Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 ART5YGR068C 1761 nt11.78□□□□□ -0.52
SNF8Q12483 SDH1YKL148C 1923 nt11.78□□□□□ -0.52
SNF8Q12483 IRC15YPL017C 1500 nt11.77□□□□□ -0.52
SNF8Q12483 GFD2YCL036W 1701 nt11.77□□□□□ -0.53
SNF8Q12483 TAT1YBR069C 1860 nt11.76□□□□□ -0.53
SNF8Q12483 YOL037CYOL037C 354 nt11.72□□□□□ -0.53
SNF8Q12483 YOR139CYOR139C 393 nt11.72□□□□□ -0.53
SNF8Q12483 PET9YBL030C 957 nt11.7□□□□□ -0.54
SNF8Q12483 TIR4YOR009W 1464 nt11.7□□□□□ -0.54
SNF8Q12483 GIS3YLR094C 1509 nt11.68□□□□□ -0.54
SNF8Q12483 NPL3YDR432W 1245 nt11.67□□□□□ -0.54
SNF8Q12483 SCC4YER147C 1875 nt11.67□□□□□ -0.54
SNF8Q12483 YCH1YGR203W 447 nt11.64□□□□□ -0.55
SNF8Q12483 RTS2YOR077W 699 nt11.62□□□□□ -0.55
SNF8Q12483 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.59□□□□□ -0.55
SNF8Q12483 YMR057CYMR057C 372 nt11.56□□□□□ -0.56
SNF8Q12483 CUE1YMR264W 612 nt11.54□□□□□ -0.56
SNF8Q12483 FPS1YLL043W 2010 nt11.49□□□□□ -0.57
SNF8Q12483 YJL152WYJL152W 360 nt11.49□□□□□ -0.57
SNF8Q12483 YLR281CYLR281C 468 nt11.49□□□□□ -0.57
SNF8Q12483 WHI5YOR083W 888 nt11.47□□□□□ -0.57
SNF8Q12483 SEC11YIR022W 504 nt11.42□□□□□ -0.58
SNF8Q12483 PCH2YBR186W 1695 nt11.4□□□□□ -0.58
SNF8Q12483 YSC84YHR016C 1407 nt11.4□□□□□ -0.58
SNF8Q12483 YHL050CYHL050C 2094 nt11.38□□□□□ -0.59
SNF8Q12483 GUT2YIL155C 1950 nt11.36□□□□□ -0.59
SNF8Q12483 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.36□□□□□ -0.59
SNF8Q12483 YIL100WYIL100W 354 nt11.35□□□□□ -0.59
SNF8Q12483 YLR236CYLR236C 324 nt11.34□□□□□ -0.59
SNF8Q12483 RRT12YCR045C 1476 nt11.33□□□□□ -0.6
SNF8Q12483 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.27□□□□□ -0.61
SNF8Q12483 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.27□□□□□ -0.61
SNF8Q12483 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.27□□□□□ -0.61
SNF8Q12483 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.27□□□□□ -0.61
SNF8Q12483 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.27□□□□□ -0.61
SNF8Q12483 PUS2YGL063W 1113 nt11.26□□□□□ -0.61
SNF8Q12483 YNL195CYNL195C 786 nt11.26□□□□□ -0.61
SNF8Q12483 IDH1YNL037C 1083 nt11.25□□□□□ -0.61
SNF8Q12483 PIB2YGL023C 1908 nt11.24□□□□□ -0.61
SNF8Q12483 IMP2'YIL154C 1041 nt11.21□□□□□ -0.61
SNF8Q12483 RRD1YIL153W 1182 nt11.2□□□□□ -0.62
SNF8Q12483 DSK2YMR276W 1122 nt11.2□□□□□ -0.62
SNF8Q12483 GBP2YCL011C 1284 nt11.2□□□□□ -0.62
SNF8Q12483 YPR011CYPR011C 981 nt11.19□□□□□ -0.62
SNF8Q12483 DED1YOR204W 1815 nt11.15□□□□□ -0.62
SNF8Q12483 RTF1YGL244W 1677 nt11.13□□□□□ -0.63
SNF8Q12483 TCD2YKL027W 1344 nt11.09□□□□□ -0.63
SNF8Q12483 NCP1YHR042W 2076 nt11.08□□□□□ -0.64
SNF8Q12483 FMP45YDL222C 930 nt11.07□□□□□ -0.64
SNF8Q12483 FMP52YER004W 696 nt11.07□□□□□ -0.64
SNF8Q12483 BOP3YNL042W 1191 nt11.07□□□□□ -0.64
SNF8Q12483 FMT1YBL013W 1206 nt11.06□□□□□ -0.64
SNF8Q12483 YDR433WYDR433W 441 nt11.04□□□□□ -0.64
SNF8Q12483 ERV46YAL042W 1248 nt11.03□□□□□ -0.64
SNF8Q12483 MXR2YCL033C 507 nt11.03□□□□□ -0.64
SNF8Q12483 LPX1YOR084W 1164 nt11.01□□□□□ -0.65
SNF8Q12483 PTK1YKL198C 1989 nt11□□□□□ -0.65
SNF8Q12483 LCB1YMR296C 1677 nt11□□□□□ -0.65
SNF8Q12483 PCM1YEL058W 1674 nt10.98□□□□□ -0.65
SNF8Q12483 SOR2YDL246C 1074 nt10.95□□□□□ -0.66
SNF8Q12483 SOR1YJR159W 1074 nt10.95□□□□□ -0.66
SNF8Q12483 YKR040CYKR040C 504 nt10.95□□□□□ -0.66
SNF8Q12483 ADH2YMR303C 1047 nt10.93□□□□□ -0.66
SNF8Q12483 CWP1YKL096W 720 nt10.92□□□□□ -0.66
SNF8Q12483 FRD1YEL047C 1413 nt10.89□□□□□ -0.67
SNF8Q12483 PAC11YDR488C 1602 nt10.87□□□□□ -0.67
SNF8Q12483 SIM1YIL123W 1431 nt10.86□□□□□ -0.67
SNF8Q12483 SNF6YHL025W 999 nt10.86□□□□□ -0.67
SNF8Q12483 YCL042WYCL042W 360 nt10.85□□□□□ -0.67
SNF8Q12483 BIO4YNR057C 714 nt10.84□□□□□ -0.67
SNF8Q12483 NVJ2YPR091C 2313 nt10.81□□□□□ -0.68
SNF8Q12483 LYS4YDR234W 2082 nt10.8□□□□□ -0.68
SNF8Q12483 YIH1YCR059C 777 nt10.78□□□□□ -0.68
SNF8Q12483 Q0182Q0182 405 nt10.77□□□□□ -0.69
SNF8Q12483 YFL054CYFL054C 1941 nt10.74□□□□□ -0.69
SNF8Q12483 RNQ1YCL028W 1218 nt10.73□□□□□ -0.69
SNF8Q12483 MOT3YMR070W 1473 nt10.72□□□□□ -0.69
SNF8Q12483 SPP1YPL138C 1062 nt10.71□□□□□ -0.69
SNF8Q12483 YJL225CYJL225C 5277 nt10.7□□□□□ -0.7
SNF8Q12483 YLL053CYLL053C 459 nt10.69□□□□□ -0.7
SNF8Q12483 SPT8YLR055C 1809 nt10.69□□□□□ -0.7
SNF8Q12483 CRR1YLR213C 1269 nt10.67□□□□□ -0.7
SNF8Q12483 ERF2YLR246W 1080 nt10.67□□□□□ -0.7
SNF8Q12483 DIC1YLR348C 897 nt10.66□□□□□ -0.7
SNF8Q12483 FTR1YER145C 1215 nt10.61□□□□□ -0.71
SNF8Q12483 ATF2YGR177C 1608 nt10.61□□□□□ -0.71
SNF8Q12483 PTH1YHR189W 573 nt10.6□□□□□ -0.71
SNF8Q12483 GAL1YBR020W 1587 nt10.57□□□□□ -0.72
SNF8Q12483 YLR235CYLR235C 399 nt10.56□□□□□ -0.72
SNF8Q12483 TRM5YHR070W 1500 nt10.55□□□□□ -0.72
SNF8Q12483 YFL067WYFL067W 528 nt10.54□□□□□ -0.72
SNF8Q12483 MIC10YCL057C-A 294 nt10.54□□□□□ -0.72
SNF8Q12483 SWE1YJL187C 2460 nt10.53□□□□□ -0.72
SNF8Q12483 SNG1YGR197C 1644 nt10.52□□□□□ -0.73
SNF8Q12483 HEM12YDR047W 1089 nt10.52□□□□□ -0.73
SNF8Q12483 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.52□□□□□ -0.73
SNF8Q12483 TIM23YNR017W 669 nt10.5□□□□□ -0.73
SNF8Q12483 AQY1YPR192W 918 nt10.49□□□□□ -0.73
SNF8Q12483 DDR2YOL052C-A 186 nt10.47□□□□□ -0.73
SNF8Q12483 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.45□□□□□ -0.74
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