Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vsx1Q91V10 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vsx1Q91V10 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vsx1Q91V10 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vsx1Q91V10 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vsx1Q91V10 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Vsx1Q91V10 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vsx1Q91V10 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vsx1Q91V10 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vsx1Q91V10 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vsx1Q91V10 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vsx1Q91V10 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vsx1Q91V10 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vsx1Q91V10 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vsx1Q91V10 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vsx1Q91V10 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vsx1Q91V10 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vsx1Q91V10 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Vsx1Q91V10 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vsx1Q91V10 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vsx1Q91V10 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vsx1Q91V10 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vsx1Q91V10 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vsx1Q91V10 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vsx1Q91V10 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vsx1Q91V10 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vsx1Q91V10 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vsx1Q91V10 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vsx1Q91V10 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vsx1Q91V10 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vsx1Q91V10 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Vsx1Q91V10 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vsx1Q91V10 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vsx1Q91V10 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vsx1Q91V10 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vsx1Q91V10 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vsx1Q91V10 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vsx1Q91V10 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vsx1Q91V10 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vsx1Q91V10 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vsx1Q91V10 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vsx1Q91V10 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vsx1Q91V10 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Vsx1Q91V10 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vsx1Q91V10 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vsx1Q91V10 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vsx1Q91V10 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Vsx1Q91V10 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vsx1Q91V10 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vsx1Q91V10 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vsx1Q91V10 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Vsx1Q91V10 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vsx1Q91V10 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vsx1Q91V10 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Vsx1Q91V10 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vsx1Q91V10 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vsx1Q91V10 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vsx1Q91V10 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Vsx1Q91V10 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Vsx1Q91V10 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vsx1Q91V10 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Vsx1Q91V10 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vsx1Q91V10 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Vsx1Q91V10 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vsx1Q91V10 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vsx1Q91V10 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vsx1Q91V10 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vsx1Q91V10 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vsx1Q91V10 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vsx1Q91V10 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vsx1Q91V10 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vsx1Q91V10 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vsx1Q91V10 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vsx1Q91V10 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vsx1Q91V10 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vsx1Q91V10 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vsx1Q91V10 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vsx1Q91V10 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vsx1Q91V10 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vsx1Q91V10 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vsx1Q91V10 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vsx1Q91V10 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vsx1Q91V10 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vsx1Q91V10 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Vsx1Q91V10 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vsx1Q91V10 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vsx1Q91V10 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vsx1Q91V10 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vsx1Q91V10 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vsx1Q91V10 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vsx1Q91V10 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vsx1Q91V10 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vsx1Q91V10 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Vsx1Q91V10 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Vsx1Q91V10 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vsx1Q91V10 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vsx1Q91V10 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vsx1Q91V10 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vsx1Q91V10 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vsx1Q91V10 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms