Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odf4Q8VI88 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odf4Q8VI88 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odf4Q8VI88 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Odf4Q8VI88 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Odf4Q8VI88 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Odf4Q8VI88 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Odf4Q8VI88 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Odf4Q8VI88 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odf4Q8VI88 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odf4Q8VI88 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Odf4Q8VI88 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Odf4Q8VI88 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Odf4Q8VI88 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Odf4Q8VI88 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Odf4Q8VI88 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Odf4Q8VI88 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Odf4Q8VI88 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odf4Q8VI88 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odf4Q8VI88 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Odf4Q8VI88 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Odf4Q8VI88 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Odf4Q8VI88 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Odf4Q8VI88 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Odf4Q8VI88 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Odf4Q8VI88 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Odf4Q8VI88 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Odf4Q8VI88 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Odf4Q8VI88 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Odf4Q8VI88 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Odf4Q8VI88 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Odf4Q8VI88 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Odf4Q8VI88 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Odf4Q8VI88 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odf4Q8VI88 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf4Q8VI88 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odf4Q8VI88 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odf4Q8VI88 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Odf4Q8VI88 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Odf4Q8VI88 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odf4Q8VI88 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odf4Q8VI88 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf4Q8VI88 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odf4Q8VI88 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Odf4Q8VI88 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odf4Q8VI88 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odf4Q8VI88 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Odf4Q8VI88 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Odf4Q8VI88 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Odf4Q8VI88 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Odf4Q8VI88 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Odf4Q8VI88 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Odf4Q8VI88 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Odf4Q8VI88 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Odf4Q8VI88 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Odf4Q8VI88 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Odf4Q8VI88 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Odf4Q8VI88 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Odf4Q8VI88 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odf4Q8VI88 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odf4Q8VI88 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Odf4Q8VI88 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Odf4Q8VI88 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf4Q8VI88 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odf4Q8VI88 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf4Q8VI88 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf4Q8VI88 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odf4Q8VI88 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Odf4Q8VI88 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf4Q8VI88 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Odf4Q8VI88 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Odf4Q8VI88 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Odf4Q8VI88 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Odf4Q8VI88 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Odf4Q8VI88 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Odf4Q8VI88 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Odf4Q8VI88 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Odf4Q8VI88 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Odf4Q8VI88 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Odf4Q8VI88 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Odf4Q8VI88 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Odf4Q8VI88 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Odf4Q8VI88 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Odf4Q8VI88 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Odf4Q8VI88 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odf4Q8VI88 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Odf4Q8VI88 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Odf4Q8VI88 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Odf4Q8VI88 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Odf4Q8VI88 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Odf4Q8VI88 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odf4Q8VI88 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Odf4Q8VI88 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Odf4Q8VI88 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Odf4Q8VI88 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Odf4Q8VI88 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Odf4Q8VI88 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Odf4Q8VI88 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Odf4Q8VI88 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Odf4Q8VI88 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms