Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GcsamQ6RFH4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GcsamQ6RFH4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GcsamQ6RFH4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GcsamQ6RFH4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GcsamQ6RFH4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GcsamQ6RFH4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GcsamQ6RFH4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GcsamQ6RFH4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GcsamQ6RFH4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GcsamQ6RFH4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GcsamQ6RFH4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GcsamQ6RFH4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GcsamQ6RFH4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GcsamQ6RFH4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GcsamQ6RFH4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GcsamQ6RFH4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GcsamQ6RFH4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GcsamQ6RFH4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GcsamQ6RFH4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GcsamQ6RFH4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GcsamQ6RFH4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GcsamQ6RFH4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GcsamQ6RFH4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GcsamQ6RFH4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GcsamQ6RFH4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GcsamQ6RFH4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GcsamQ6RFH4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GcsamQ6RFH4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GcsamQ6RFH4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GcsamQ6RFH4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GcsamQ6RFH4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GcsamQ6RFH4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GcsamQ6RFH4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GcsamQ6RFH4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GcsamQ6RFH4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GcsamQ6RFH4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GcsamQ6RFH4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GcsamQ6RFH4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GcsamQ6RFH4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GcsamQ6RFH4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GcsamQ6RFH4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GcsamQ6RFH4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GcsamQ6RFH4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GcsamQ6RFH4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GcsamQ6RFH4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GcsamQ6RFH4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GcsamQ6RFH4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GcsamQ6RFH4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GcsamQ6RFH4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GcsamQ6RFH4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GcsamQ6RFH4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GcsamQ6RFH4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GcsamQ6RFH4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GcsamQ6RFH4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GcsamQ6RFH4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GcsamQ6RFH4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GcsamQ6RFH4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GcsamQ6RFH4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GcsamQ6RFH4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GcsamQ6RFH4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GcsamQ6RFH4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GcsamQ6RFH4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GcsamQ6RFH4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GcsamQ6RFH4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GcsamQ6RFH4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GcsamQ6RFH4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GcsamQ6RFH4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GcsamQ6RFH4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GcsamQ6RFH4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GcsamQ6RFH4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GcsamQ6RFH4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GcsamQ6RFH4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GcsamQ6RFH4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GcsamQ6RFH4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GcsamQ6RFH4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GcsamQ6RFH4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GcsamQ6RFH4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GcsamQ6RFH4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GcsamQ6RFH4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GcsamQ6RFH4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GcsamQ6RFH4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GcsamQ6RFH4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GcsamQ6RFH4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GcsamQ6RFH4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GcsamQ6RFH4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GcsamQ6RFH4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GcsamQ6RFH4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GcsamQ6RFH4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GcsamQ6RFH4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GcsamQ6RFH4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms