Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Mkrn3Q60764 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Mkrn3Q60764 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Mkrn3Q60764 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Mkrn3Q60764 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Mkrn3Q60764 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Mkrn3Q60764 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Mkrn3Q60764 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Mkrn3Q60764 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Mkrn3Q60764 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Mkrn3Q60764 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Mkrn3Q60764 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Mkrn3Q60764 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Mkrn3Q60764 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Mkrn3Q60764 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Mkrn3Q60764 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Mkrn3Q60764 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Mkrn3Q60764 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Mkrn3Q60764 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Mkrn3Q60764 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Mkrn3Q60764 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Mkrn3Q60764 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Mkrn3Q60764 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Mkrn3Q60764 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Mkrn3Q60764 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Mkrn3Q60764 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Mkrn3Q60764 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Mkrn3Q60764 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Mkrn3Q60764 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Mkrn3Q60764 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Mkrn3Q60764 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Mkrn3Q60764 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Mkrn3Q60764 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Mkrn3Q60764 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Mkrn3Q60764 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Mkrn3Q60764 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Mkrn3Q60764 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Mkrn3Q60764 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Mkrn3Q60764 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Mkrn3Q60764 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Mkrn3Q60764 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Mkrn3Q60764 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Mkrn3Q60764 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Mkrn3Q60764 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Mkrn3Q60764 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Mkrn3Q60764 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mkrn3Q60764 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Mkrn3Q60764 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Mkrn3Q60764 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Mkrn3Q60764 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mkrn3Q60764 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mkrn3Q60764 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Mkrn3Q60764 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Mkrn3Q60764 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Mkrn3Q60764 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Mkrn3Q60764 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Mkrn3Q60764 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Mkrn3Q60764 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Mkrn3Q60764 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Mkrn3Q60764 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Mkrn3Q60764 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Mkrn3Q60764 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Mkrn3Q60764 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Mkrn3Q60764 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Mkrn3Q60764 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Mkrn3Q60764 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Mkrn3Q60764 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Mkrn3Q60764 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Mkrn3Q60764 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Mkrn3Q60764 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Mkrn3Q60764 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Mkrn3Q60764 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Mkrn3Q60764 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Mkrn3Q60764 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mkrn3Q60764 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mkrn3Q60764 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mkrn3Q60764 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mkrn3Q60764 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mkrn3Q60764 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mkrn3Q60764 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mkrn3Q60764 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mkrn3Q60764 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mkrn3Q60764 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mkrn3Q60764 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Mkrn3Q60764 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mkrn3Q60764 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mkrn3Q60764 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mkrn3Q60764 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mkrn3Q60764 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mkrn3Q60764 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mkrn3Q60764 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mkrn3Q60764 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mkrn3Q60764 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mkrn3Q60764 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Mkrn3Q60764 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mkrn3Q60764 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mkrn3Q60764 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mkrn3Q60764 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mkrn3Q60764 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mkrn3Q60764 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms