Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
Camsap2Q8C1B1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
Camsap2Q8C1B1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Camsap2Q8C1B1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Camsap2Q8C1B1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Camsap2Q8C1B1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Camsap2Q8C1B1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Camsap2Q8C1B1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
Camsap2Q8C1B1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Camsap2Q8C1B1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Camsap2Q8C1B1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Camsap2Q8C1B1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Camsap2Q8C1B1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Camsap2Q8C1B1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Camsap2Q8C1B1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Camsap2Q8C1B1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Camsap2Q8C1B1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Camsap2Q8C1B1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Camsap2Q8C1B1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Camsap2Q8C1B1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Camsap2Q8C1B1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Camsap2Q8C1B1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Camsap2Q8C1B1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Camsap2Q8C1B1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
Camsap2Q8C1B1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
Camsap2Q8C1B1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Camsap2Q8C1B1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Camsap2Q8C1B1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
Camsap2Q8C1B1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Camsap2Q8C1B1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Camsap2Q8C1B1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Camsap2Q8C1B1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Camsap2Q8C1B1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Camsap2Q8C1B1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Camsap2Q8C1B1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Camsap2Q8C1B1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Camsap2Q8C1B1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Camsap2Q8C1B1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Camsap2Q8C1B1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Camsap2Q8C1B1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Camsap2Q8C1B1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Camsap2Q8C1B1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Camsap2Q8C1B1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Camsap2Q8C1B1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Camsap2Q8C1B1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Camsap2Q8C1B1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Camsap2Q8C1B1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Camsap2Q8C1B1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
Camsap2Q8C1B1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Camsap2Q8C1B1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Camsap2Q8C1B1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Camsap2Q8C1B1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Camsap2Q8C1B1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Camsap2Q8C1B1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Camsap2Q8C1B1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Camsap2Q8C1B1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Camsap2Q8C1B1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Camsap2Q8C1B1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
Camsap2Q8C1B1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Camsap2Q8C1B1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Camsap2Q8C1B1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Camsap2Q8C1B1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
Camsap2Q8C1B1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Camsap2Q8C1B1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Camsap2Q8C1B1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
Camsap2Q8C1B1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
Camsap2Q8C1B1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Camsap2Q8C1B1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Camsap2Q8C1B1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Camsap2Q8C1B1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Camsap2Q8C1B1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Camsap2Q8C1B1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Camsap2Q8C1B1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
Camsap2Q8C1B1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Camsap2Q8C1B1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Camsap2Q8C1B1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Camsap2Q8C1B1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Camsap2Q8C1B1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Camsap2Q8C1B1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Camsap2Q8C1B1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Camsap2Q8C1B1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Camsap2Q8C1B1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Camsap2Q8C1B1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Camsap2Q8C1B1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Camsap2Q8C1B1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Camsap2Q8C1B1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Camsap2Q8C1B1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Camsap2Q8C1B1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
Camsap2Q8C1B1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Camsap2Q8C1B1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Camsap2Q8C1B1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Camsap2Q8C1B1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Camsap2Q8C1B1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Camsap2Q8C1B1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Camsap2Q8C1B1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Camsap2Q8C1B1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Camsap2Q8C1B1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
Camsap2Q8C1B1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Camsap2Q8C1B1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Camsap2Q8C1B1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms