Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 YGR021WYGR021W 873 nt11.25□□□□□ -0.61
NOP56Q12460 LSM3YLR438C-A 270 nt11.25□□□□□ -0.61
NOP56Q12460 PIB2YGL023C 1908 nt11.25□□□□□ -0.61 RIP-Chip
NOP56Q12460 SHU1YHL006C 453 nt11.24□□□□□ -0.61
NOP56Q12460 TRM9YML014W 840 nt11.24□□□□□ -0.61
NOP56Q12460 ALF1YNL148C 765 nt11.19□□□□□ -0.62
NOP56Q12460 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.18□□□□□ -0.62
NOP56Q12460 YKL097CYKL097C 411 nt11.16□□□□□ -0.62
NOP56Q12460 SCC4YER147C 1875 nt11.12□□□□□ -0.63
NOP56Q12460 HOM6YJR139C 1080 nt11.12□□□□□ -0.63
NOP56Q12460 CCT6YDR188W 1641 nt11.12□□□□□ -0.63
NOP56Q12460 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.11□□□□□ -0.63
NOP56Q12460 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.11□□□□□ -0.63
NOP56Q12460 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.09□□□□□ -0.63
NOP56Q12460 RTF1YGL244W 1677 nt11.08□□□□□ -0.64
NOP56Q12460 RPP2AYOL039W 321 nt11.05□□□□□ -0.64
NOP56Q12460 SIS1YNL007C 1059 nt10.99□□□□□ -0.65
NOP56Q12460 CAC2YML102W 1407 nt10.98□□□□□ -0.65
NOP56Q12460 MNP1YGL068W 585 nt10.97□□□□□ -0.65
NOP56Q12460 RKM5YLR137W 1104 nt10.97□□□□□ -0.65
NOP56Q12460 BOP3YNL042W 1191 nt10.97□□□□□ -0.65
NOP56Q12460 YSC84YHR016C 1407 nt10.95□□□□□ -0.66
NOP56Q12460 PTP1YDL230W 1008 nt10.95□□□□□ -0.66
NOP56Q12460 PTK1YKL198C 1989 nt10.87□□□□□ -0.67 RIP-Chip
NOP56Q12460 HSL7YBR133C 2484 nt10.87□□□□□ -0.67
NOP56Q12460 HSP60YLR259C 1719 nt10.87□□□□□ -0.67 RIP-Chip
NOP56Q12460 IRC15YPL017C 1500 nt10.85□□□□□ -0.67
NOP56Q12460 NAR1YNL240C 1476 nt10.85□□□□□ -0.67
NOP56Q12460 DED1YOR204W 1815 nt10.84□□□□□ -0.67
NOP56Q12460 YOL037CYOL037C 354 nt10.83□□□□□ -0.68
NOP56Q12460 GIS3YLR094C 1509 nt10.83□□□□□ -0.68
NOP56Q12460 YHL050CYHL050C 2094 nt10.81□□□□□ -0.68 RIP-Chip
NOP56Q12460 SPT8YLR055C 1809 nt10.81□□□□□ -0.68 RIP-Chip
NOP56Q12460 YCH1YGR203W 447 nt10.8□□□□□ -0.68
NOP56Q12460 PET9YBL030C 957 nt10.79□□□□□ -0.68
NOP56Q12460 CMP2YML057W 1815 nt10.78□□□□□ -0.68
NOP56Q12460 HEL2YDR266C 1920 nt10.78□□□□□ -0.68
NOP56Q12460 ART5YGR068C 1761 nt10.77□□□□□ -0.68
NOP56Q12460 GFD2YCL036W 1701 nt10.76□□□□□ -0.69
NOP56Q12460 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.76□□□□□ -0.69
NOP56Q12460 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.76□□□□□ -0.69
NOP56Q12460 LCB1YMR296C 1677 nt10.74□□□□□ -0.69 RIP-Chip
NOP56Q12460 MET2YNL277W 1461 nt10.74□□□□□ -0.69
NOP56Q12460 NPL3YDR432W 1245 nt10.73□□□□□ -0.69
NOP56Q12460 YNL195CYNL195C 786 nt10.72□□□□□ -0.69
NOP56Q12460 YAT1YAR035W 2064 nt10.69□□□□□ -0.7
NOP56Q12460 SSN3YPL042C 1668 nt10.69□□□□□ -0.7
NOP56Q12460 TIR4YOR009W 1464 nt10.68□□□□□ -0.7
NOP56Q12460 YOR139CYOR139C 393 nt10.67□□□□□ -0.7
NOP56Q12460 GID7YCL039W 2238 nt10.66□□□□□ -0.7
NOP56Q12460 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.66□□□□□ -0.7
NOP56Q12460 DSK2YMR276W 1122 nt10.65□□□□□ -0.7
NOP56Q12460 YFL054CYFL054C 1941 nt10.64□□□□□ -0.71
NOP56Q12460 RTS2YOR077W 699 nt10.62□□□□□ -0.71
NOP56Q12460 RRT12YCR045C 1476 nt10.61□□□□□ -0.71
NOP56Q12460 CUE1YMR264W 612 nt10.61□□□□□ -0.71
NOP56Q12460 SFP1YLR403W 2052 nt10.61□□□□□ -0.71
NOP56Q12460 YJL152WYJL152W 360 nt10.6□□□□□ -0.71
NOP56Q12460 YMR057CYMR057C 372 nt10.59□□□□□ -0.71
NOP56Q12460 NPP1YCR026C 2229 nt10.56□□□□□ -0.72
NOP56Q12460 GLK1YCL040W 1503 nt10.54□□□□□ -0.72
NOP56Q12460 YLR281CYLR281C 468 nt10.53□□□□□ -0.72
NOP56Q12460 WHI5YOR083W 888 nt10.53□□□□□ -0.72
NOP56Q12460 YIL100WYIL100W 354 nt10.51□□□□□ -0.73
NOP56Q12460 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.51□□□□□ -0.73
NOP56Q12460 YLR236CYLR236C 324 nt10.5□□□□□ -0.73
NOP56Q12460 NCP1YHR042W 2076 nt10.47□□□□□ -0.73 RIP-Chip
NOP56Q12460 CYT2YKL087C 675 nt10.45□□□□□ -0.74
NOP56Q12460 IMP2'YIL154C 1041 nt10.41□□□□□ -0.74 RIP-Chip
NOP56Q12460 IDH1YNL037C 1083 nt10.41□□□□□ -0.74
NOP56Q12460 PBP1YGR178C 2169 nt10.39□□□□□ -0.75
NOP56Q12460 AAC1YMR056C 930 nt10.39□□□□□ -0.75
NOP56Q12460 PUS2YGL063W 1113 nt10.35□□□□□ -0.75
NOP56Q12460 SWE1YJL187C 2460 nt10.32□□□□□ -0.76 RIP-Chip
NOP56Q12460 HMG2YLR450W 3138 nt10.31□□□□□ -0.76 RIP-Chip
NOP56Q12460 GBP2YCL011C 1284 nt10.31□□□□□ -0.76
NOP56Q12460 FRE6YLL051C 2139 nt10.31□□□□□ -0.76
NOP56Q12460 MAE1YKL029C 2010 nt10.31□□□□□ -0.76
NOP56Q12460 ESBP6YNL125C 2022 nt10.3□□□□□ -0.76
NOP56Q12460 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.3□□□□□ -0.76
NOP56Q12460 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.3□□□□□ -0.76
NOP56Q12460 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.3□□□□□ -0.76
NOP56Q12460 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.3□□□□□ -0.76
NOP56Q12460 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.3□□□□□ -0.76
NOP56Q12460 TPO4YOR273C 1980 nt10.28□□□□□ -0.76
NOP56Q12460 ILV2YMR108W 2064 nt10.27□□□□□ -0.77
NOP56Q12460 TCD2YKL027W 1344 nt10.26□□□□□ -0.77
NOP56Q12460 NDI1YML120C 1542 nt10.24□□□□□ -0.77
NOP56Q12460 FMP52YER004W 696 nt10.23□□□□□ -0.77
NOP56Q12460 UGA4YDL210W 1716 nt10.23□□□□□ -0.77
NOP56Q12460 RRD1YIL153W 1182 nt10.22□□□□□ -0.77
NOP56Q12460 BIO5YNR056C 1686 nt10.21□□□□□ -0.78
NOP56Q12460 BSP1YPR171W 1731 nt10.19□□□□□ -0.78 RIP-Chip
NOP56Q12460 YDR433WYDR433W 441 nt10.17□□□□□ -0.78
NOP56Q12460 PRP4YPR178W 1398 nt10.16□□□□□ -0.78
NOP56Q12460 RIM8YGL045W 1629 nt10.16□□□□□ -0.78
NOP56Q12460 UBX6YJL048C 1191 nt10.15□□□□□ -0.78
NOP56Q12460 SNG1YGR197C 1644 nt10.14□□□□□ -0.79
NOP56Q12460 URA8YJR103W 1737 nt10.13□□□□□ -0.79
NOP56Q12460 DTR1YBR180W 1719 nt10.11□□□□□ -0.79
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