Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3558Q5FWC9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm3558Q5FWC9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm3558Q5FWC9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm3558Q5FWC9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3558Q5FWC9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3558Q5FWC9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3558Q5FWC9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3558Q5FWC9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3558Q5FWC9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3558Q5FWC9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3558Q5FWC9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3558Q5FWC9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3558Q5FWC9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3558Q5FWC9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3558Q5FWC9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3558Q5FWC9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3558Q5FWC9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm3558Q5FWC9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm3558Q5FWC9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm3558Q5FWC9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm3558Q5FWC9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm3558Q5FWC9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm3558Q5FWC9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm3558Q5FWC9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3558Q5FWC9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm3558Q5FWC9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm3558Q5FWC9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm3558Q5FWC9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gm3558Q5FWC9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm3558Q5FWC9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm3558Q5FWC9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm3558Q5FWC9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm3558Q5FWC9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm3558Q5FWC9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm3558Q5FWC9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm3558Q5FWC9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3558Q5FWC9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3558Q5FWC9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3558Q5FWC9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm3558Q5FWC9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3558Q5FWC9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3558Q5FWC9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3558Q5FWC9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3558Q5FWC9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3558Q5FWC9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3558Q5FWC9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3558Q5FWC9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3558Q5FWC9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3558Q5FWC9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3558Q5FWC9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm3558Q5FWC9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm3558Q5FWC9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3558Q5FWC9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3558Q5FWC9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm3558Q5FWC9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm3558Q5FWC9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3558Q5FWC9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm3558Q5FWC9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3558Q5FWC9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3558Q5FWC9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm3558Q5FWC9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3558Q5FWC9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3558Q5FWC9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3558Q5FWC9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3558Q5FWC9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3558Q5FWC9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3558Q5FWC9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3558Q5FWC9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3558Q5FWC9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3558Q5FWC9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3558Q5FWC9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3558Q5FWC9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3558Q5FWC9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3558Q5FWC9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3558Q5FWC9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3558Q5FWC9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3558Q5FWC9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3558Q5FWC9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3558Q5FWC9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3558Q5FWC9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3558Q5FWC9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3558Q5FWC9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3558Q5FWC9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3558Q5FWC9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3558Q5FWC9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3558Q5FWC9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3558Q5FWC9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3558Q5FWC9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3558Q5FWC9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3558Q5FWC9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3558Q5FWC9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3558Q5FWC9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm3558Q5FWC9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3558Q5FWC9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3558Q5FWC9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3558Q5FWC9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3558Q5FWC9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3558Q5FWC9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3558Q5FWC9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
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