Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
4933416C03RikQ3V063 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
4933416C03RikQ3V063 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
4933416C03RikQ3V063 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
4933416C03RikQ3V063 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
4933416C03RikQ3V063 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
4933416C03RikQ3V063 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
4933416C03RikQ3V063 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
4933416C03RikQ3V063 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
4933416C03RikQ3V063 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
4933416C03RikQ3V063 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
4933416C03RikQ3V063 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
4933416C03RikQ3V063 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
4933416C03RikQ3V063 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
4933416C03RikQ3V063 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
4933416C03RikQ3V063 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
4933416C03RikQ3V063 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
4933416C03RikQ3V063 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
4933416C03RikQ3V063 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
4933416C03RikQ3V063 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
4933416C03RikQ3V063 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
4933416C03RikQ3V063 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
4933416C03RikQ3V063 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
4933416C03RikQ3V063 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
4933416C03RikQ3V063 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
4933416C03RikQ3V063 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
4933416C03RikQ3V063 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
4933416C03RikQ3V063 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
4933416C03RikQ3V063 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
4933416C03RikQ3V063 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
4933416C03RikQ3V063 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
4933416C03RikQ3V063 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
4933416C03RikQ3V063 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
4933416C03RikQ3V063 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
4933416C03RikQ3V063 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
4933416C03RikQ3V063 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
4933416C03RikQ3V063 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
4933416C03RikQ3V063 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
4933416C03RikQ3V063 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
4933416C03RikQ3V063 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
4933416C03RikQ3V063 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
4933416C03RikQ3V063 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
4933416C03RikQ3V063 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
4933416C03RikQ3V063 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
4933416C03RikQ3V063 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
4933416C03RikQ3V063 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
4933416C03RikQ3V063 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
4933416C03RikQ3V063 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
4933416C03RikQ3V063 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
4933416C03RikQ3V063 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
4933416C03RikQ3V063 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
4933416C03RikQ3V063 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
4933416C03RikQ3V063 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
4933416C03RikQ3V063 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
4933416C03RikQ3V063 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
4933416C03RikQ3V063 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
4933416C03RikQ3V063 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
4933416C03RikQ3V063 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
4933416C03RikQ3V063 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
4933416C03RikQ3V063 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
4933416C03RikQ3V063 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
4933416C03RikQ3V063 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
4933416C03RikQ3V063 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
4933416C03RikQ3V063 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
4933416C03RikQ3V063 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
4933416C03RikQ3V063 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
4933416C03RikQ3V063 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
4933416C03RikQ3V063 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
4933416C03RikQ3V063 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
4933416C03RikQ3V063 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
4933416C03RikQ3V063 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
4933416C03RikQ3V063 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
4933416C03RikQ3V063 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
4933416C03RikQ3V063 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
4933416C03RikQ3V063 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
4933416C03RikQ3V063 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
4933416C03RikQ3V063 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
4933416C03RikQ3V063 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
4933416C03RikQ3V063 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
4933416C03RikQ3V063 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
4933416C03RikQ3V063 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
4933416C03RikQ3V063 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
4933416C03RikQ3V063 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
4933416C03RikQ3V063 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
4933416C03RikQ3V063 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
4933416C03RikQ3V063 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
4933416C03RikQ3V063 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
4933416C03RikQ3V063 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
4933416C03RikQ3V063 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
4933416C03RikQ3V063 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
4933416C03RikQ3V063 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
4933416C03RikQ3V063 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
4933416C03RikQ3V063 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
4933416C03RikQ3V063 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
4933416C03RikQ3V063 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
4933416C03RikQ3V063 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
4933416C03RikQ3V063 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
4933416C03RikQ3V063 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
4933416C03RikQ3V063 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms