Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI36

Jkamp, JNK1/MAPK8-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JkampQ8BI36 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JkampQ8BI36 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
JkampQ8BI36 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JkampQ8BI36 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
JkampQ8BI36 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
JkampQ8BI36 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
JkampQ8BI36 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
JkampQ8BI36 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
JkampQ8BI36 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
JkampQ8BI36 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
JkampQ8BI36 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
JkampQ8BI36 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
JkampQ8BI36 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JkampQ8BI36 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
JkampQ8BI36 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JkampQ8BI36 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JkampQ8BI36 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
JkampQ8BI36 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JkampQ8BI36 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JkampQ8BI36 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
JkampQ8BI36 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
JkampQ8BI36 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JkampQ8BI36 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JkampQ8BI36 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
JkampQ8BI36 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JkampQ8BI36 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
JkampQ8BI36 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
JkampQ8BI36 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
JkampQ8BI36 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
JkampQ8BI36 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
JkampQ8BI36 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
JkampQ8BI36 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
JkampQ8BI36 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JkampQ8BI36 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JkampQ8BI36 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JkampQ8BI36 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JkampQ8BI36 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JkampQ8BI36 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
JkampQ8BI36 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
JkampQ8BI36 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
JkampQ8BI36 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
JkampQ8BI36 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JkampQ8BI36 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
JkampQ8BI36 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
JkampQ8BI36 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JkampQ8BI36 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JkampQ8BI36 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
JkampQ8BI36 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
JkampQ8BI36 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JkampQ8BI36 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JkampQ8BI36 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JkampQ8BI36 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
JkampQ8BI36 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
JkampQ8BI36 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
JkampQ8BI36 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
JkampQ8BI36 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
JkampQ8BI36 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
JkampQ8BI36 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
JkampQ8BI36 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
JkampQ8BI36 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
JkampQ8BI36 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
JkampQ8BI36 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
JkampQ8BI36 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
JkampQ8BI36 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
JkampQ8BI36 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JkampQ8BI36 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JkampQ8BI36 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JkampQ8BI36 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
JkampQ8BI36 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JkampQ8BI36 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JkampQ8BI36 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JkampQ8BI36 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
JkampQ8BI36 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
JkampQ8BI36 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
JkampQ8BI36 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
JkampQ8BI36 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
JkampQ8BI36 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JkampQ8BI36 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
JkampQ8BI36 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
JkampQ8BI36 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
JkampQ8BI36 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
JkampQ8BI36 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
JkampQ8BI36 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
JkampQ8BI36 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
JkampQ8BI36 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
JkampQ8BI36 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JkampQ8BI36 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JkampQ8BI36 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JkampQ8BI36 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
JkampQ8BI36 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JkampQ8BI36 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23■■□□□ 1.27
JkampQ8BI36 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
JkampQ8BI36 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
JkampQ8BI36 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JkampQ8BI36 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JkampQ8BI36 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
JkampQ8BI36 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
JkampQ8BI36 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
JkampQ8BI36 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
JkampQ8BI36 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms