Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc28Q80XJ3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc28Q80XJ3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc28Q80XJ3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc28Q80XJ3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc28Q80XJ3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc28Q80XJ3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc28Q80XJ3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc28Q80XJ3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc28Q80XJ3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc28Q80XJ3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc28Q80XJ3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc28Q80XJ3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc28Q80XJ3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc28Q80XJ3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc28Q80XJ3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc28Q80XJ3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc28Q80XJ3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc28Q80XJ3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc28Q80XJ3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc28Q80XJ3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc28Q80XJ3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ttc28Q80XJ3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc28Q80XJ3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc28Q80XJ3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc28Q80XJ3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc28Q80XJ3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttc28Q80XJ3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttc28Q80XJ3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttc28Q80XJ3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc28Q80XJ3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc28Q80XJ3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc28Q80XJ3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc28Q80XJ3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc28Q80XJ3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc28Q80XJ3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc28Q80XJ3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc28Q80XJ3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc28Q80XJ3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc28Q80XJ3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc28Q80XJ3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc28Q80XJ3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc28Q80XJ3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc28Q80XJ3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc28Q80XJ3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc28Q80XJ3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc28Q80XJ3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc28Q80XJ3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc28Q80XJ3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc28Q80XJ3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc28Q80XJ3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc28Q80XJ3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc28Q80XJ3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc28Q80XJ3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc28Q80XJ3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc28Q80XJ3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc28Q80XJ3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc28Q80XJ3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc28Q80XJ3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc28Q80XJ3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc28Q80XJ3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc28Q80XJ3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Ttc28Q80XJ3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc28Q80XJ3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc28Q80XJ3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc28Q80XJ3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc28Q80XJ3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc28Q80XJ3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc28Q80XJ3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc28Q80XJ3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc28Q80XJ3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc28Q80XJ3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc28Q80XJ3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc28Q80XJ3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc28Q80XJ3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc28Q80XJ3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc28Q80XJ3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc28Q80XJ3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc28Q80XJ3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc28Q80XJ3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc28Q80XJ3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc28Q80XJ3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc28Q80XJ3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc28Q80XJ3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc28Q80XJ3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc28Q80XJ3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc28Q80XJ3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc28Q80XJ3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc28Q80XJ3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc28Q80XJ3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc28Q80XJ3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc28Q80XJ3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc28Q80XJ3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc28Q80XJ3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc28Q80XJ3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc28Q80XJ3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc28Q80XJ3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc28Q80XJ3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc28Q80XJ3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc28Q80XJ3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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