Protein–RNA interactions for Protein: Q497N6

Cep295nl, CEP295 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep295nlQ497N6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cep295nlQ497N6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cep295nlQ497N6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cep295nlQ497N6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cep295nlQ497N6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep295nlQ497N6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cep295nlQ497N6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cep295nlQ497N6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cep295nlQ497N6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep295nlQ497N6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cep295nlQ497N6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep295nlQ497N6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep295nlQ497N6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep295nlQ497N6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep295nlQ497N6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cep295nlQ497N6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cep295nlQ497N6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cep295nlQ497N6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cep295nlQ497N6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cep295nlQ497N6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep295nlQ497N6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cep295nlQ497N6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cep295nlQ497N6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cep295nlQ497N6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep295nlQ497N6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep295nlQ497N6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep295nlQ497N6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cep295nlQ497N6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cep295nlQ497N6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cep295nlQ497N6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep295nlQ497N6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep295nlQ497N6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cep295nlQ497N6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Cep295nlQ497N6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cep295nlQ497N6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep295nlQ497N6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep295nlQ497N6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep295nlQ497N6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep295nlQ497N6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cep295nlQ497N6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep295nlQ497N6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cep295nlQ497N6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep295nlQ497N6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep295nlQ497N6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep295nlQ497N6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep295nlQ497N6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cep295nlQ497N6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cep295nlQ497N6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cep295nlQ497N6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep295nlQ497N6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep295nlQ497N6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cep295nlQ497N6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cep295nlQ497N6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cep295nlQ497N6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cep295nlQ497N6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cep295nlQ497N6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cep295nlQ497N6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cep295nlQ497N6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cep295nlQ497N6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep295nlQ497N6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cep295nlQ497N6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cep295nlQ497N6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cep295nlQ497N6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cep295nlQ497N6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cep295nlQ497N6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep295nlQ497N6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cep295nlQ497N6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cep295nlQ497N6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cep295nlQ497N6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep295nlQ497N6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep295nlQ497N6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cep295nlQ497N6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cep295nlQ497N6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep295nlQ497N6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cep295nlQ497N6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cep295nlQ497N6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cep295nlQ497N6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Cep295nlQ497N6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Cep295nlQ497N6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cep295nlQ497N6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cep295nlQ497N6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cep295nlQ497N6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep295nlQ497N6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cep295nlQ497N6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cep295nlQ497N6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cep295nlQ497N6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cep295nlQ497N6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cep295nlQ497N6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cep295nlQ497N6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cep295nlQ497N6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cep295nlQ497N6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep295nlQ497N6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cep295nlQ497N6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cep295nlQ497N6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cep295nlQ497N6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cep295nlQ497N6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cep295nlQ497N6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cep295nlQ497N6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cep295nlQ497N6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cep295nlQ497N6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms