Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Chrna2Q91X60 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Chrna2Q91X60 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Chrna2Q91X60 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Chrna2Q91X60 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Chrna2Q91X60 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Chrna2Q91X60 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Chrna2Q91X60 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Chrna2Q91X60 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Chrna2Q91X60 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Chrna2Q91X60 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Chrna2Q91X60 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Chrna2Q91X60 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Chrna2Q91X60 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Chrna2Q91X60 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Chrna2Q91X60 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Chrna2Q91X60 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Chrna2Q91X60 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Chrna2Q91X60 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Chrna2Q91X60 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Chrna2Q91X60 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Chrna2Q91X60 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Chrna2Q91X60 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Chrna2Q91X60 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Chrna2Q91X60 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Chrna2Q91X60 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Chrna2Q91X60 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Chrna2Q91X60 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Chrna2Q91X60 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Chrna2Q91X60 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Chrna2Q91X60 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Chrna2Q91X60 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Chrna2Q91X60 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Chrna2Q91X60 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Chrna2Q91X60 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Chrna2Q91X60 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Chrna2Q91X60 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Chrna2Q91X60 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Chrna2Q91X60 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Chrna2Q91X60 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Chrna2Q91X60 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Chrna2Q91X60 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Chrna2Q91X60 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Chrna2Q91X60 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Chrna2Q91X60 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Chrna2Q91X60 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Chrna2Q91X60 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Chrna2Q91X60 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Chrna2Q91X60 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Chrna2Q91X60 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Chrna2Q91X60 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Chrna2Q91X60 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Chrna2Q91X60 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Chrna2Q91X60 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Chrna2Q91X60 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Chrna2Q91X60 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Chrna2Q91X60 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Chrna2Q91X60 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Chrna2Q91X60 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Chrna2Q91X60 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Chrna2Q91X60 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Chrna2Q91X60 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Chrna2Q91X60 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Chrna2Q91X60 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Chrna2Q91X60 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Chrna2Q91X60 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Chrna2Q91X60 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Chrna2Q91X60 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Chrna2Q91X60 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Chrna2Q91X60 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Chrna2Q91X60 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Chrna2Q91X60 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Chrna2Q91X60 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Chrna2Q91X60 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Chrna2Q91X60 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Chrna2Q91X60 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Chrna2Q91X60 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Chrna2Q91X60 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Chrna2Q91X60 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Chrna2Q91X60 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Chrna2Q91X60 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Chrna2Q91X60 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Chrna2Q91X60 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Chrna2Q91X60 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Chrna2Q91X60 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Chrna2Q91X60 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Chrna2Q91X60 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Chrna2Q91X60 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Chrna2Q91X60 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Chrna2Q91X60 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Chrna2Q91X60 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chrna2Q91X60 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Chrna2Q91X60 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Chrna2Q91X60 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Chrna2Q91X60 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Chrna2Q91X60 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Chrna2Q91X60 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Chrna2Q91X60 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Chrna2Q91X60 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Chrna2Q91X60 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms