Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmtc4Q8BG19 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmtc4Q8BG19 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmtc4Q8BG19 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmtc4Q8BG19 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmtc4Q8BG19 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmtc4Q8BG19 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmtc4Q8BG19 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmtc4Q8BG19 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmtc4Q8BG19 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmtc4Q8BG19 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmtc4Q8BG19 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmtc4Q8BG19 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tmtc4Q8BG19 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tmtc4Q8BG19 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tmtc4Q8BG19 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tmtc4Q8BG19 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmtc4Q8BG19 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmtc4Q8BG19 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmtc4Q8BG19 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmtc4Q8BG19 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmtc4Q8BG19 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tmtc4Q8BG19 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tmtc4Q8BG19 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmtc4Q8BG19 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmtc4Q8BG19 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmtc4Q8BG19 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmtc4Q8BG19 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmtc4Q8BG19 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tmtc4Q8BG19 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmtc4Q8BG19 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmtc4Q8BG19 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmtc4Q8BG19 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmtc4Q8BG19 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmtc4Q8BG19 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmtc4Q8BG19 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmtc4Q8BG19 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmtc4Q8BG19 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmtc4Q8BG19 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tmtc4Q8BG19 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmtc4Q8BG19 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmtc4Q8BG19 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tmtc4Q8BG19 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmtc4Q8BG19 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmtc4Q8BG19 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmtc4Q8BG19 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmtc4Q8BG19 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmtc4Q8BG19 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmtc4Q8BG19 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmtc4Q8BG19 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmtc4Q8BG19 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmtc4Q8BG19 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmtc4Q8BG19 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmtc4Q8BG19 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmtc4Q8BG19 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmtc4Q8BG19 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmtc4Q8BG19 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmtc4Q8BG19 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmtc4Q8BG19 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmtc4Q8BG19 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmtc4Q8BG19 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmtc4Q8BG19 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmtc4Q8BG19 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmtc4Q8BG19 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmtc4Q8BG19 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmtc4Q8BG19 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmtc4Q8BG19 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmtc4Q8BG19 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmtc4Q8BG19 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmtc4Q8BG19 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmtc4Q8BG19 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmtc4Q8BG19 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmtc4Q8BG19 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmtc4Q8BG19 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmtc4Q8BG19 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmtc4Q8BG19 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmtc4Q8BG19 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmtc4Q8BG19 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Tmtc4Q8BG19 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmtc4Q8BG19 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmtc4Q8BG19 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmtc4Q8BG19 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmtc4Q8BG19 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmtc4Q8BG19 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmtc4Q8BG19 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmtc4Q8BG19 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmtc4Q8BG19 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmtc4Q8BG19 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmtc4Q8BG19 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmtc4Q8BG19 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmtc4Q8BG19 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmtc4Q8BG19 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmtc4Q8BG19 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmtc4Q8BG19 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmtc4Q8BG19 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmtc4Q8BG19 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmtc4Q8BG19 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmtc4Q8BG19 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmtc4Q8BG19 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmtc4Q8BG19 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms