Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TiparpQ8C1B2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TiparpQ8C1B2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TiparpQ8C1B2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TiparpQ8C1B2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TiparpQ8C1B2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TiparpQ8C1B2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TiparpQ8C1B2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TiparpQ8C1B2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TiparpQ8C1B2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TiparpQ8C1B2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TiparpQ8C1B2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TiparpQ8C1B2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TiparpQ8C1B2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TiparpQ8C1B2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TiparpQ8C1B2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TiparpQ8C1B2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TiparpQ8C1B2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TiparpQ8C1B2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TiparpQ8C1B2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TiparpQ8C1B2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TiparpQ8C1B2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TiparpQ8C1B2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TiparpQ8C1B2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TiparpQ8C1B2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TiparpQ8C1B2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TiparpQ8C1B2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TiparpQ8C1B2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TiparpQ8C1B2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TiparpQ8C1B2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TiparpQ8C1B2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TiparpQ8C1B2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TiparpQ8C1B2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TiparpQ8C1B2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TiparpQ8C1B2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TiparpQ8C1B2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TiparpQ8C1B2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TiparpQ8C1B2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TiparpQ8C1B2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TiparpQ8C1B2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TiparpQ8C1B2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TiparpQ8C1B2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TiparpQ8C1B2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TiparpQ8C1B2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TiparpQ8C1B2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TiparpQ8C1B2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TiparpQ8C1B2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TiparpQ8C1B2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TiparpQ8C1B2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TiparpQ8C1B2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TiparpQ8C1B2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TiparpQ8C1B2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TiparpQ8C1B2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TiparpQ8C1B2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TiparpQ8C1B2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TiparpQ8C1B2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TiparpQ8C1B2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TiparpQ8C1B2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TiparpQ8C1B2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TiparpQ8C1B2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TiparpQ8C1B2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TiparpQ8C1B2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TiparpQ8C1B2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TiparpQ8C1B2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TiparpQ8C1B2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TiparpQ8C1B2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TiparpQ8C1B2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TiparpQ8C1B2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TiparpQ8C1B2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TiparpQ8C1B2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TiparpQ8C1B2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TiparpQ8C1B2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TiparpQ8C1B2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TiparpQ8C1B2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TiparpQ8C1B2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TiparpQ8C1B2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TiparpQ8C1B2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TiparpQ8C1B2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TiparpQ8C1B2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TiparpQ8C1B2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TiparpQ8C1B2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TiparpQ8C1B2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TiparpQ8C1B2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TiparpQ8C1B2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TiparpQ8C1B2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TiparpQ8C1B2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TiparpQ8C1B2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TiparpQ8C1B2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TiparpQ8C1B2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TiparpQ8C1B2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TiparpQ8C1B2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TiparpQ8C1B2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TiparpQ8C1B2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TiparpQ8C1B2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TiparpQ8C1B2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TiparpQ8C1B2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TiparpQ8C1B2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TiparpQ8C1B2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TiparpQ8C1B2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TiparpQ8C1B2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms