Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rnpc3Q3UZ01 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Rnpc3Q3UZ01 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rnpc3Q3UZ01 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Rnpc3Q3UZ01 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rnpc3Q3UZ01 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rnpc3Q3UZ01 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rnpc3Q3UZ01 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rnpc3Q3UZ01 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rnpc3Q3UZ01 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rnpc3Q3UZ01 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rnpc3Q3UZ01 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rnpc3Q3UZ01 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rnpc3Q3UZ01 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rnpc3Q3UZ01 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rnpc3Q3UZ01 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rnpc3Q3UZ01 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rnpc3Q3UZ01 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Rnpc3Q3UZ01 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rnpc3Q3UZ01 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rnpc3Q3UZ01 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rnpc3Q3UZ01 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Rnpc3Q3UZ01 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rnpc3Q3UZ01 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Rnpc3Q3UZ01 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rnpc3Q3UZ01 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rnpc3Q3UZ01 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rnpc3Q3UZ01 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rnpc3Q3UZ01 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Rnpc3Q3UZ01 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rnpc3Q3UZ01 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rnpc3Q3UZ01 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rnpc3Q3UZ01 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rnpc3Q3UZ01 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rnpc3Q3UZ01 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rnpc3Q3UZ01 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rnpc3Q3UZ01 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rnpc3Q3UZ01 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rnpc3Q3UZ01 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rnpc3Q3UZ01 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rnpc3Q3UZ01 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rnpc3Q3UZ01 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rnpc3Q3UZ01 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rnpc3Q3UZ01 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rnpc3Q3UZ01 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rnpc3Q3UZ01 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Rnpc3Q3UZ01 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rnpc3Q3UZ01 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rnpc3Q3UZ01 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Rnpc3Q3UZ01 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rnpc3Q3UZ01 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Rnpc3Q3UZ01 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rnpc3Q3UZ01 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rnpc3Q3UZ01 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rnpc3Q3UZ01 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rnpc3Q3UZ01 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rnpc3Q3UZ01 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rnpc3Q3UZ01 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rnpc3Q3UZ01 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rnpc3Q3UZ01 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rnpc3Q3UZ01 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rnpc3Q3UZ01 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rnpc3Q3UZ01 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rnpc3Q3UZ01 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rnpc3Q3UZ01 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rnpc3Q3UZ01 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rnpc3Q3UZ01 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rnpc3Q3UZ01 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rnpc3Q3UZ01 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Rnpc3Q3UZ01 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rnpc3Q3UZ01 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rnpc3Q3UZ01 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rnpc3Q3UZ01 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rnpc3Q3UZ01 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rnpc3Q3UZ01 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rnpc3Q3UZ01 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rnpc3Q3UZ01 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rnpc3Q3UZ01 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rnpc3Q3UZ01 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rnpc3Q3UZ01 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rnpc3Q3UZ01 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rnpc3Q3UZ01 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Rnpc3Q3UZ01 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rnpc3Q3UZ01 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rnpc3Q3UZ01 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rnpc3Q3UZ01 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rnpc3Q3UZ01 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rnpc3Q3UZ01 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rnpc3Q3UZ01 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rnpc3Q3UZ01 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rnpc3Q3UZ01 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rnpc3Q3UZ01 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rnpc3Q3UZ01 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
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