Protein–RNA interactions for Protein: Q63959

Kcnc3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc3Q63959 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcnc3Q63959 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcnc3Q63959 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcnc3Q63959 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcnc3Q63959 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcnc3Q63959 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcnc3Q63959 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnc3Q63959 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnc3Q63959 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnc3Q63959 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Kcnc3Q63959 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnc3Q63959 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnc3Q63959 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnc3Q63959 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnc3Q63959 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcnc3Q63959 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnc3Q63959 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnc3Q63959 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnc3Q63959 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnc3Q63959 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnc3Q63959 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnc3Q63959 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnc3Q63959 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnc3Q63959 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnc3Q63959 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnc3Q63959 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnc3Q63959 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcnc3Q63959 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnc3Q63959 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnc3Q63959 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnc3Q63959 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnc3Q63959 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnc3Q63959 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnc3Q63959 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnc3Q63959 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnc3Q63959 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnc3Q63959 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnc3Q63959 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnc3Q63959 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnc3Q63959 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnc3Q63959 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnc3Q63959 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnc3Q63959 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnc3Q63959 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnc3Q63959 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnc3Q63959 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnc3Q63959 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnc3Q63959 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnc3Q63959 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnc3Q63959 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnc3Q63959 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnc3Q63959 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcnc3Q63959 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnc3Q63959 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnc3Q63959 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnc3Q63959 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnc3Q63959 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnc3Q63959 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnc3Q63959 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnc3Q63959 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnc3Q63959 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnc3Q63959 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnc3Q63959 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnc3Q63959 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnc3Q63959 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnc3Q63959 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnc3Q63959 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnc3Q63959 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnc3Q63959 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnc3Q63959 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnc3Q63959 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnc3Q63959 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnc3Q63959 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnc3Q63959 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnc3Q63959 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnc3Q63959 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnc3Q63959 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnc3Q63959 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnc3Q63959 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnc3Q63959 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnc3Q63959 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kcnc3Q63959 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnc3Q63959 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnc3Q63959 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnc3Q63959 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnc3Q63959 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnc3Q63959 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnc3Q63959 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnc3Q63959 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnc3Q63959 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnc3Q63959 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnc3Q63959 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnc3Q63959 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnc3Q63959 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnc3Q63959 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnc3Q63959 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnc3Q63959 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnc3Q63959 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnc3Q63959 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnc3Q63959 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms