Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Snx11Q91WL6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Snx11Q91WL6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Snx11Q91WL6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Snx11Q91WL6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Snx11Q91WL6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Snx11Q91WL6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Snx11Q91WL6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Snx11Q91WL6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Snx11Q91WL6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Snx11Q91WL6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Snx11Q91WL6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Snx11Q91WL6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Snx11Q91WL6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Snx11Q91WL6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Snx11Q91WL6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Snx11Q91WL6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Snx11Q91WL6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Snx11Q91WL6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Snx11Q91WL6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Snx11Q91WL6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Snx11Q91WL6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Snx11Q91WL6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Snx11Q91WL6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Snx11Q91WL6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Snx11Q91WL6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snx11Q91WL6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Snx11Q91WL6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snx11Q91WL6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snx11Q91WL6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snx11Q91WL6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snx11Q91WL6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Snx11Q91WL6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snx11Q91WL6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Snx11Q91WL6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Snx11Q91WL6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snx11Q91WL6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snx11Q91WL6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Snx11Q91WL6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Snx11Q91WL6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Snx11Q91WL6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Snx11Q91WL6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snx11Q91WL6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snx11Q91WL6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snx11Q91WL6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Snx11Q91WL6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Snx11Q91WL6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snx11Q91WL6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snx11Q91WL6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Snx11Q91WL6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snx11Q91WL6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Snx11Q91WL6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snx11Q91WL6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Snx11Q91WL6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Snx11Q91WL6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snx11Q91WL6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Snx11Q91WL6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snx11Q91WL6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Snx11Q91WL6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snx11Q91WL6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Snx11Q91WL6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Snx11Q91WL6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Snx11Q91WL6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Snx11Q91WL6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Snx11Q91WL6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Snx11Q91WL6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Snx11Q91WL6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snx11Q91WL6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Snx11Q91WL6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Snx11Q91WL6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Snx11Q91WL6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx11Q91WL6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx11Q91WL6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snx11Q91WL6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snx11Q91WL6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Snx11Q91WL6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snx11Q91WL6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snx11Q91WL6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snx11Q91WL6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Snx11Q91WL6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx11Q91WL6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx11Q91WL6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx11Q91WL6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Snx11Q91WL6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snx11Q91WL6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx11Q91WL6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snx11Q91WL6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snx11Q91WL6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snx11Q91WL6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx11Q91WL6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx11Q91WL6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snx11Q91WL6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx11Q91WL6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx11Q91WL6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snx11Q91WL6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snx11Q91WL6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snx11Q91WL6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snx11Q91WL6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx11Q91WL6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx11Q91WL6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms