Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
H2-M10.4Q85ZW8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
H2-M10.4Q85ZW8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
H2-M10.4Q85ZW8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
H2-M10.4Q85ZW8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H2-M10.4Q85ZW8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
H2-M10.4Q85ZW8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H2-M10.4Q85ZW8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H2-M10.4Q85ZW8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
H2-M10.4Q85ZW8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H2-M10.4Q85ZW8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H2-M10.4Q85ZW8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
H2-M10.4Q85ZW8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
H2-M10.4Q85ZW8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H2-M10.4Q85ZW8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
H2-M10.4Q85ZW8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H2-M10.4Q85ZW8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H2-M10.4Q85ZW8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
H2-M10.4Q85ZW8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
H2-M10.4Q85ZW8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H2-M10.4Q85ZW8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H2-M10.4Q85ZW8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2-M10.4Q85ZW8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2-M10.4Q85ZW8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2-M10.4Q85ZW8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2-M10.4Q85ZW8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2-M10.4Q85ZW8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2-M10.4Q85ZW8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2-M10.4Q85ZW8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
H2-M10.4Q85ZW8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2-M10.4Q85ZW8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2-M10.4Q85ZW8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2-M10.4Q85ZW8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2-M10.4Q85ZW8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2-M10.4Q85ZW8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2-M10.4Q85ZW8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2-M10.4Q85ZW8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
H2-M10.4Q85ZW8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2-M10.4Q85ZW8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2-M10.4Q85ZW8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
H2-M10.4Q85ZW8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2-M10.4Q85ZW8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2-M10.4Q85ZW8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2-M10.4Q85ZW8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2-M10.4Q85ZW8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2-M10.4Q85ZW8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2-M10.4Q85ZW8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2-M10.4Q85ZW8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2-M10.4Q85ZW8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
H2-M10.4Q85ZW8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-M10.4Q85ZW8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
H2-M10.4Q85ZW8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-M10.4Q85ZW8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-M10.4Q85ZW8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-M10.4Q85ZW8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
H2-M10.4Q85ZW8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-M10.4Q85ZW8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-M10.4Q85ZW8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-M10.4Q85ZW8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2-M10.4Q85ZW8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2-M10.4Q85ZW8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2-M10.4Q85ZW8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-M10.4Q85ZW8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-M10.4Q85ZW8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
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