Protein–RNA interactions for Protein: Q12463

TRM11, tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM11Q12463 YCH1YGR203W 447 nt13.65□□□□□ -0.22
TRM11Q12463 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.61□□□□□ -0.23
TRM11Q12463 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.61□□□□□ -0.23
TRM11Q12463 ALF1YNL148C 765 nt13.6□□□□□ -0.23
TRM11Q12463 MRPL8YJL063C 717 nt13.54□□□□□ -0.24
TRM11Q12463 YJL152WYJL152W 360 nt13.53□□□□□ -0.24
TRM11Q12463 LPX1YOR084W 1164 nt13.46□□□□□ -0.25
TRM11Q12463 SSA4YER103W 1929 nt13.46□□□□□ -0.25
TRM11Q12463 YPS1YLR120C 1710 nt13.44□□□□□ -0.26
TRM11Q12463 YDR095CYDR095C 411 nt13.43□□□□□ -0.26
TRM11Q12463 ERV46YAL042W 1248 nt13.42□□□□□ -0.26
TRM11Q12463 IDH1YNL037C 1083 nt13.42□□□□□ -0.26
TRM11Q12463 SIS1YNL007C 1059 nt13.37□□□□□ -0.27
TRM11Q12463 SPP1YPL138C 1062 nt13.37□□□□□ -0.27
TRM11Q12463 ADO1YJR105W 1023 nt13.35□□□□□ -0.27
TRM11Q12463 YDR433WYDR433W 441 nt13.34□□□□□ -0.27
TRM11Q12463 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.32□□□□□ -0.28
TRM11Q12463 YEL076CYEL076C 651 nt13.32□□□□□ -0.28
TRM11Q12463 YLR464WYLR464W 651 nt13.32□□□□□ -0.28
TRM11Q12463 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.3□□□□□ -0.28
TRM11Q12463 TIR4YOR009W 1464 nt13.29□□□□□ -0.28
TRM11Q12463 YKR040CYKR040C 504 nt13.28□□□□□ -0.28
TRM11Q12463 RTG1YOL067C 534 nt13.26□□□□□ -0.29
TRM11Q12463 GBP2YCL011C 1284 nt13.26□□□□□ -0.29
TRM11Q12463 UBX6YJL048C 1191 nt13.2□□□□□ -0.3
TRM11Q12463 RPP2AYOL039W 321 nt13.2□□□□□ -0.3
TRM11Q12463 MXR2YCL033C 507 nt13.19□□□□□ -0.3
TRM11Q12463 CAC2YML102W 1407 nt13.13□□□□□ -0.31
TRM11Q12463 ART5YGR068C 1761 nt13.13□□□□□ -0.31
TRM11Q12463 YMR057CYMR057C 372 nt13.11□□□□□ -0.31
TRM11Q12463 PET9YBL030C 957 nt13.1□□□□□ -0.31
TRM11Q12463 PTP1YDL230W 1008 nt13.09□□□□□ -0.31
TRM11Q12463 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.09□□□□□ -0.31
TRM11Q12463 MEP2YNL142W 1500 nt13.08□□□□□ -0.31
TRM11Q12463 BDF1YLR399C 2061 nt13.04□□□□□ -0.32
TRM11Q12463 TCD2YKL027W 1344 nt13.04□□□□□ -0.32
TRM11Q12463 HUA1YGR268C 597 nt13.02□□□□□ -0.33
TRM11Q12463 GFD2YCL036W 1701 nt13.02□□□□□ -0.33
TRM11Q12463 DCW1YKL046C 1350 nt12.93□□□□□ -0.34
TRM11Q12463 FRD1YEL047C 1413 nt12.91□□□□□ -0.34
TRM11Q12463 YDR094WYDR094W 336 nt12.91□□□□□ -0.34
TRM11Q12463 DED1YOR204W 1815 nt12.9□□□□□ -0.34
TRM11Q12463 RRD1YIL153W 1182 nt12.87□□□□□ -0.35
TRM11Q12463 FPS1YLL043W 2010 nt12.84□□□□□ -0.35
TRM11Q12463 PTH1YHR189W 573 nt12.83□□□□□ -0.36
TRM11Q12463 TAT1YBR069C 1860 nt12.82□□□□□ -0.36
TRM11Q12463 RTS2YOR077W 699 nt12.82□□□□□ -0.36
TRM11Q12463 YCL042WYCL042W 360 nt12.8□□□□□ -0.36
TRM11Q12463 YKL030WYKL030W 606 nt12.77□□□□□ -0.37
TRM11Q12463 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.76□□□□□ -0.37
TRM11Q12463 YLR235CYLR235C 399 nt12.76□□□□□ -0.37
TRM11Q12463 FMT1YBL013W 1206 nt12.76□□□□□ -0.37
TRM11Q12463 SOR2YDL246C 1074 nt12.74□□□□□ -0.37
TRM11Q12463 SOR1YJR159W 1074 nt12.74□□□□□ -0.37
TRM11Q12463 CUE1YMR264W 612 nt12.7□□□□□ -0.38
TRM11Q12463 EMI2YDR516C 1503 nt12.7□□□□□ -0.38
TRM11Q12463 IRC15YPL017C 1500 nt12.7□□□□□ -0.38
TRM11Q12463 LCB1YMR296C 1677 nt12.68□□□□□ -0.38
TRM11Q12463 YBR220CYBR220C 1683 nt12.67□□□□□ -0.38
TRM11Q12463 YDL221WYDL221W 552 nt12.65□□□□□ -0.38
TRM11Q12463 FMP52YER004W 696 nt12.62□□□□□ -0.39
TRM11Q12463 CWP1YKL096W 720 nt12.6□□□□□ -0.39
TRM11Q12463 GIS3YLR094C 1509 nt12.6□□□□□ -0.39
TRM11Q12463 YMR090WYMR090W 684 nt12.58□□□□□ -0.4
TRM11Q12463 YIL100WYIL100W 354 nt12.55□□□□□ -0.4
TRM11Q12463 ADH2YMR303C 1047 nt12.55□□□□□ -0.4
TRM11Q12463 SDH1YKL148C 1923 nt12.5□□□□□ -0.41
TRM11Q12463 TIM23YNR017W 669 nt12.5□□□□□ -0.41
TRM11Q12463 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.47□□□□□ -0.41
TRM11Q12463 PAU16YKL224C 372 nt12.47□□□□□ -0.41
TRM11Q12463 YFR018CYFR018C 1092 nt12.46□□□□□ -0.41
TRM11Q12463 DIC1YLR348C 897 nt12.46□□□□□ -0.41
TRM11Q12463 RRT5YFR032C 870 nt12.41□□□□□ -0.42
TRM11Q12463 SNF6YHL025W 999 nt12.41□□□□□ -0.42
TRM11Q12463 YLR179CYLR179C 606 nt12.41□□□□□ -0.42
TRM11Q12463 SCC4YER147C 1875 nt12.4□□□□□ -0.42
TRM11Q12463 PCM1YEL058W 1674 nt12.4□□□□□ -0.42
TRM11Q12463 SBA1YKL117W 651 nt12.38□□□□□ -0.43
TRM11Q12463 PRE6YOL038W 765 nt12.38□□□□□ -0.43
TRM11Q12463 YPR064WYPR064W 420 nt12.38□□□□□ -0.43
TRM11Q12463 RNQ1YCL028W 1218 nt12.33□□□□□ -0.44
TRM11Q12463 TAD3YLR316C 969 nt12.32□□□□□ -0.44
TRM11Q12463 PAC11YDR488C 1602 nt12.31□□□□□ -0.44
TRM11Q12463 YIH1YCR059C 777 nt12.3□□□□□ -0.44
TRM11Q12463 PCH2YBR186W 1695 nt12.29□□□□□ -0.44
TRM11Q12463 WSC2YNL283C 1512 nt12.27□□□□□ -0.44
TRM11Q12463 AHT1YHR093W 549 nt12.26□□□□□ -0.45
TRM11Q12463 GUT2YIL155C 1950 nt12.26□□□□□ -0.45
TRM11Q12463 YNL195CYNL195C 786 nt12.23□□□□□ -0.45
TRM11Q12463 YFL066CYFL066C 1179 nt12.2□□□□□ -0.46
TRM11Q12463 SEC11YIR022W 504 nt12.2□□□□□ -0.46
TRM11Q12463 YLL053CYLL053C 459 nt12.17□□□□□ -0.46
TRM11Q12463 PEX25YPL112C 1185 nt12.16□□□□□ -0.46
TRM11Q12463 YSC84YHR016C 1407 nt12.14□□□□□ -0.47
TRM11Q12463 AQY1YPR192W 918 nt12.14□□□□□ -0.47
TRM11Q12463 PIB2YGL023C 1908 nt12.13□□□□□ -0.47
TRM11Q12463 FTR1YER145C 1215 nt12.12□□□□□ -0.47
TRM11Q12463 RRT12YCR045C 1476 nt12.12□□□□□ -0.47
TRM11Q12463 BIO4YNR057C 714 nt12.11□□□□□ -0.47
TRM11Q12463 YHL050CYHL050C 2094 nt12.09□□□□□ -0.47
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