Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-M10.4Q85ZW8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-M10.4Q85ZW8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2-M10.4Q85ZW8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-M10.4Q85ZW8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2-M10.4Q85ZW8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2-M10.4Q85ZW8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-M10.4Q85ZW8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2-M10.4Q85ZW8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2-M10.4Q85ZW8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-M10.4Q85ZW8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-M10.4Q85ZW8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-M10.4Q85ZW8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2-M10.4Q85ZW8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2-M10.4Q85ZW8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2-M10.4Q85ZW8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2-M10.4Q85ZW8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2-M10.4Q85ZW8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
H2-M10.4Q85ZW8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2-M10.4Q85ZW8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-M10.4Q85ZW8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-M10.4Q85ZW8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-M10.4Q85ZW8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-M10.4Q85ZW8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-M10.4Q85ZW8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-M10.4Q85ZW8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-M10.4Q85ZW8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-M10.4Q85ZW8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-M10.4Q85ZW8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-M10.4Q85ZW8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-M10.4Q85ZW8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-M10.4Q85ZW8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-M10.4Q85ZW8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-M10.4Q85ZW8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-M10.4Q85ZW8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-M10.4Q85ZW8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-M10.4Q85ZW8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-M10.4Q85ZW8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-M10.4Q85ZW8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-M10.4Q85ZW8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-M10.4Q85ZW8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-M10.4Q85ZW8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-M10.4Q85ZW8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-M10.4Q85ZW8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-M10.4Q85ZW8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-M10.4Q85ZW8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-M10.4Q85ZW8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-M10.4Q85ZW8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-M10.4Q85ZW8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-M10.4Q85ZW8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-M10.4Q85ZW8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-M10.4Q85ZW8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-M10.4Q85ZW8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-M10.4Q85ZW8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-M10.4Q85ZW8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-M10.4Q85ZW8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-M10.4Q85ZW8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-M10.4Q85ZW8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-M10.4Q85ZW8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-M10.4Q85ZW8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-M10.4Q85ZW8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-M10.4Q85ZW8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-M10.4Q85ZW8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-M10.4Q85ZW8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-M10.4Q85ZW8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-M10.4Q85ZW8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M10.4Q85ZW8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M10.4Q85ZW8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-M10.4Q85ZW8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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