Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ep400Q8CHI8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ep400Q8CHI8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ep400Q8CHI8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ep400Q8CHI8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ep400Q8CHI8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ep400Q8CHI8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ep400Q8CHI8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ep400Q8CHI8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ep400Q8CHI8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ep400Q8CHI8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ep400Q8CHI8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ep400Q8CHI8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ep400Q8CHI8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ep400Q8CHI8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ep400Q8CHI8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Ep400Q8CHI8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ep400Q8CHI8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ep400Q8CHI8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ep400Q8CHI8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ep400Q8CHI8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ep400Q8CHI8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ep400Q8CHI8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ep400Q8CHI8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ep400Q8CHI8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ep400Q8CHI8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ep400Q8CHI8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ep400Q8CHI8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ep400Q8CHI8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ep400Q8CHI8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ep400Q8CHI8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ep400Q8CHI8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ep400Q8CHI8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ep400Q8CHI8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ep400Q8CHI8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ep400Q8CHI8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ep400Q8CHI8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ep400Q8CHI8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Ep400Q8CHI8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ep400Q8CHI8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ep400Q8CHI8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Ep400Q8CHI8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ep400Q8CHI8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ep400Q8CHI8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Ep400Q8CHI8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ep400Q8CHI8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Ep400Q8CHI8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ep400Q8CHI8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ep400Q8CHI8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ep400Q8CHI8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ep400Q8CHI8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ep400Q8CHI8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ep400Q8CHI8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Ep400Q8CHI8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Ep400Q8CHI8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ep400Q8CHI8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ep400Q8CHI8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Ep400Q8CHI8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ep400Q8CHI8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ep400Q8CHI8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ep400Q8CHI8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ep400Q8CHI8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ep400Q8CHI8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ep400Q8CHI8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ep400Q8CHI8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ep400Q8CHI8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ep400Q8CHI8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ep400Q8CHI8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ep400Q8CHI8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ep400Q8CHI8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ep400Q8CHI8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ep400Q8CHI8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ep400Q8CHI8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ep400Q8CHI8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ep400Q8CHI8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ep400Q8CHI8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ep400Q8CHI8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Ep400Q8CHI8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ep400Q8CHI8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ep400Q8CHI8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ep400Q8CHI8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ep400Q8CHI8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ep400Q8CHI8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ep400Q8CHI8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ep400Q8CHI8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ep400Q8CHI8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ep400Q8CHI8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ep400Q8CHI8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ep400Q8CHI8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ep400Q8CHI8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ep400Q8CHI8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ep400Q8CHI8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ep400Q8CHI8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ep400Q8CHI8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ep400Q8CHI8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ep400Q8CHI8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ep400Q8CHI8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ep400Q8CHI8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ep400Q8CHI8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ep400Q8CHI8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
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