Protein–RNA interactions for Protein: Q6JPI3

Med13l, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, mousemouse

Predictions only

Length 2,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13lQ6JPI3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Med13lQ6JPI3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Med13lQ6JPI3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Med13lQ6JPI3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Med13lQ6JPI3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Med13lQ6JPI3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Med13lQ6JPI3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Med13lQ6JPI3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Med13lQ6JPI3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Med13lQ6JPI3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Med13lQ6JPI3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Med13lQ6JPI3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Med13lQ6JPI3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Med13lQ6JPI3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Med13lQ6JPI3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Med13lQ6JPI3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Med13lQ6JPI3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Med13lQ6JPI3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Med13lQ6JPI3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Med13lQ6JPI3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Med13lQ6JPI3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Med13lQ6JPI3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Med13lQ6JPI3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Med13lQ6JPI3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Med13lQ6JPI3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Med13lQ6JPI3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Med13lQ6JPI3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Med13lQ6JPI3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Med13lQ6JPI3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Med13lQ6JPI3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Med13lQ6JPI3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Med13lQ6JPI3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Med13lQ6JPI3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Med13lQ6JPI3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Med13lQ6JPI3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Med13lQ6JPI3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Med13lQ6JPI3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Med13lQ6JPI3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Med13lQ6JPI3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Med13lQ6JPI3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Med13lQ6JPI3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Med13lQ6JPI3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Med13lQ6JPI3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Med13lQ6JPI3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Med13lQ6JPI3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Med13lQ6JPI3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Med13lQ6JPI3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Med13lQ6JPI3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Med13lQ6JPI3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Med13lQ6JPI3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Med13lQ6JPI3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Med13lQ6JPI3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Med13lQ6JPI3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Med13lQ6JPI3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Med13lQ6JPI3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Med13lQ6JPI3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Med13lQ6JPI3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Med13lQ6JPI3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Med13lQ6JPI3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Med13lQ6JPI3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Med13lQ6JPI3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Med13lQ6JPI3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Med13lQ6JPI3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Med13lQ6JPI3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Med13lQ6JPI3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Med13lQ6JPI3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Med13lQ6JPI3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Med13lQ6JPI3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Med13lQ6JPI3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Med13lQ6JPI3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Med13lQ6JPI3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Med13lQ6JPI3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Med13lQ6JPI3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Med13lQ6JPI3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Med13lQ6JPI3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Med13lQ6JPI3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Med13lQ6JPI3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Med13lQ6JPI3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Med13lQ6JPI3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Med13lQ6JPI3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Med13lQ6JPI3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Med13lQ6JPI3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Med13lQ6JPI3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med13lQ6JPI3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med13lQ6JPI3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Med13lQ6JPI3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Med13lQ6JPI3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med13lQ6JPI3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med13lQ6JPI3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med13lQ6JPI3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med13lQ6JPI3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med13lQ6JPI3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Med13lQ6JPI3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Med13lQ6JPI3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med13lQ6JPI3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med13lQ6JPI3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med13lQ6JPI3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med13lQ6JPI3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med13lQ6JPI3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med13lQ6JPI3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms