Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam208bQ5DTT3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam208bQ5DTT3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam208bQ5DTT3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam208bQ5DTT3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam208bQ5DTT3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam208bQ5DTT3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam208bQ5DTT3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam208bQ5DTT3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam208bQ5DTT3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam208bQ5DTT3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam208bQ5DTT3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam208bQ5DTT3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam208bQ5DTT3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam208bQ5DTT3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam208bQ5DTT3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam208bQ5DTT3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam208bQ5DTT3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam208bQ5DTT3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam208bQ5DTT3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam208bQ5DTT3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam208bQ5DTT3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam208bQ5DTT3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam208bQ5DTT3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam208bQ5DTT3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam208bQ5DTT3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam208bQ5DTT3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam208bQ5DTT3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam208bQ5DTT3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam208bQ5DTT3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam208bQ5DTT3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam208bQ5DTT3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam208bQ5DTT3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam208bQ5DTT3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam208bQ5DTT3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam208bQ5DTT3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam208bQ5DTT3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam208bQ5DTT3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam208bQ5DTT3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam208bQ5DTT3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam208bQ5DTT3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam208bQ5DTT3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam208bQ5DTT3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam208bQ5DTT3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam208bQ5DTT3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam208bQ5DTT3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam208bQ5DTT3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam208bQ5DTT3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam208bQ5DTT3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam208bQ5DTT3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam208bQ5DTT3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam208bQ5DTT3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam208bQ5DTT3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam208bQ5DTT3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam208bQ5DTT3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam208bQ5DTT3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam208bQ5DTT3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam208bQ5DTT3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam208bQ5DTT3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam208bQ5DTT3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam208bQ5DTT3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam208bQ5DTT3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam208bQ5DTT3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam208bQ5DTT3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam208bQ5DTT3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam208bQ5DTT3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam208bQ5DTT3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam208bQ5DTT3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam208bQ5DTT3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam208bQ5DTT3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam208bQ5DTT3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam208bQ5DTT3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam208bQ5DTT3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam208bQ5DTT3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam208bQ5DTT3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam208bQ5DTT3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam208bQ5DTT3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam208bQ5DTT3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam208bQ5DTT3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam208bQ5DTT3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam208bQ5DTT3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam208bQ5DTT3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Fam208bQ5DTT3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam208bQ5DTT3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam208bQ5DTT3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam208bQ5DTT3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam208bQ5DTT3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam208bQ5DTT3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam208bQ5DTT3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam208bQ5DTT3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam208bQ5DTT3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam208bQ5DTT3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam208bQ5DTT3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam208bQ5DTT3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam208bQ5DTT3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam208bQ5DTT3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam208bQ5DTT3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam208bQ5DTT3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam208bQ5DTT3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam208bQ5DTT3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
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