Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssuh2Q8C3L1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssuh2Q8C3L1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssuh2Q8C3L1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssuh2Q8C3L1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssuh2Q8C3L1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssuh2Q8C3L1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssuh2Q8C3L1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssuh2Q8C3L1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssuh2Q8C3L1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssuh2Q8C3L1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssuh2Q8C3L1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssuh2Q8C3L1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssuh2Q8C3L1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ssuh2Q8C3L1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssuh2Q8C3L1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssuh2Q8C3L1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssuh2Q8C3L1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssuh2Q8C3L1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssuh2Q8C3L1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssuh2Q8C3L1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssuh2Q8C3L1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssuh2Q8C3L1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssuh2Q8C3L1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssuh2Q8C3L1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ssuh2Q8C3L1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssuh2Q8C3L1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssuh2Q8C3L1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssuh2Q8C3L1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssuh2Q8C3L1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssuh2Q8C3L1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssuh2Q8C3L1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssuh2Q8C3L1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssuh2Q8C3L1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ssuh2Q8C3L1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ssuh2Q8C3L1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssuh2Q8C3L1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssuh2Q8C3L1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssuh2Q8C3L1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssuh2Q8C3L1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssuh2Q8C3L1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssuh2Q8C3L1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssuh2Q8C3L1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssuh2Q8C3L1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ssuh2Q8C3L1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssuh2Q8C3L1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssuh2Q8C3L1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssuh2Q8C3L1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssuh2Q8C3L1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssuh2Q8C3L1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssuh2Q8C3L1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssuh2Q8C3L1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssuh2Q8C3L1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssuh2Q8C3L1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssuh2Q8C3L1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssuh2Q8C3L1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssuh2Q8C3L1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ssuh2Q8C3L1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssuh2Q8C3L1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssuh2Q8C3L1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssuh2Q8C3L1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssuh2Q8C3L1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssuh2Q8C3L1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssuh2Q8C3L1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssuh2Q8C3L1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssuh2Q8C3L1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssuh2Q8C3L1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssuh2Q8C3L1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssuh2Q8C3L1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssuh2Q8C3L1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssuh2Q8C3L1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssuh2Q8C3L1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssuh2Q8C3L1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssuh2Q8C3L1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssuh2Q8C3L1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssuh2Q8C3L1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssuh2Q8C3L1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssuh2Q8C3L1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssuh2Q8C3L1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssuh2Q8C3L1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssuh2Q8C3L1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssuh2Q8C3L1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssuh2Q8C3L1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssuh2Q8C3L1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssuh2Q8C3L1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssuh2Q8C3L1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssuh2Q8C3L1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssuh2Q8C3L1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssuh2Q8C3L1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms