxn2Q925N2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sfxn2Q925N2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sfxn2Q925N2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sfxn2Q925N2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sfxn2Q925N2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sfxn2Q925N2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sfxn2Q925N2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sfxn2Q925N2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sfxn2Q925N2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sfxn2Q925N2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfxn2Q925N2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfxn2Q925N2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sfxn2Q925N2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sfxn2Q925N2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sfxn2Q925N2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sfxn2Q925N2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sfxn2Q925N2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sfxn2Q925N2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sfxn2Q925N2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sfxn2Q925N2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sfxn2Q925N2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfxn2Q925N2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfxn2Q925N2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sfxn2Q925N2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfxn2Q925N2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfxn2Q925N2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfxn2Q925N2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfxn2Q925N2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfxn2Q925N2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfxn2Q925N2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfxn2Q925N2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sfxn2Q925N2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sfxn2Q925N2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sfxn2Q925N2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sfxn2Q925N2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sfxn2Q925N2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sfxn2Q925N2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sfxn2Q925N2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sfxn2Q925N2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sfxn2Q925N2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sfxn2Q925N2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sfxn2Q925N2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sfxn2Q925N2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sfxn2Q925N2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sfxn2Q925N2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sfxn2Q925N2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sfxn2Q925N2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sfxn2Q925N2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfxn2Q925N2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfxn2Q925N2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sfxn2Q925N2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sfxn2Q925N2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms