Protein–RNA interactions for Protein: Q12507

SFG1, Superficial pseudohyphal growth protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SFG1Q12507 CAC2YML102W 1407 nt11.29□□□□□ -0.6
SFG1Q12507 PTP1YDL230W 1008 nt11.28□□□□□ -0.6
SFG1Q12507 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.21□□□□□ -0.61
SFG1Q12507 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.21□□□□□ -0.61
SFG1Q12507 SCC4YER147C 1875 nt11.2□□□□□ -0.62
SFG1Q12507 SEC11YIR022W 504 nt11.19□□□□□ -0.62
SFG1Q12507 CCT6YDR188W 1641 nt11.19□□□□□ -0.62
SFG1Q12507 PAC11YDR488C 1602 nt11.19□□□□□ -0.62
SFG1Q12507 SIS1YNL007C 1059 nt11.16□□□□□ -0.62
SFG1Q12507 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.15□□□□□ -0.62
SFG1Q12507 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.15□□□□□ -0.62
SFG1Q12507 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.15□□□□□ -0.62
SFG1Q12507 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.15□□□□□ -0.62
SFG1Q12507 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.15□□□□□ -0.62
SFG1Q12507 PCH2YBR186W 1695 nt11.14□□□□□ -0.63
SFG1Q12507 MOT3YMR070W 1473 nt11.14□□□□□ -0.63
SFG1Q12507 YLR281CYLR281C 468 nt11.13□□□□□ -0.63
SFG1Q12507 IRC15YPL017C 1500 nt11.13□□□□□ -0.63
SFG1Q12507 GUT2YIL155C 1950 nt11.08□□□□□ -0.64
SFG1Q12507 GIS3YLR094C 1509 nt11.08□□□□□ -0.64
SFG1Q12507 WHI5YOR083W 888 nt11.07□□□□□ -0.64
SFG1Q12507 PUS2YGL063W 1113 nt11.06□□□□□ -0.64
SFG1Q12507 GFD2YCL036W 1701 nt11.03□□□□□ -0.64
SFG1Q12507 ART5YGR068C 1761 nt11.02□□□□□ -0.65
SFG1Q12507 RTS2YOR077W 699 nt10.99□□□□□ -0.65
SFG1Q12507 YSC84YHR016C 1407 nt10.99□□□□□ -0.65
SFG1Q12507 IMP2'YIL154C 1041 nt10.98□□□□□ -0.65
SFG1Q12507 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.97□□□□□ -0.65
SFG1Q12507 PET9YBL030C 957 nt10.96□□□□□ -0.65
SFG1Q12507 YCH1YGR203W 447 nt10.91□□□□□ -0.66
SFG1Q12507 CUE1YMR264W 612 nt10.9□□□□□ -0.66
SFG1Q12507 DSK2YMR276W 1122 nt10.89□□□□□ -0.67
SFG1Q12507 YNL195CYNL195C 786 nt10.89□□□□□ -0.67
SFG1Q12507 YHL050CYHL050C 2094 nt10.86□□□□□ -0.67
SFG1Q12507 RTF1YGL244W 1677 nt10.85□□□□□ -0.67
SFG1Q12507 YIL100WYIL100W 354 nt10.83□□□□□ -0.68
SFG1Q12507 YJL152WYJL152W 360 nt10.83□□□□□ -0.68
SFG1Q12507 YJL225CYJL225C 5277 nt10.81□□□□□ -0.68
SFG1Q12507 RRT12YCR045C 1476 nt10.81□□□□□ -0.68
SFG1Q12507 TIR4YOR009W 1464 nt10.81□□□□□ -0.68
SFG1Q12507 PIB2YGL023C 1908 nt10.8□□□□□ -0.68
SFG1Q12507 BOP3YNL042W 1191 nt10.8□□□□□ -0.68
SFG1Q12507 FMP45YDL222C 930 nt10.78□□□□□ -0.68
SFG1Q12507 YMR057CYMR057C 372 nt10.76□□□□□ -0.69
SFG1Q12507 IDH1YNL037C 1083 nt10.76□□□□□ -0.69
SFG1Q12507 YLR236CYLR236C 324 nt10.72□□□□□ -0.69
SFG1Q12507 YPR011CYPR011C 981 nt10.66□□□□□ -0.7
SFG1Q12507 NVJ2YPR091C 2313 nt10.66□□□□□ -0.7
SFG1Q12507 FPS1YLL043W 2010 nt10.65□□□□□ -0.7
SFG1Q12507 ERV46YAL042W 1248 nt10.62□□□□□ -0.71
SFG1Q12507 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.62□□□□□ -0.71
SFG1Q12507 PTK1YKL198C 1989 nt10.61□□□□□ -0.71
SFG1Q12507 GBP2YCL011C 1284 nt10.59□□□□□ -0.71
SFG1Q12507 YDR433WYDR433W 441 nt10.58□□□□□ -0.72
SFG1Q12507 LPX1YOR084W 1164 nt10.54□□□□□ -0.72
SFG1Q12507 YKR040CYKR040C 504 nt10.53□□□□□ -0.72
SFG1Q12507 MRPL8YJL063C 717 nt10.51□□□□□ -0.73
SFG1Q12507 TCD2YKL027W 1344 nt10.5□□□□□ -0.73
SFG1Q12507 YFL054CYFL054C 1941 nt10.48□□□□□ -0.73
SFG1Q12507 NCP1YHR042W 2076 nt10.48□□□□□ -0.73
SFG1Q12507 ADO1YJR105W 1023 nt10.42□□□□□ -0.74
SFG1Q12507 SPT8YLR055C 1809 nt10.38□□□□□ -0.75
SFG1Q12507 MXR2YCL033C 507 nt10.38□□□□□ -0.75
SFG1Q12507 BOR1YNL275W 1731 nt10.37□□□□□ -0.75
SFG1Q12507 LCB1YMR296C 1677 nt10.37□□□□□ -0.75
SFG1Q12507 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.34□□□□□ -0.75
SFG1Q12507 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.34□□□□□ -0.75
SFG1Q12507 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.32□□□□□ -0.76
SFG1Q12507 YEL076CYEL076C 651 nt10.32□□□□□ -0.76
SFG1Q12507 YLR464WYLR464W 651 nt10.32□□□□□ -0.76
SFG1Q12507 SPP1YPL138C 1062 nt10.32□□□□□ -0.76
SFG1Q12507 RRD1YIL153W 1182 nt10.31□□□□□ -0.76
SFG1Q12507 YCL042WYCL042W 360 nt10.31□□□□□ -0.76
SFG1Q12507 FMP52YER004W 696 nt10.3□□□□□ -0.76
SFG1Q12507 DED1YOR204W 1815 nt10.28□□□□□ -0.76
SFG1Q12507 SIM1YIL123W 1431 nt10.26□□□□□ -0.77
SFG1Q12507 RTG1YOL067C 534 nt10.26□□□□□ -0.77
SFG1Q12507 SOR2YDL246C 1074 nt10.25□□□□□ -0.77
SFG1Q12507 SOR1YJR159W 1074 nt10.25□□□□□ -0.77
SFG1Q12507 FRD1YEL047C 1413 nt10.24□□□□□ -0.77
SFG1Q12507 HUA1YGR268C 597 nt10.21□□□□□ -0.77
SFG1Q12507 PCM1YEL058W 1674 nt10.21□□□□□ -0.78
SFG1Q12507 YLR235CYLR235C 399 nt10.2□□□□□ -0.78
SFG1Q12507 SWE1YJL187C 2460 nt10.19□□□□□ -0.78
SFG1Q12507 FMT1YBL013W 1206 nt10.15□□□□□ -0.78
SFG1Q12507 SNF6YHL025W 999 nt10.13□□□□□ -0.79
SFG1Q12507 YKL030WYKL030W 606 nt10.13□□□□□ -0.79
SFG1Q12507 LYS4YDR234W 2082 nt10.12□□□□□ -0.79
SFG1Q12507 CWP1YKL096W 720 nt10.11□□□□□ -0.79
SFG1Q12507 BIO4YNR057C 714 nt10.11□□□□□ -0.79
SFG1Q12507 HSP60YLR259C 1719 nt10.1□□□□□ -0.79
SFG1Q12507 PTH1YHR189W 573 nt10.08□□□□□ -0.8
SFG1Q12507 ADH2YMR303C 1047 nt10.07□□□□□ -0.8
SFG1Q12507 ERF2YLR246W 1080 nt10.06□□□□□ -0.8
SFG1Q12507 GLK1YCL040W 1503 nt10.02□□□□□ -0.8
SFG1Q12507 CRR1YLR213C 1269 nt10□□□□□ -0.81
SFG1Q12507 DIC1YLR348C 897 nt9.99□□□□□ -0.81
SFG1Q12507 TIM23YNR017W 669 nt9.98□□□□□ -0.81
SFG1Q12507 YDR094WYDR094W 336 nt9.97□□□□□ -0.81
SFG1Q12507 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms