Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
E4f1Q8CCE9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
E4f1Q8CCE9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
E4f1Q8CCE9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
E4f1Q8CCE9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
E4f1Q8CCE9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
E4f1Q8CCE9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
E4f1Q8CCE9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
E4f1Q8CCE9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
E4f1Q8CCE9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
E4f1Q8CCE9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
E4f1Q8CCE9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
E4f1Q8CCE9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
E4f1Q8CCE9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
E4f1Q8CCE9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
E4f1Q8CCE9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
E4f1Q8CCE9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
E4f1Q8CCE9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
E4f1Q8CCE9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
E4f1Q8CCE9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
E4f1Q8CCE9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
E4f1Q8CCE9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
E4f1Q8CCE9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
E4f1Q8CCE9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
E4f1Q8CCE9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
E4f1Q8CCE9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
E4f1Q8CCE9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
E4f1Q8CCE9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
E4f1Q8CCE9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
E4f1Q8CCE9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
E4f1Q8CCE9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
E4f1Q8CCE9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
E4f1Q8CCE9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
E4f1Q8CCE9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
E4f1Q8CCE9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
E4f1Q8CCE9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
E4f1Q8CCE9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
E4f1Q8CCE9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
E4f1Q8CCE9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
E4f1Q8CCE9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
E4f1Q8CCE9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
E4f1Q8CCE9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
E4f1Q8CCE9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
E4f1Q8CCE9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
E4f1Q8CCE9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
E4f1Q8CCE9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
E4f1Q8CCE9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
E4f1Q8CCE9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
E4f1Q8CCE9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
E4f1Q8CCE9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
E4f1Q8CCE9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
E4f1Q8CCE9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
E4f1Q8CCE9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
E4f1Q8CCE9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
E4f1Q8CCE9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
E4f1Q8CCE9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
E4f1Q8CCE9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
E4f1Q8CCE9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
E4f1Q8CCE9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
E4f1Q8CCE9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
E4f1Q8CCE9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
E4f1Q8CCE9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
E4f1Q8CCE9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
E4f1Q8CCE9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
E4f1Q8CCE9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
E4f1Q8CCE9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
E4f1Q8CCE9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
E4f1Q8CCE9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
E4f1Q8CCE9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
E4f1Q8CCE9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
E4f1Q8CCE9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
E4f1Q8CCE9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
E4f1Q8CCE9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
E4f1Q8CCE9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
E4f1Q8CCE9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
E4f1Q8CCE9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
E4f1Q8CCE9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
E4f1Q8CCE9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
E4f1Q8CCE9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
E4f1Q8CCE9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
E4f1Q8CCE9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
E4f1Q8CCE9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
E4f1Q8CCE9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
E4f1Q8CCE9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
E4f1Q8CCE9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
E4f1Q8CCE9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
E4f1Q8CCE9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
E4f1Q8CCE9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
E4f1Q8CCE9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
E4f1Q8CCE9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
E4f1Q8CCE9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
E4f1Q8CCE9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
E4f1Q8CCE9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
E4f1Q8CCE9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
E4f1Q8CCE9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
E4f1Q8CCE9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
E4f1Q8CCE9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
E4f1Q8CCE9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
E4f1Q8CCE9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
E4f1Q8CCE9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms