Protein–RNA interactions for Protein: Q925N2

Sfxn2, Sideroflexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn2Q925N2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Sfxn2Q925N2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Sfxn2Q925N2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sfxn2Q925N2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Sfxn2Q925N2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Sfxn2Q925N2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sfxn2Q925N2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Sfxn2Q925N2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Sfxn2Q925N2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sfxn2Q925N2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sfxn2Q925N2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sfxn2Q925N2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sfxn2Q925N2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Sfxn2Q925N2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sfxn2Q925N2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sfxn2Q925N2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sfxn2Q925N2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Sfxn2Q925N2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sfxn2Q925N2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sfxn2Q925N2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sfxn2Q925N2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sfxn2Q925N2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sfxn2Q925N2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sfxn2Q925N2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Sfxn2Q925N2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sfxn2Q925N2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sfxn2Q925N2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sfxn2Q925N2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sfxn2Q925N2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Sfxn2Q925N2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sfxn2Q925N2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sfxn2Q925N2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sfxn2Q925N2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sfxn2Q925N2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sfxn2Q925N2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sfxn2Q925N2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sfxn2Q925N2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sfxn2Q925N2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sfxn2Q925N2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sfxn2Q925N2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sfxn2Q925N2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Sfxn2Q925N2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sfxn2Q925N2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sfxn2Q925N2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sfxn2Q925N2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sfxn2Q925N2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sfxn2Q925N2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sfxn2Q925N2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sfxn2Q925N2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sfxn2Q925N2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sfxn2Q925N2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sfxn2Q925N2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Sfxn2Q925N2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sfxn2Q925N2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sfxn2Q925N2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sfxn2Q925N2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sfxn2Q925N2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sfxn2Q925N2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sfxn2Q925N2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sfxn2Q925N2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sfxn2Q925N2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sfxn2Q925N2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sfxn2Q925N2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sfxn2Q925N2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sfxn2Q925N2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sfxn2Q925N2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Sfxn2Q925N2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sfxn2Q925N2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sfxn2Q925N2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sfxn2Q925N2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sfxn2Q925N2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sfxn2Q925N2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sfxn2Q925N2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sfxn2Q925N2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sfxn2Q925N2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sfxn2Q925N2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sfxn2Q925N2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sfxn2Q925N2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sfxn2Q925N2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sfxn2Q925N2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sfxn2Q925N2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sfxn2Q925N2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sfxn2Q925N2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sfxn2Q925N2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sfxn2Q925N2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sfxn2Q925N2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sfxn2Q925N2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sfxn2Q925N2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sfxn2Q925N2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sfxn2Q925N2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sfxn2Q925N2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sfxn2Q925N2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sfxn2Q925N2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sfxn2Q925N2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sfxn2Q925N2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sfxn2Q925N2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sfxn2Q925N2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sfxn2Q925N2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sfxn2Q925N2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sfxn2Q925N2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms