Protein–RNA interactions for Protein: Q12749

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, yeastyeast

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Length 1,114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC6Q12749 WHI5YOR083W 888 nt13.74□□□□□ -0.21
SMC6Q12749 RPP2AYOL039W 321 nt13.7□□□□□ -0.22
SMC6Q12749 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.68□□□□□ -0.22
SMC6Q12749 PUS2YGL063W 1113 nt13.67□□□□□ -0.22
SMC6Q12749 BDF1YLR399C 2061 nt13.63□□□□□ -0.23
SMC6Q12749 PTP1YDL230W 1008 nt13.62□□□□□ -0.23
SMC6Q12749 DCW1YKL046C 1350 nt13.6□□□□□ -0.23
SMC6Q12749 YJL152WYJL152W 360 nt13.56□□□□□ -0.24
SMC6Q12749 ART5YGR068C 1761 nt13.53□□□□□ -0.24
SMC6Q12749 TIR4YOR009W 1464 nt13.52□□□□□ -0.25
SMC6Q12749 CAC2YML102W 1407 nt13.49□□□□□ -0.25
SMC6Q12749 YCH1YGR203W 447 nt13.46□□□□□ -0.25
SMC6Q12749 PET9YBL030C 957 nt13.46□□□□□ -0.25
SMC6Q12749 DSK2YMR276W 1122 nt13.46□□□□□ -0.25
SMC6Q12749 IMP2'YIL154C 1041 nt13.45□□□□□ -0.26
SMC6Q12749 GFD2YCL036W 1701 nt13.44□□□□□ -0.26
SMC6Q12749 EMI2YDR516C 1503 nt13.44□□□□□ -0.26
SMC6Q12749 TAT1YBR069C 1860 nt13.43□□□□□ -0.26
SMC6Q12749 YPR011CYPR011C 981 nt13.4□□□□□ -0.26
SMC6Q12749 YLR236CYLR236C 324 nt13.39□□□□□ -0.27
SMC6Q12749 YMR057CYMR057C 372 nt13.38□□□□□ -0.27
SMC6Q12749 YDL221WYDL221W 552 nt13.36□□□□□ -0.27
SMC6Q12749 YMR090WYMR090W 684 nt13.36□□□□□ -0.27
SMC6Q12749 IDH1YNL037C 1083 nt13.33□□□□□ -0.28
SMC6Q12749 FMP45YDL222C 930 nt13.32□□□□□ -0.28
SMC6Q12749 IRC15YPL017C 1500 nt13.29□□□□□ -0.28
SMC6Q12749 RTS2YOR077W 699 nt13.28□□□□□ -0.28
SMC6Q12749 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.27□□□□□ -0.29
SMC6Q12749 PAC11YDR488C 1602 nt13.27□□□□□ -0.29
SMC6Q12749 Q0182Q0182 405 nt13.23□□□□□ -0.29
SMC6Q12749 GBP2YCL011C 1284 nt13.23□□□□□ -0.29
SMC6Q12749 MOT3YMR070W 1473 nt13.22□□□□□ -0.29
SMC6Q12749 GIS3YLR094C 1509 nt13.2□□□□□ -0.3
SMC6Q12749 FPS1YLL043W 2010 nt13.19□□□□□ -0.3
SMC6Q12749 YDR433WYDR433W 441 nt13.18□□□□□ -0.3
SMC6Q12749 SDH1YKL148C 1923 nt13.17□□□□□ -0.3
SMC6Q12749 LPX1YOR084W 1164 nt13.17□□□□□ -0.3
SMC6Q12749 YBR220CYBR220C 1683 nt13.16□□□□□ -0.3
SMC6Q12749 ERV46YAL042W 1248 nt13.16□□□□□ -0.3
SMC6Q12749 CUE1YMR264W 612 nt13.16□□□□□ -0.3
SMC6Q12749 SCC4YER147C 1875 nt13.12□□□□□ -0.31
SMC6Q12749 YKR040CYKR040C 504 nt13.07□□□□□ -0.32
SMC6Q12749 TCD2YKL027W 1344 nt13.07□□□□□ -0.32
SMC6Q12749 MXR2YCL033C 507 nt13.06□□□□□ -0.32
SMC6Q12749 YIL100WYIL100W 354 nt13.01□□□□□ -0.33
SMC6Q12749 RRD1YIL153W 1182 nt13.01□□□□□ -0.33
SMC6Q12749 DED1YOR204W 1815 nt12.99□□□□□ -0.33
SMC6Q12749 SPP1YPL138C 1062 nt12.94□□□□□ -0.34
SMC6Q12749 NVJ2YPR091C 2313 nt12.88□□□□□ -0.35
SMC6Q12749 FMT1YBL013W 1206 nt12.86□□□□□ -0.35
SMC6Q12749 FMP52YER004W 696 nt12.84□□□□□ -0.35
SMC6Q12749 FRD1YEL047C 1413 nt12.83□□□□□ -0.36
SMC6Q12749 YNL195CYNL195C 786 nt12.82□□□□□ -0.36
SMC6Q12749 YCL042WYCL042W 360 nt12.82□□□□□ -0.36
SMC6Q12749 SOR2YDL246C 1074 nt12.78□□□□□ -0.36
SMC6Q12749 SOR1YJR159W 1074 nt12.78□□□□□ -0.36
SMC6Q12749 YSC84YHR016C 1407 nt12.77□□□□□ -0.37
SMC6Q12749 RRT12YCR045C 1476 nt12.77□□□□□ -0.37
SMC6Q12749 PCH2YBR186W 1695 nt12.76□□□□□ -0.37
SMC6Q12749 CWP1YKL096W 720 nt12.75□□□□□ -0.37
SMC6Q12749 ADH2YMR303C 1047 nt12.72□□□□□ -0.37
SMC6Q12749 YHL050CYHL050C 2094 nt12.72□□□□□ -0.37
SMC6Q12749 GUT2YIL155C 1950 nt12.72□□□□□ -0.37
SMC6Q12749 SEC11YIR022W 504 nt12.71□□□□□ -0.37
SMC6Q12749 MRPL8YJL063C 717 nt12.71□□□□□ -0.37
SMC6Q12749 PCM1YEL058W 1674 nt12.68□□□□□ -0.38
SMC6Q12749 RTG1YOL067C 534 nt12.68□□□□□ -0.38
SMC6Q12749 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.64□□□□□ -0.39
SMC6Q12749 YEL076CYEL076C 651 nt12.64□□□□□ -0.39
SMC6Q12749 PTH1YHR189W 573 nt12.64□□□□□ -0.39
SMC6Q12749 YLR464WYLR464W 651 nt12.64□□□□□ -0.39
SMC6Q12749 SNF6YHL025W 999 nt12.62□□□□□ -0.39
SMC6Q12749 ADO1YJR105W 1023 nt12.6□□□□□ -0.39
SMC6Q12749 YLR235CYLR235C 399 nt12.59□□□□□ -0.39
SMC6Q12749 YKL030WYKL030W 606 nt12.53□□□□□ -0.4
SMC6Q12749 DIC1YLR348C 897 nt12.5□□□□□ -0.41
SMC6Q12749 YIH1YCR059C 777 nt12.49□□□□□ -0.41
SMC6Q12749 RNQ1YCL028W 1218 nt12.49□□□□□ -0.41
SMC6Q12749 PIB2YGL023C 1908 nt12.49□□□□□ -0.41
SMC6Q12749 SIM1YIL123W 1431 nt12.48□□□□□ -0.41
SMC6Q12749 HUA1YGR268C 597 nt12.48□□□□□ -0.41
SMC6Q12749 LCB1YMR296C 1677 nt12.48□□□□□ -0.41
SMC6Q12749 BIO4YNR057C 714 nt12.44□□□□□ -0.42
SMC6Q12749 TIM23YNR017W 669 nt12.43□□□□□ -0.42
SMC6Q12749 YLL053CYLL053C 459 nt12.39□□□□□ -0.43
SMC6Q12749 NCP1YHR042W 2076 nt12.37□□□□□ -0.43
SMC6Q12749 RTF1YGL244W 1677 nt12.36□□□□□ -0.43
SMC6Q12749 YLR179CYLR179C 606 nt12.36□□□□□ -0.43
SMC6Q12749 BOP3YNL042W 1191 nt12.33□□□□□ -0.44
SMC6Q12749 YJL225CYJL225C 5277 nt12.31□□□□□ -0.44
SMC6Q12749 FTR1YER145C 1215 nt12.3□□□□□ -0.44
SMC6Q12749 GAL1YBR020W 1587 nt12.27□□□□□ -0.44
SMC6Q12749 YPR064WYPR064W 420 nt12.27□□□□□ -0.45
SMC6Q12749 ERF2YLR246W 1080 nt12.25□□□□□ -0.45
SMC6Q12749 AQY1YPR192W 918 nt12.25□□□□□ -0.45
SMC6Q12749 TRM5YHR070W 1500 nt12.24□□□□□ -0.45
SMC6Q12749 AHT1YHR093W 549 nt12.24□□□□□ -0.45
SMC6Q12749 WSC2YNL283C 1512 nt12.24□□□□□ -0.45
SMC6Q12749 ATF2YGR177C 1608 nt12.21□□□□□ -0.46
SMC6Q12749 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.2□□□□□ -0.46
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