Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CenpeQ6RT24 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CenpeQ6RT24 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CenpeQ6RT24 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CenpeQ6RT24 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CenpeQ6RT24 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CenpeQ6RT24 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CenpeQ6RT24 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpeQ6RT24 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpeQ6RT24 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CenpeQ6RT24 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpeQ6RT24 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpeQ6RT24 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpeQ6RT24 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CenpeQ6RT24 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpeQ6RT24 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpeQ6RT24 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpeQ6RT24 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpeQ6RT24 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpeQ6RT24 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpeQ6RT24 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpeQ6RT24 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CenpeQ6RT24 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CenpeQ6RT24 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CenpeQ6RT24 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CenpeQ6RT24 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CenpeQ6RT24 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CenpeQ6RT24 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CenpeQ6RT24 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CenpeQ6RT24 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CenpeQ6RT24 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CenpeQ6RT24 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CenpeQ6RT24 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CenpeQ6RT24 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CenpeQ6RT24 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CenpeQ6RT24 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CenpeQ6RT24 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpeQ6RT24 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CenpeQ6RT24 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CenpeQ6RT24 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CenpeQ6RT24 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CenpeQ6RT24 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CenpeQ6RT24 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CenpeQ6RT24 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CenpeQ6RT24 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CenpeQ6RT24 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CenpeQ6RT24 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CenpeQ6RT24 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CenpeQ6RT24 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CenpeQ6RT24 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CenpeQ6RT24 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CenpeQ6RT24 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CenpeQ6RT24 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CenpeQ6RT24 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CenpeQ6RT24 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CenpeQ6RT24 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpeQ6RT24 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpeQ6RT24 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CenpeQ6RT24 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpeQ6RT24 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpeQ6RT24 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpeQ6RT24 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpeQ6RT24 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CenpeQ6RT24 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CenpeQ6RT24 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CenpeQ6RT24 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CenpeQ6RT24 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CenpeQ6RT24 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CenpeQ6RT24 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CenpeQ6RT24 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CenpeQ6RT24 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CenpeQ6RT24 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CenpeQ6RT24 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpeQ6RT24 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpeQ6RT24 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpeQ6RT24 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpeQ6RT24 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpeQ6RT24 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpeQ6RT24 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CenpeQ6RT24 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CenpeQ6RT24 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CenpeQ6RT24 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpeQ6RT24 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpeQ6RT24 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpeQ6RT24 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CenpeQ6RT24 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CenpeQ6RT24 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CenpeQ6RT24 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpeQ6RT24 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpeQ6RT24 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpeQ6RT24 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpeQ6RT24 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpeQ6RT24 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpeQ6RT24 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpeQ6RT24 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpeQ6RT24 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpeQ6RT24 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpeQ6RT24 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpeQ6RT24 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpeQ6RT24 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms