Protein–RNA interactions for Protein: Q12488

PSF1, DNA replication complex GINS protein PSF1, yeastyeast

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PSF1Q12488 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.29□□□□□ -0.6
PSF1Q12488 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.29□□□□□ -0.6
PSF1Q12488 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.29□□□□□ -0.6
PSF1Q12488 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.29□□□□□ -0.6
PSF1Q12488 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.29□□□□□ -0.6
PSF1Q12488 EMI2YDR516C 1503 nt11.28□□□□□ -0.6
PSF1Q12488 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.27□□□□□ -0.61
PSF1Q12488 YMR090WYMR090W 684 nt11.27□□□□□ -0.61
PSF1Q12488 PTP1YDL230W 1008 nt11.26□□□□□ -0.61
PSF1Q12488 YBR220CYBR220C 1683 nt11.24□□□□□ -0.61
PSF1Q12488 PUS2YGL063W 1113 nt11.22□□□□□ -0.61
PSF1Q12488 PAC11YDR488C 1602 nt11.2□□□□□ -0.62
PSF1Q12488 TIR4YOR009W 1464 nt11.16□□□□□ -0.62
PSF1Q12488 ART5YGR068C 1761 nt11.16□□□□□ -0.62
PSF1Q12488 YCH1YGR203W 447 nt11.15□□□□□ -0.62
PSF1Q12488 YJL152WYJL152W 360 nt11.15□□□□□ -0.62
PSF1Q12488 CAC2YML102W 1407 nt11.15□□□□□ -0.62
PSF1Q12488 YDL221WYDL221W 552 nt11.13□□□□□ -0.63
PSF1Q12488 PET9YBL030C 957 nt11.13□□□□□ -0.63
PSF1Q12488 IMP2'YIL154C 1041 nt11.11□□□□□ -0.63
PSF1Q12488 GFD2YCL036W 1701 nt11.11□□□□□ -0.63
PSF1Q12488 SDH1YKL148C 1923 nt11.11□□□□□ -0.63
PSF1Q12488 DSK2YMR276W 1122 nt11.08□□□□□ -0.64
PSF1Q12488 YMR057CYMR057C 372 nt11.02□□□□□ -0.65
PSF1Q12488 YLR236CYLR236C 324 nt11□□□□□ -0.65
PSF1Q12488 IDH1YNL037C 1083 nt11□□□□□ -0.65
PSF1Q12488 IRC15YPL017C 1500 nt10.99□□□□□ -0.65
PSF1Q12488 YPR011CYPR011C 981 nt10.98□□□□□ -0.65
PSF1Q12488 PCH2YBR186W 1695 nt10.98□□□□□ -0.65
PSF1Q12488 NVJ2YPR091C 2313 nt10.97□□□□□ -0.65
PSF1Q12488 SCC4YER147C 1875 nt10.96□□□□□ -0.65
PSF1Q12488 RTS2YOR077W 699 nt10.95□□□□□ -0.66
PSF1Q12488 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.95□□□□□ -0.66
PSF1Q12488 FMP45YDL222C 930 nt10.93□□□□□ -0.66
PSF1Q12488 SEC11YIR022W 504 nt10.93□□□□□ -0.66
PSF1Q12488 GUT2YIL155C 1950 nt10.92□□□□□ -0.66
PSF1Q12488 GIS3YLR094C 1509 nt10.91□□□□□ -0.66
PSF1Q12488 FPS1YLL043W 2010 nt10.9□□□□□ -0.66
PSF1Q12488 CUE1YMR264W 612 nt10.89□□□□□ -0.67
PSF1Q12488 GBP2YCL011C 1284 nt10.88□□□□□ -0.67
PSF1Q12488 ERV46YAL042W 1248 nt10.85□□□□□ -0.67
PSF1Q12488 MOT3YMR070W 1473 nt10.84□□□□□ -0.67
PSF1Q12488 YDR433WYDR433W 441 nt10.83□□□□□ -0.68
PSF1Q12488 LPX1YOR084W 1164 nt10.82□□□□□ -0.68
PSF1Q12488 YSC84YHR016C 1407 nt10.79□□□□□ -0.68
PSF1Q12488 TCD2YKL027W 1344 nt10.78□□□□□ -0.68
PSF1Q12488 YIL100WYIL100W 354 nt10.76□□□□□ -0.69
PSF1Q12488 YKR040CYKR040C 504 nt10.76□□□□□ -0.69
PSF1Q12488 RRD1YIL153W 1182 nt10.73□□□□□ -0.69
PSF1Q12488 MXR2YCL033C 507 nt10.72□□□□□ -0.69
PSF1Q12488 DED1YOR204W 1815 nt10.71□□□□□ -0.69
PSF1Q12488 PIB2YGL023C 1908 nt10.7□□□□□ -0.7
PSF1Q12488 YHL050CYHL050C 2094 nt10.68□□□□□ -0.7
PSF1Q12488 RTF1YGL244W 1677 nt10.67□□□□□ -0.7
PSF1Q12488 RRT12YCR045C 1476 nt10.62□□□□□ -0.71
PSF1Q12488 FMP52YER004W 696 nt10.62□□□□□ -0.71
PSF1Q12488 YNL195CYNL195C 786 nt10.61□□□□□ -0.71
PSF1Q12488 FMT1YBL013W 1206 nt10.59□□□□□ -0.71
PSF1Q12488 SPP1YPL138C 1062 nt10.59□□□□□ -0.71
PSF1Q12488 FRD1YEL047C 1413 nt10.58□□□□□ -0.72
PSF1Q12488 SOR2YDL246C 1074 nt10.57□□□□□ -0.72
PSF1Q12488 SOR1YJR159W 1074 nt10.57□□□□□ -0.72
PSF1Q12488 BOP3YNL042W 1191 nt10.57□□□□□ -0.72
PSF1Q12488 YCL042WYCL042W 360 nt10.56□□□□□ -0.72
PSF1Q12488 CWP1YKL096W 720 nt10.49□□□□□ -0.73
PSF1Q12488 PTK1YKL198C 1989 nt10.48□□□□□ -0.73
PSF1Q12488 ADH2YMR303C 1047 nt10.47□□□□□ -0.73
PSF1Q12488 PCM1YEL058W 1674 nt10.47□□□□□ -0.73
PSF1Q12488 MRPL8YJL063C 717 nt10.46□□□□□ -0.73
PSF1Q12488 SNF6YHL025W 999 nt10.42□□□□□ -0.74
PSF1Q12488 RTG1YOL067C 534 nt10.42□□□□□ -0.74
PSF1Q12488 YLR235CYLR235C 399 nt10.38□□□□□ -0.75
PSF1Q12488 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.37□□□□□ -0.75
PSF1Q12488 YEL076CYEL076C 651 nt10.37□□□□□ -0.75
PSF1Q12488 YLR464WYLR464W 651 nt10.37□□□□□ -0.75
PSF1Q12488 PTH1YHR189W 573 nt10.36□□□□□ -0.75
PSF1Q12488 ADO1YJR105W 1023 nt10.35□□□□□ -0.75
PSF1Q12488 YFL054CYFL054C 1941 nt10.33□□□□□ -0.76
PSF1Q12488 YIH1YCR059C 777 nt10.32□□□□□ -0.76
PSF1Q12488 RNQ1YCL028W 1218 nt10.32□□□□□ -0.76
PSF1Q12488 YKL030WYKL030W 606 nt10.31□□□□□ -0.76
PSF1Q12488 DIC1YLR348C 897 nt10.31□□□□□ -0.76
PSF1Q12488 NCP1YHR042W 2076 nt10.3□□□□□ -0.76
PSF1Q12488 BOR1YNL275W 1731 nt10.3□□□□□ -0.76
PSF1Q12488 LCB1YMR296C 1677 nt10.29□□□□□ -0.76
PSF1Q12488 SIM1YIL123W 1431 nt10.29□□□□□ -0.76
PSF1Q12488 BIO4YNR057C 714 nt10.28□□□□□ -0.76
PSF1Q12488 HUA1YGR268C 597 nt10.26□□□□□ -0.77
PSF1Q12488 TIM23YNR017W 669 nt10.24□□□□□ -0.77
PSF1Q12488 SPT8YLR055C 1809 nt10.23□□□□□ -0.77
PSF1Q12488 YJL225CYJL225C 5277 nt10.22□□□□□ -0.77
PSF1Q12488 YLL053CYLL053C 459 nt10.21□□□□□ -0.77
PSF1Q12488 YLR179CYLR179C 606 nt10.18□□□□□ -0.78
PSF1Q12488 FTR1YER145C 1215 nt10.16□□□□□ -0.78
PSF1Q12488 ERF2YLR246W 1080 nt10.15□□□□□ -0.78
PSF1Q12488 AQY1YPR192W 918 nt10.14□□□□□ -0.79
PSF1Q12488 GAL1YBR020W 1587 nt10.13□□□□□ -0.79
PSF1Q12488 YPR064WYPR064W 420 nt10.12□□□□□ -0.79
PSF1Q12488 TRM5YHR070W 1500 nt10.09□□□□□ -0.79
PSF1Q12488 WSC2YNL283C 1512 nt10.09□□□□□ -0.79
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