Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Pik3c2aQ61194 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Pik3c2aQ61194 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Pik3c2aQ61194 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Pik3c2aQ61194 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Pik3c2aQ61194 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Pik3c2aQ61194 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Pik3c2aQ61194 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Pik3c2aQ61194 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Pik3c2aQ61194 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Pik3c2aQ61194 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Pik3c2aQ61194 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Pik3c2aQ61194 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Pik3c2aQ61194 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Pik3c2aQ61194 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Pik3c2aQ61194 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Pik3c2aQ61194 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Pik3c2aQ61194 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Pik3c2aQ61194 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Pik3c2aQ61194 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Pik3c2aQ61194 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Pik3c2aQ61194 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Pik3c2aQ61194 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Pik3c2aQ61194 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Pik3c2aQ61194 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Pik3c2aQ61194 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Pik3c2aQ61194 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Pik3c2aQ61194 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Pik3c2aQ61194 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Pik3c2aQ61194 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Pik3c2aQ61194 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
Pik3c2aQ61194 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Pik3c2aQ61194 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Pik3c2aQ61194 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Pik3c2aQ61194 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Pik3c2aQ61194 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Pik3c2aQ61194 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Pik3c2aQ61194 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Pik3c2aQ61194 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Pik3c2aQ61194 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Pik3c2aQ61194 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Pik3c2aQ61194 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Pik3c2aQ61194 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Pik3c2aQ61194 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Pik3c2aQ61194 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Pik3c2aQ61194 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Pik3c2aQ61194 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Pik3c2aQ61194 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Pik3c2aQ61194 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Pik3c2aQ61194 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Pik3c2aQ61194 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Pik3c2aQ61194 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Pik3c2aQ61194 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Pik3c2aQ61194 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Pik3c2aQ61194 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Pik3c2aQ61194 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Pik3c2aQ61194 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Pik3c2aQ61194 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Pik3c2aQ61194 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Pik3c2aQ61194 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Pik3c2aQ61194 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Pik3c2aQ61194 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Pik3c2aQ61194 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Pik3c2aQ61194 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Pik3c2aQ61194 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Pik3c2aQ61194 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Pik3c2aQ61194 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Pik3c2aQ61194 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Pik3c2aQ61194 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Pik3c2aQ61194 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
Pik3c2aQ61194 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Pik3c2aQ61194 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Pik3c2aQ61194 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Pik3c2aQ61194 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Pik3c2aQ61194 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Pik3c2aQ61194 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Pik3c2aQ61194 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Pik3c2aQ61194 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Pik3c2aQ61194 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Pik3c2aQ61194 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Pik3c2aQ61194 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Pik3c2aQ61194 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Pik3c2aQ61194 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Pik3c2aQ61194 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Pik3c2aQ61194 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Pik3c2aQ61194 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Pik3c2aQ61194 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Pik3c2aQ61194 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Pik3c2aQ61194 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Pik3c2aQ61194 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Pik3c2aQ61194 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Pik3c2aQ61194 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Pik3c2aQ61194 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Pik3c2aQ61194 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Pik3c2aQ61194 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Pik3c2aQ61194 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Pik3c2aQ61194 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Pik3c2aQ61194 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Pik3c2aQ61194 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Pik3c2aQ61194 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 929.9 ms