Protein–RNA interactions for Protein: Q12527

ATG11, Autophagy-related protein 11, yeastyeast

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Length 1,178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG11Q12527 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.42□□□□□ -0.26
ATG11Q12527 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.42□□□□□ -0.26
ATG11Q12527 MRPL8YJL063C 717 nt13.39□□□□□ -0.27
ATG11Q12527 ALF1YNL148C 765 nt13.39□□□□□ -0.27
ATG11Q12527 YJL152WYJL152W 360 nt13.33□□□□□ -0.28
ATG11Q12527 SPT5YML010W 3192 nt13.32□□□□□ -0.28
ATG11Q12527 LPX1YOR084W 1164 nt13.3□□□□□ -0.28
ATG11Q12527 YPS1YLR120C 1710 nt13.27□□□□□ -0.28
ATG11Q12527 ERV46YAL042W 1248 nt13.26□□□□□ -0.29
ATG11Q12527 YDR095CYDR095C 411 nt13.25□□□□□ -0.29
ATG11Q12527 IDH1YNL037C 1083 nt13.24□□□□□ -0.29
ATG11Q12527 SPP1YPL138C 1062 nt13.23□□□□□ -0.29
ATG11Q12527 ADO1YJR105W 1023 nt13.2□□□□□ -0.3
ATG11Q12527 SIS1YNL007C 1059 nt13.19□□□□□ -0.3
ATG11Q12527 YDR433WYDR433W 441 nt13.17□□□□□ -0.3
ATG11Q12527 SSA4YER103W 1929 nt13.17□□□□□ -0.3
ATG11Q12527 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.16□□□□□ -0.3
ATG11Q12527 YEL076CYEL076C 651 nt13.16□□□□□ -0.3
ATG11Q12527 YLR464WYLR464W 651 nt13.16□□□□□ -0.3
ATG11Q12527 TIR4YOR009W 1464 nt13.12□□□□□ -0.31
ATG11Q12527 RTG1YOL067C 534 nt13.12□□□□□ -0.31
ATG11Q12527 YKR040CYKR040C 504 nt13.11□□□□□ -0.31
ATG11Q12527 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.09□□□□□ -0.31
ATG11Q12527 GBP2YCL011C 1284 nt13.08□□□□□ -0.32
ATG11Q12527 UBX6YJL048C 1191 nt13.06□□□□□ -0.32
ATG11Q12527 MXR2YCL033C 507 nt13.02□□□□□ -0.33
ATG11Q12527 RPP2AYOL039W 321 nt13.01□□□□□ -0.33
ATG11Q12527 ART5YGR068C 1761 nt12.97□□□□□ -0.33
ATG11Q12527 CAC2YML102W 1407 nt12.96□□□□□ -0.33
ATG11Q12527 YMR057CYMR057C 372 nt12.93□□□□□ -0.34
ATG11Q12527 PTP1YDL230W 1008 nt12.92□□□□□ -0.34
ATG11Q12527 PET9YBL030C 957 nt12.91□□□□□ -0.34
ATG11Q12527 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.9□□□□□ -0.34
ATG11Q12527 HUA1YGR268C 597 nt12.87□□□□□ -0.35
ATG11Q12527 TCD2YKL027W 1344 nt12.87□□□□□ -0.35
ATG11Q12527 GFD2YCL036W 1701 nt12.85□□□□□ -0.35
ATG11Q12527 MEP2YNL142W 1500 nt12.84□□□□□ -0.35
ATG11Q12527 YDR094WYDR094W 336 nt12.78□□□□□ -0.36
ATG11Q12527 DED1YOR204W 1815 nt12.76□□□□□ -0.37
ATG11Q12527 FRD1YEL047C 1413 nt12.76□□□□□ -0.37
ATG11Q12527 Q0182Q0182 405 nt12.73□□□□□ -0.37
ATG11Q12527 RRD1YIL153W 1182 nt12.72□□□□□ -0.37
ATG11Q12527 FPS1YLL043W 2010 nt12.69□□□□□ -0.38
ATG11Q12527 BDF1YLR399C 2061 nt12.69□□□□□ -0.38
ATG11Q12527 DCW1YKL046C 1350 nt12.67□□□□□ -0.38
ATG11Q12527 PTH1YHR189W 573 nt12.66□□□□□ -0.38
ATG11Q12527 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.64□□□□□ -0.39
ATG11Q12527 RTS2YOR077W 699 nt12.64□□□□□ -0.39
ATG11Q12527 YCL042WYCL042W 360 nt12.63□□□□□ -0.39
ATG11Q12527 YKL030WYKL030W 606 nt12.61□□□□□ -0.39
ATG11Q12527 FMT1YBL013W 1206 nt12.6□□□□□ -0.39
ATG11Q12527 YLR235CYLR235C 399 nt12.59□□□□□ -0.39
ATG11Q12527 SOR2YDL246C 1074 nt12.58□□□□□ -0.4
ATG11Q12527 SOR1YJR159W 1074 nt12.58□□□□□ -0.4
ATG11Q12527 IRC15YPL017C 1500 nt12.53□□□□□ -0.4
ATG11Q12527 TAT1YBR069C 1860 nt12.53□□□□□ -0.4
ATG11Q12527 EMI2YDR516C 1503 nt12.52□□□□□ -0.4
ATG11Q12527 LCB1YMR296C 1677 nt12.52□□□□□ -0.4
ATG11Q12527 CUE1YMR264W 612 nt12.52□□□□□ -0.41
ATG11Q12527 YDL221WYDL221W 552 nt12.47□□□□□ -0.41
ATG11Q12527 FMP52YER004W 696 nt12.44□□□□□ -0.42
ATG11Q12527 GIS3YLR094C 1509 nt12.43□□□□□ -0.42
ATG11Q12527 CWP1YKL096W 720 nt12.43□□□□□ -0.42
ATG11Q12527 YMR090WYMR090W 684 nt12.43□□□□□ -0.42
ATG11Q12527 ADH2YMR303C 1047 nt12.38□□□□□ -0.43
ATG11Q12527 YBR220CYBR220C 1683 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG11Q12527 YIL100WYIL100W 354 nt12.36□□□□□ -0.43
ATG11Q12527 PAU16YKL224C 372 nt12.34□□□□□ -0.43
ATG11Q12527 TIM23YNR017W 669 nt12.34□□□□□ -0.43
ATG11Q12527 YFR018CYFR018C 1092 nt12.32□□□□□ -0.44
ATG11Q12527 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.32□□□□□ -0.44
ATG11Q12527 DIC1YLR348C 897 nt12.3□□□□□ -0.44
ATG11Q12527 SBA1YKL117W 651 nt12.27□□□□□ -0.45
ATG11Q12527 RRT5YFR032C 870 nt12.26□□□□□ -0.45
ATG11Q12527 YLR179CYLR179C 606 nt12.25□□□□□ -0.45
ATG11Q12527 PCM1YEL058W 1674 nt12.25□□□□□ -0.45
ATG11Q12527 SCC4YER147C 1875 nt12.24□□□□□ -0.45
ATG11Q12527 SNF6YHL025W 999 nt12.24□□□□□ -0.45
ATG11Q12527 SDH1YKL148C 1923 nt12.24□□□□□ -0.45
ATG11Q12527 PRE6YOL038W 765 nt12.24□□□□□ -0.45
ATG11Q12527 YPR064WYPR064W 420 nt12.21□□□□□ -0.45
ATG11Q12527 RNQ1YCL028W 1218 nt12.18□□□□□ -0.46
ATG11Q12527 TAD3YLR316C 969 nt12.16□□□□□ -0.46
ATG11Q12527 YIH1YCR059C 777 nt12.14□□□□□ -0.47
ATG11Q12527 WSC2YNL283C 1512 nt12.14□□□□□ -0.47
ATG11Q12527 AHT1YHR093W 549 nt12.12□□□□□ -0.47
ATG11Q12527 PAC11YDR488C 1602 nt12.09□□□□□ -0.47
ATG11Q12527 YFL066CYFL066C 1179 nt12.06□□□□□ -0.48
ATG11Q12527 PCH2YBR186W 1695 nt12.04□□□□□ -0.48
ATG11Q12527 SEC11YIR022W 504 nt12.04□□□□□ -0.48
ATG11Q12527 YNL195CYNL195C 786 nt12.03□□□□□ -0.48
ATG11Q12527 PEX25YPL112C 1185 nt12.01□□□□□ -0.49
ATG11Q12527 YLL053CYLL053C 459 nt12□□□□□ -0.49
ATG11Q12527 GUT2YIL155C 1950 nt11.98□□□□□ -0.49
ATG11Q12527 RRT12YCR045C 1476 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG11Q12527 YSC84YHR016C 1407 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG11Q12527 BIO4YNR057C 714 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG11Q12527 AQY1YPR192W 918 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG11Q12527 FTR1YER145C 1215 nt11.95□□□□□ -0.5
ATG11Q12527 BDH1YAL060W 1149 nt11.95□□□□□ -0.5
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