Protein–RNA interactions for Protein: Q12469

SKM1, Serine/threonine-protein kinase SKM1, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKM1Q12469 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.76□□□□□ -0.53
SKM1Q12469 YPR011CYPR011C 981 nt11.74□□□□□ -0.53
SKM1Q12469 PAC11YDR488C 1602 nt11.72□□□□□ -0.53
SKM1Q12469 YCH1YGR203W 447 nt11.72□□□□□ -0.53
SKM1Q12469 YLR236CYLR236C 324 nt11.72□□□□□ -0.53
SKM1Q12469 TAT1YBR069C 1860 nt11.7□□□□□ -0.54
SKM1Q12469 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.69□□□□□ -0.54
SKM1Q12469 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.69□□□□□ -0.54
SKM1Q12469 MRPL8YJL063C 717 nt11.66□□□□□ -0.54
SKM1Q12469 ALF1YNL148C 765 nt11.66□□□□□ -0.54
SKM1Q12469 NVJ2YPR091C 2313 nt11.61□□□□□ -0.55
SKM1Q12469 MEP2YNL142W 1500 nt11.59□□□□□ -0.55
SKM1Q12469 YJL152WYJL152W 360 nt11.58□□□□□ -0.56
SKM1Q12469 FPS1YLL043W 2010 nt11.58□□□□□ -0.56
SKM1Q12469 IDH1YNL037C 1083 nt11.52□□□□□ -0.57
SKM1Q12469 ADO1YJR105W 1023 nt11.51□□□□□ -0.57
SKM1Q12469 LPX1YOR084W 1164 nt11.51□□□□□ -0.57
SKM1Q12469 ERV46YAL042W 1248 nt11.49□□□□□ -0.57
SKM1Q12469 YPS1YLR120C 1710 nt11.47□□□□□ -0.57
SKM1Q12469 YDR095CYDR095C 411 nt11.47□□□□□ -0.57
SKM1Q12469 YDR433WYDR433W 441 nt11.44□□□□□ -0.58
SKM1Q12469 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.44□□□□□ -0.58
SKM1Q12469 YEL076CYEL076C 651 nt11.44□□□□□ -0.58
SKM1Q12469 YLR464WYLR464W 651 nt11.44□□□□□ -0.58
SKM1Q12469 SIS1YNL007C 1059 nt11.42□□□□□ -0.58
SKM1Q12469 SPP1YPL138C 1062 nt11.42□□□□□ -0.58
SKM1Q12469 YKR040CYKR040C 504 nt11.38□□□□□ -0.59
SKM1Q12469 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.36□□□□□ -0.59
SKM1Q12469 RTG1YOL067C 534 nt11.35□□□□□ -0.59
SKM1Q12469 GBP2YCL011C 1284 nt11.35□□□□□ -0.59
SKM1Q12469 TIR4YOR009W 1464 nt11.33□□□□□ -0.6
SKM1Q12469 DCW1YKL046C 1350 nt11.32□□□□□ -0.6
SKM1Q12469 UBX6YJL048C 1191 nt11.31□□□□□ -0.6
SKM1Q12469 YMR090WYMR090W 684 nt11.31□□□□□ -0.6
SKM1Q12469 RPP2AYOL039W 321 nt11.27□□□□□ -0.61
SKM1Q12469 YBR220CYBR220C 1683 nt11.27□□□□□ -0.61
SKM1Q12469 MXR2YCL033C 507 nt11.25□□□□□ -0.61
SKM1Q12469 CAC2YML102W 1407 nt11.24□□□□□ -0.61
SKM1Q12469 YJL225CYJL225C 5277 nt11.22□□□□□ -0.61
SKM1Q12469 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.22□□□□□ -0.61
SKM1Q12469 EMI2YDR516C 1503 nt11.21□□□□□ -0.61
SKM1Q12469 HUA1YGR268C 597 nt11.21□□□□□ -0.61
SKM1Q12469 ART5YGR068C 1761 nt11.2□□□□□ -0.62
SKM1Q12469 PET9YBL030C 957 nt11.19□□□□□ -0.62
SKM1Q12469 TCD2YKL027W 1344 nt11.18□□□□□ -0.62
SKM1Q12469 YMR057CYMR057C 372 nt11.18□□□□□ -0.62
SKM1Q12469 PTP1YDL230W 1008 nt11.13□□□□□ -0.63
SKM1Q12469 GFD2YCL036W 1701 nt11.1□□□□□ -0.63
SKM1Q12469 YDR094WYDR094W 336 nt11.1□□□□□ -0.63
SKM1Q12469 PCH2YBR186W 1695 nt11.09□□□□□ -0.63
SKM1Q12469 SEC11YIR022W 504 nt11.09□□□□□ -0.63
SKM1Q12469 SDH1YKL148C 1923 nt11.08□□□□□ -0.64
SKM1Q12469 YDL221WYDL221W 552 nt11.05□□□□□ -0.64
SKM1Q12469 GUT2YIL155C 1950 nt11.05□□□□□ -0.64
SKM1Q12469 FRD1YEL047C 1413 nt11.03□□□□□ -0.64
SKM1Q12469 DED1YOR204W 1815 nt11□□□□□ -0.65
SKM1Q12469 RRD1YIL153W 1182 nt10.98□□□□□ -0.65
SKM1Q12469 YCL042WYCL042W 360 nt10.98□□□□□ -0.65
SKM1Q12469 PTH1YHR189W 573 nt10.96□□□□□ -0.65
SKM1Q12469 YKL030WYKL030W 606 nt10.96□□□□□ -0.65
SKM1Q12469 YLR235CYLR235C 399 nt10.96□□□□□ -0.65
SKM1Q12469 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.94□□□□□ -0.66
SKM1Q12469 RTS2YOR077W 699 nt10.92□□□□□ -0.66
SKM1Q12469 SOR2YDL246C 1074 nt10.9□□□□□ -0.66
SKM1Q12469 SOR1YJR159W 1074 nt10.9□□□□□ -0.66
SKM1Q12469 SCC4YER147C 1875 nt10.89□□□□□ -0.67
SKM1Q12469 FMT1YBL013W 1206 nt10.85□□□□□ -0.67
SKM1Q12469 LCB1YMR296C 1677 nt10.85□□□□□ -0.67
SKM1Q12469 CUE1YMR264W 612 nt10.83□□□□□ -0.68
SKM1Q12469 FMP52YER004W 696 nt10.81□□□□□ -0.68
SKM1Q12469 IRC15YPL017C 1500 nt10.8□□□□□ -0.68
SKM1Q12469 PIB2YGL023C 1908 nt10.78□□□□□ -0.68
SKM1Q12469 CWP1YKL096W 720 nt10.77□□□□□ -0.69
SKM1Q12469 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.77□□□□□ -0.69
SKM1Q12469 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.77□□□□□ -0.69
SKM1Q12469 RTF1YGL244W 1677 nt10.75□□□□□ -0.69
SKM1Q12469 YIL100WYIL100W 354 nt10.74□□□□□ -0.69
SKM1Q12469 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.72□□□□□ -0.69
SKM1Q12469 YSC84YHR016C 1407 nt10.72□□□□□ -0.69
SKM1Q12469 GIS3YLR094C 1509 nt10.72□□□□□ -0.69
SKM1Q12469 UME6YDR207C 2511 nt10.72□□□□□ -0.69
SKM1Q12469 PAU16YKL224C 372 nt10.7□□□□□ -0.7
SKM1Q12469 ADH2YMR303C 1047 nt10.7□□□□□ -0.7
SKM1Q12469 TIM23YNR017W 669 nt10.7□□□□□ -0.7
SKM1Q12469 YFR018CYFR018C 1092 nt10.69□□□□□ -0.7
SKM1Q12469 RRT5YFR032C 870 nt10.69□□□□□ -0.7
SKM1Q12469 DIC1YLR348C 897 nt10.66□□□□□ -0.7
SKM1Q12469 BOP3YNL042W 1191 nt10.65□□□□□ -0.7
SKM1Q12469 YLR179CYLR179C 606 nt10.63□□□□□ -0.71
SKM1Q12469 YPR064WYPR064W 420 nt10.63□□□□□ -0.71
SKM1Q12469 BOR1YNL275W 1731 nt10.63□□□□□ -0.71
SKM1Q12469 SNF6YHL025W 999 nt10.62□□□□□ -0.71
SKM1Q12469 SBA1YKL117W 651 nt10.61□□□□□ -0.71
SKM1Q12469 YHL050CYHL050C 2094 nt10.6□□□□□ -0.71
SKM1Q12469 PCM1YEL058W 1674 nt10.6□□□□□ -0.71
SKM1Q12469 PRE6YOL038W 765 nt10.57□□□□□ -0.72
SKM1Q12469 TAD3YLR316C 969 nt10.55□□□□□ -0.72
SKM1Q12469 RNQ1YCL028W 1218 nt10.55□□□□□ -0.72
SKM1Q12469 PTK1YKL198C 1989 nt10.53□□□□□ -0.72
SKM1Q12469 YIH1YCR059C 777 nt10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms