Protein–RNA interactions for Protein: Q12369

SFI1, Protein SFI1, yeastyeast

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SFI1Q12369 PIB2YGL023C 1908 nt13.37□□□□□ -0.27
SFI1Q12369 YSC84YHR016C 1407 nt13.33□□□□□ -0.28
SFI1Q12369 GFD2YCL036W 1701 nt13.3□□□□□ -0.28
SFI1Q12369 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.29□□□□□ -0.28
SFI1Q12369 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.29□□□□□ -0.28
SFI1Q12369 LSM3YLR438C-A 270 nt13.29□□□□□ -0.28
SFI1Q12369 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.27□□□□□ -0.29
SFI1Q12369 ART5YGR068C 1761 nt13.26□□□□□ -0.29
SFI1Q12369 YHL050CYHL050C 2094 nt13.26□□□□□ -0.29
SFI1Q12369 WWM1YFL010C 636 nt13.25□□□□□ -0.29
SFI1Q12369 RTS2YOR077W 699 nt13.22□□□□□ -0.29
SFI1Q12369 RTF1YGL244W 1677 nt13.2□□□□□ -0.3
SFI1Q12369 PET9YBL030C 957 nt13.14□□□□□ -0.31
SFI1Q12369 RRT12YCR045C 1476 nt13.13□□□□□ -0.31
SFI1Q12369 YGR021WYGR021W 873 nt13.12□□□□□ -0.31
SFI1Q12369 Q0182Q0182 405 nt13.12□□□□□ -0.31
SFI1Q12369 CUE1YMR264W 612 nt13.1□□□□□ -0.31
SFI1Q12369 YOR139CYOR139C 393 nt13.08□□□□□ -0.32
SFI1Q12369 BOP3YNL042W 1191 nt13.06□□□□□ -0.32
SFI1Q12369 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.05□□□□□ -0.32
SFI1Q12369 HOM6YJR139C 1080 nt13.04□□□□□ -0.32
SFI1Q12369 PTK1YKL198C 1989 nt13.03□□□□□ -0.32
SFI1Q12369 YCH1YGR203W 447 nt13.01□□□□□ -0.33
SFI1Q12369 NPL3YDR432W 1245 nt13□□□□□ -0.33
SFI1Q12369 YNL195CYNL195C 786 nt12.99□□□□□ -0.33
SFI1Q12369 TIR4YOR009W 1464 nt12.97□□□□□ -0.33
SFI1Q12369 MNP1YGL068W 585 nt12.96□□□□□ -0.33
SFI1Q12369 YIL100WYIL100W 354 nt12.92□□□□□ -0.34
SFI1Q12369 YMR057CYMR057C 372 nt12.89□□□□□ -0.35
SFI1Q12369 YOL037CYOL037C 354 nt12.88□□□□□ -0.35
SFI1Q12369 NCP1YHR042W 2076 nt12.87□□□□□ -0.35
SFI1Q12369 FPS1YLL043W 2010 nt12.87□□□□□ -0.35
SFI1Q12369 RKM5YLR137W 1104 nt12.86□□□□□ -0.35
SFI1Q12369 YLR236CYLR236C 324 nt12.78□□□□□ -0.36
SFI1Q12369 YFL054CYFL054C 1941 nt12.72□□□□□ -0.37
SFI1Q12369 YJL225CYJL225C 5277 nt12.71□□□□□ -0.37
SFI1Q12369 SPT8YLR055C 1809 nt12.67□□□□□ -0.38
SFI1Q12369 BOR1YNL275W 1731 nt12.65□□□□□ -0.38
SFI1Q12369 LCB1YMR296C 1677 nt12.6□□□□□ -0.39
SFI1Q12369 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.58□□□□□ -0.4
SFI1Q12369 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.58□□□□□ -0.4
SFI1Q12369 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.58□□□□□ -0.4
SFI1Q12369 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.58□□□□□ -0.4
SFI1Q12369 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.58□□□□□ -0.4
SFI1Q12369 YLR281CYLR281C 468 nt12.54□□□□□ -0.4
SFI1Q12369 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.54□□□□□ -0.4
SFI1Q12369 YJL152WYJL152W 360 nt12.52□□□□□ -0.41
SFI1Q12369 UME6YDR207C 2511 nt12.49□□□□□ -0.41
SFI1Q12369 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.49□□□□□ -0.41
SFI1Q12369 WHI5YOR083W 888 nt12.48□□□□□ -0.41
SFI1Q12369 PUS2YGL063W 1113 nt12.47□□□□□ -0.41
SFI1Q12369 SWE1YJL187C 2460 nt12.43□□□□□ -0.42
SFI1Q12369 HSP60YLR259C 1719 nt12.36□□□□□ -0.43
SFI1Q12369 LYS4YDR234W 2082 nt12.36□□□□□ -0.43
SFI1Q12369 RRD1YIL153W 1182 nt12.31□□□□□ -0.44
SFI1Q12369 SIM1YIL123W 1431 nt12.29□□□□□ -0.44
SFI1Q12369 MOT3YMR070W 1473 nt12.28□□□□□ -0.44
SFI1Q12369 IMP2'YIL154C 1041 nt12.27□□□□□ -0.45
SFI1Q12369 FMP52YER004W 696 nt12.26□□□□□ -0.45
SFI1Q12369 PCM1YEL058W 1674 nt12.25□□□□□ -0.45
SFI1Q12369 DSK2YMR276W 1122 nt12.24□□□□□ -0.45
SFI1Q12369 ALG12YNR030W 1656 nt12.21□□□□□ -0.45
SFI1Q12369 GLK1YCL040W 1503 nt12.19□□□□□ -0.46
SFI1Q12369 DED1YOR204W 1815 nt12.18□□□□□ -0.46
SFI1Q12369 MCH5YOR306C 1566 nt12.18□□□□□ -0.46
SFI1Q12369 BIO4YNR057C 714 nt12.16□□□□□ -0.46
SFI1Q12369 FMP45YDL222C 930 nt12.15□□□□□ -0.46
SFI1Q12369 YPR011CYPR011C 981 nt12.14□□□□□ -0.47
SFI1Q12369 FMT1YBL013W 1206 nt12.12□□□□□ -0.47
SFI1Q12369 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.12□□□□□ -0.47
SFI1Q12369 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.12□□□□□ -0.47
SFI1Q12369 GBP2YCL011C 1284 nt12.09□□□□□ -0.47
SFI1Q12369 FUR4YBR021W 1902 nt12.09□□□□□ -0.47
SFI1Q12369 IDH1YNL037C 1083 nt12.08□□□□□ -0.48
SFI1Q12369 ADH2YMR303C 1047 nt12.07□□□□□ -0.48
SFI1Q12369 TCD2YKL027W 1344 nt12.07□□□□□ -0.48
SFI1Q12369 SNF6YHL025W 999 nt12.06□□□□□ -0.48
SFI1Q12369 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.03□□□□□ -0.48
SFI1Q12369 CWP1YKL096W 720 nt12.03□□□□□ -0.48
SFI1Q12369 CRR1YLR213C 1269 nt12.03□□□□□ -0.48
SFI1Q12369 ERF2YLR246W 1080 nt12.03□□□□□ -0.48
SFI1Q12369 ERV46YAL042W 1248 nt11.95□□□□□ -0.5
SFI1Q12369 CCA1YER168C 1641 nt11.95□□□□□ -0.5
SFI1Q12369 PRP4YPR178W 1398 nt11.94□□□□□ -0.5
SFI1Q12369 YDR433WYDR433W 441 nt11.93□□□□□ -0.5
SFI1Q12369 LPX1YOR084W 1164 nt11.93□□□□□ -0.5
SFI1Q12369 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.92□□□□□ -0.5
SFI1Q12369 YEL076CYEL076C 651 nt11.92□□□□□ -0.5
SFI1Q12369 YLR464WYLR464W 651 nt11.92□□□□□ -0.5
SFI1Q12369 YIH1YCR059C 777 nt11.91□□□□□ -0.5
SFI1Q12369 MIC10YCL057C-A 294 nt11.91□□□□□ -0.5
SFI1Q12369 SOR2YDL246C 1074 nt11.9□□□□□ -0.5
SFI1Q12369 HEM12YDR047W 1089 nt11.9□□□□□ -0.5
SFI1Q12369 SOR1YJR159W 1074 nt11.9□□□□□ -0.5
SFI1Q12369 AAC1YMR056C 930 nt11.9□□□□□ -0.5
SFI1Q12369 RAX1YOR301W 1308 nt11.89□□□□□ -0.51
SFI1Q12369 DPS1YLL018C 1674 nt11.88□□□□□ -0.51
SFI1Q12369 YLL053CYLL053C 459 nt11.87□□□□□ -0.51
SFI1Q12369 ATF2YGR177C 1608 nt11.86□□□□□ -0.51
SFI1Q12369 YKR040CYKR040C 504 nt11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms