Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sox11Q7M6Y2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sox11Q7M6Y2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sox11Q7M6Y2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sox11Q7M6Y2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sox11Q7M6Y2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sox11Q7M6Y2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sox11Q7M6Y2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sox11Q7M6Y2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sox11Q7M6Y2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sox11Q7M6Y2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sox11Q7M6Y2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sox11Q7M6Y2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sox11Q7M6Y2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sox11Q7M6Y2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sox11Q7M6Y2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sox11Q7M6Y2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sox11Q7M6Y2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sox11Q7M6Y2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Sox11Q7M6Y2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sox11Q7M6Y2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sox11Q7M6Y2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sox11Q7M6Y2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Sox11Q7M6Y2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sox11Q7M6Y2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sox11Q7M6Y2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sox11Q7M6Y2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sox11Q7M6Y2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sox11Q7M6Y2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sox11Q7M6Y2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sox11Q7M6Y2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sox11Q7M6Y2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sox11Q7M6Y2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sox11Q7M6Y2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sox11Q7M6Y2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sox11Q7M6Y2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sox11Q7M6Y2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sox11Q7M6Y2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sox11Q7M6Y2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sox11Q7M6Y2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sox11Q7M6Y2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Sox11Q7M6Y2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sox11Q7M6Y2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sox11Q7M6Y2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sox11Q7M6Y2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sox11Q7M6Y2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sox11Q7M6Y2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sox11Q7M6Y2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sox11Q7M6Y2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Sox11Q7M6Y2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sox11Q7M6Y2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sox11Q7M6Y2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Sox11Q7M6Y2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sox11Q7M6Y2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox11Q7M6Y2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox11Q7M6Y2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sox11Q7M6Y2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sox11Q7M6Y2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sox11Q7M6Y2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sox11Q7M6Y2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sox11Q7M6Y2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sox11Q7M6Y2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox11Q7M6Y2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox11Q7M6Y2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sox11Q7M6Y2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox11Q7M6Y2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sox11Q7M6Y2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sox11Q7M6Y2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sox11Q7M6Y2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sox11Q7M6Y2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox11Q7M6Y2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox11Q7M6Y2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sox11Q7M6Y2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sox11Q7M6Y2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sox11Q7M6Y2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox11Q7M6Y2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox11Q7M6Y2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox11Q7M6Y2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox11Q7M6Y2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sox11Q7M6Y2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sox11Q7M6Y2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox11Q7M6Y2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox11Q7M6Y2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox11Q7M6Y2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox11Q7M6Y2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox11Q7M6Y2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox11Q7M6Y2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox11Q7M6Y2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox11Q7M6Y2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sox11Q7M6Y2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Sox11Q7M6Y2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sox11Q7M6Y2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sox11Q7M6Y2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sox11Q7M6Y2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sox11Q7M6Y2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sox11Q7M6Y2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox11Q7M6Y2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox11Q7M6Y2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox11Q7M6Y2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox11Q7M6Y2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms