Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim68Q8K243 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim68Q8K243 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim68Q8K243 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim68Q8K243 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim68Q8K243 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim68Q8K243 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim68Q8K243 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim68Q8K243 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trim68Q8K243 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trim68Q8K243 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim68Q8K243 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim68Q8K243 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim68Q8K243 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim68Q8K243 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim68Q8K243 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim68Q8K243 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim68Q8K243 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim68Q8K243 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim68Q8K243 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim68Q8K243 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim68Q8K243 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trim68Q8K243 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trim68Q8K243 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim68Q8K243 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim68Q8K243 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trim68Q8K243 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim68Q8K243 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim68Q8K243 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim68Q8K243 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim68Q8K243 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim68Q8K243 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim68Q8K243 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim68Q8K243 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim68Q8K243 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Trim68Q8K243 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim68Q8K243 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim68Q8K243 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim68Q8K243 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim68Q8K243 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim68Q8K243 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim68Q8K243 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim68Q8K243 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim68Q8K243 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim68Q8K243 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim68Q8K243 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim68Q8K243 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim68Q8K243 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim68Q8K243 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim68Q8K243 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim68Q8K243 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim68Q8K243 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim68Q8K243 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim68Q8K243 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim68Q8K243 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim68Q8K243 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim68Q8K243 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim68Q8K243 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim68Q8K243 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim68Q8K243 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim68Q8K243 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim68Q8K243 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim68Q8K243 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim68Q8K243 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim68Q8K243 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim68Q8K243 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim68Q8K243 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim68Q8K243 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim68Q8K243 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim68Q8K243 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim68Q8K243 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim68Q8K243 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim68Q8K243 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trim68Q8K243 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim68Q8K243 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim68Q8K243 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim68Q8K243 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim68Q8K243 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim68Q8K243 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim68Q8K243 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim68Q8K243 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim68Q8K243 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim68Q8K243 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim68Q8K243 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim68Q8K243 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim68Q8K243 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim68Q8K243 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim68Q8K243 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim68Q8K243 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim68Q8K243 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim68Q8K243 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim68Q8K243 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim68Q8K243 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim68Q8K243 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim68Q8K243 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim68Q8K243 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim68Q8K243 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim68Q8K243 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim68Q8K243 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim68Q8K243 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms