Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
5730596B20RikQ8BQ08 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
5730596B20RikQ8BQ08 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
5730596B20RikQ8BQ08 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
5730596B20RikQ8BQ08 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
5730596B20RikQ8BQ08 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5730596B20RikQ8BQ08 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
5730596B20RikQ8BQ08 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5730596B20RikQ8BQ08 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
5730596B20RikQ8BQ08 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5730596B20RikQ8BQ08 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5730596B20RikQ8BQ08 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5730596B20RikQ8BQ08 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5730596B20RikQ8BQ08 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5730596B20RikQ8BQ08 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5730596B20RikQ8BQ08 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
5730596B20RikQ8BQ08 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
5730596B20RikQ8BQ08 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
5730596B20RikQ8BQ08 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
5730596B20RikQ8BQ08 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
5730596B20RikQ8BQ08 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
5730596B20RikQ8BQ08 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5730596B20RikQ8BQ08 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5730596B20RikQ8BQ08 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
5730596B20RikQ8BQ08 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
5730596B20RikQ8BQ08 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
5730596B20RikQ8BQ08 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5730596B20RikQ8BQ08 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5730596B20RikQ8BQ08 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5730596B20RikQ8BQ08 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
5730596B20RikQ8BQ08 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
5730596B20RikQ8BQ08 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5730596B20RikQ8BQ08 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5730596B20RikQ8BQ08 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms