Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Snx11Q91WL6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snx11Q91WL6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx11Q91WL6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snx11Q91WL6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snx11Q91WL6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx11Q91WL6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx11Q91WL6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx11Q91WL6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snx11Q91WL6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx11Q91WL6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx11Q91WL6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx11Q91WL6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx11Q91WL6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Snx11Q91WL6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx11Q91WL6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx11Q91WL6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx11Q91WL6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx11Q91WL6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snx11Q91WL6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx11Q91WL6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx11Q91WL6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx11Q91WL6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx11Q91WL6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx11Q91WL6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx11Q91WL6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx11Q91WL6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx11Q91WL6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Snx11Q91WL6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snx11Q91WL6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snx11Q91WL6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snx11Q91WL6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snx11Q91WL6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx11Q91WL6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Snx11Q91WL6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx11Q91WL6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx11Q91WL6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx11Q91WL6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx11Q91WL6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx11Q91WL6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx11Q91WL6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx11Q91WL6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx11Q91WL6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx11Q91WL6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx11Q91WL6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx11Q91WL6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx11Q91WL6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx11Q91WL6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx11Q91WL6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx11Q91WL6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx11Q91WL6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snx11Q91WL6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx11Q91WL6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx11Q91WL6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx11Q91WL6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx11Q91WL6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx11Q91WL6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx11Q91WL6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snx11Q91WL6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx11Q91WL6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx11Q91WL6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx11Q91WL6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx11Q91WL6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx11Q91WL6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx11Q91WL6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx11Q91WL6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx11Q91WL6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx11Q91WL6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx11Q91WL6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx11Q91WL6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx11Q91WL6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx11Q91WL6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx11Q91WL6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx11Q91WL6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx11Q91WL6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx11Q91WL6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx11Q91WL6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx11Q91WL6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx11Q91WL6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx11Q91WL6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx11Q91WL6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx11Q91WL6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx11Q91WL6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx11Q91WL6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx11Q91WL6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx11Q91WL6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx11Q91WL6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx11Q91WL6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx11Q91WL6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx11Q91WL6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx11Q91WL6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx11Q91WL6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx11Q91WL6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx11Q91WL6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx11Q91WL6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx11Q91WL6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx11Q91WL6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx11Q91WL6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snx11Q91WL6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx11Q91WL6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms