Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3H0

Appl1, DCC-interacting protein 13-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Appl1Q8K3H0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Appl1Q8K3H0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Appl1Q8K3H0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Appl1Q8K3H0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Appl1Q8K3H0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Appl1Q8K3H0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Appl1Q8K3H0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Appl1Q8K3H0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Appl1Q8K3H0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Appl1Q8K3H0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Appl1Q8K3H0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Appl1Q8K3H0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Appl1Q8K3H0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Appl1Q8K3H0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Appl1Q8K3H0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Appl1Q8K3H0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Appl1Q8K3H0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Appl1Q8K3H0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Appl1Q8K3H0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Appl1Q8K3H0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Appl1Q8K3H0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Appl1Q8K3H0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Appl1Q8K3H0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Appl1Q8K3H0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Appl1Q8K3H0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Appl1Q8K3H0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Appl1Q8K3H0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Appl1Q8K3H0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Appl1Q8K3H0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Appl1Q8K3H0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Appl1Q8K3H0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Appl1Q8K3H0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Appl1Q8K3H0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Appl1Q8K3H0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Appl1Q8K3H0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Appl1Q8K3H0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Appl1Q8K3H0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Appl1Q8K3H0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Appl1Q8K3H0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Appl1Q8K3H0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Appl1Q8K3H0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Appl1Q8K3H0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Appl1Q8K3H0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Appl1Q8K3H0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Appl1Q8K3H0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Appl1Q8K3H0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Appl1Q8K3H0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Appl1Q8K3H0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Appl1Q8K3H0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Appl1Q8K3H0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Appl1Q8K3H0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Appl1Q8K3H0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Appl1Q8K3H0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Appl1Q8K3H0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Appl1Q8K3H0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Appl1Q8K3H0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Appl1Q8K3H0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Appl1Q8K3H0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Appl1Q8K3H0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Appl1Q8K3H0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Appl1Q8K3H0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Appl1Q8K3H0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Appl1Q8K3H0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Appl1Q8K3H0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Appl1Q8K3H0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Appl1Q8K3H0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Appl1Q8K3H0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Appl1Q8K3H0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Appl1Q8K3H0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Appl1Q8K3H0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Appl1Q8K3H0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Appl1Q8K3H0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Appl1Q8K3H0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Appl1Q8K3H0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Appl1Q8K3H0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Appl1Q8K3H0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Appl1Q8K3H0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Appl1Q8K3H0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Appl1Q8K3H0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Appl1Q8K3H0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Appl1Q8K3H0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Appl1Q8K3H0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Appl1Q8K3H0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Appl1Q8K3H0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Appl1Q8K3H0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Appl1Q8K3H0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Appl1Q8K3H0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Appl1Q8K3H0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Appl1Q8K3H0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Appl1Q8K3H0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Appl1Q8K3H0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Appl1Q8K3H0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Appl1Q8K3H0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Appl1Q8K3H0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Appl1Q8K3H0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Appl1Q8K3H0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Appl1Q8K3H0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Appl1Q8K3H0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Appl1Q8K3H0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Appl1Q8K3H0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms