Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm9955Q8CEJ8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm9955Q8CEJ8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm9955Q8CEJ8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm9955Q8CEJ8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm9955Q8CEJ8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm9955Q8CEJ8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm9955Q8CEJ8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm9955Q8CEJ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm9955Q8CEJ8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm9955Q8CEJ8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm9955Q8CEJ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm9955Q8CEJ8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm9955Q8CEJ8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm9955Q8CEJ8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm9955Q8CEJ8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm9955Q8CEJ8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9955Q8CEJ8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9955Q8CEJ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9955Q8CEJ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9955Q8CEJ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9955Q8CEJ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm9955Q8CEJ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm9955Q8CEJ8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm9955Q8CEJ8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm9955Q8CEJ8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm9955Q8CEJ8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm9955Q8CEJ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm9955Q8CEJ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm9955Q8CEJ8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm9955Q8CEJ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm9955Q8CEJ8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm9955Q8CEJ8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm9955Q8CEJ8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm9955Q8CEJ8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm9955Q8CEJ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm9955Q8CEJ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm9955Q8CEJ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm9955Q8CEJ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm9955Q8CEJ8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm9955Q8CEJ8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9955Q8CEJ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9955Q8CEJ8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9955Q8CEJ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9955Q8CEJ8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9955Q8CEJ8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9955Q8CEJ8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9955Q8CEJ8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9955Q8CEJ8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9955Q8CEJ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm9955Q8CEJ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm9955Q8CEJ8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm9955Q8CEJ8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm9955Q8CEJ8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm9955Q8CEJ8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm9955Q8CEJ8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm9955Q8CEJ8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm9955Q8CEJ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm9955Q8CEJ8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm9955Q8CEJ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm9955Q8CEJ8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm9955Q8CEJ8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm9955Q8CEJ8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm9955Q8CEJ8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm9955Q8CEJ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm9955Q8CEJ8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm9955Q8CEJ8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm9955Q8CEJ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm9955Q8CEJ8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm9955Q8CEJ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm9955Q8CEJ8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm9955Q8CEJ8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm9955Q8CEJ8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm9955Q8CEJ8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm9955Q8CEJ8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm9955Q8CEJ8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm9955Q8CEJ8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm9955Q8CEJ8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm9955Q8CEJ8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm9955Q8CEJ8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9955Q8CEJ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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