Protein–RNA interactions for Protein: Q12346

YPR071W, Uncharacterized membrane protein YPR071W, yeastyeast

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR071WQ12346 YOL037CYOL037C 354 nt10.3□□□□□ -0.76
YPR071WQ12346 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.25□□□□□ -0.77
YPR071WQ12346 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.25□□□□□ -0.77
YPR071WQ12346 YGR139WYGR139W 339 nt10.2□□□□□ -0.78
YPR071WQ12346 YDL221WYDL221W 552 nt10.19□□□□□ -0.78
YPR071WQ12346 SDH1YKL148C 1923 nt10.18□□□□□ -0.78
YPR071WQ12346 SIS1YNL007C 1059 nt10.15□□□□□ -0.78
YPR071WQ12346 RPP2AYOL039W 321 nt10.14□□□□□ -0.79
YPR071WQ12346 PCH2YBR186W 1695 nt10.1□□□□□ -0.79
YPR071WQ12346 CAC2YML102W 1407 nt10.08□□□□□ -0.8
YPR071WQ12346 PTP1YDL230W 1008 nt10.07□□□□□ -0.8
YPR071WQ12346 YLR281CYLR281C 468 nt10.07□□□□□ -0.8
YPR071WQ12346 SEC11YIR022W 504 nt10.06□□□□□ -0.8
YPR071WQ12346 GUT2YIL155C 1950 nt10.06□□□□□ -0.8
YPR071WQ12346 WHI5YOR083W 888 nt10.04□□□□□ -0.8
YPR071WQ12346 SCC4YER147C 1875 nt10.03□□□□□ -0.8
YPR071WQ12346 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.03□□□□□ -0.8
YPR071WQ12346 NVJ2YPR091C 2313 nt10.03□□□□□ -0.8
YPR071WQ12346 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.99□□□□□ -0.81
YPR071WQ12346 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.99□□□□□ -0.81
YPR071WQ12346 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.99□□□□□ -0.81
YPR071WQ12346 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.99□□□□□ -0.81
YPR071WQ12346 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.99□□□□□ -0.81
YPR071WQ12346 ART5YGR068C 1761 nt9.96□□□□□ -0.81
YPR071WQ12346 YCH1YGR203W 447 nt9.96□□□□□ -0.82
YPR071WQ12346 PUS2YGL063W 1113 nt9.95□□□□□ -0.82
YPR071WQ12346 YJL152WYJL152W 360 nt9.95□□□□□ -0.82
YPR071WQ12346 PET9YBL030C 957 nt9.95□□□□□ -0.82
YPR071WQ12346 MET8YBR213W 825 nt9.95□□□□□ -0.82
YPR071WQ12346 FRE6YLL051C 2139 nt9.94□□□□□ -0.82
YPR071WQ12346 IRC15YPL017C 1500 nt9.94□□□□□ -0.82
YPR071WQ12346 TIR4YOR009W 1464 nt9.94□□□□□ -0.82
YPR071WQ12346 GFD2YCL036W 1701 nt9.92□□□□□ -0.82
YPR071WQ12346 GIS3YLR094C 1509 nt9.91□□□□□ -0.82
YPR071WQ12346 YSC84YHR016C 1407 nt9.87□□□□□ -0.83
YPR071WQ12346 CLB6YGR109C 1143 nt9.86□□□□□ -0.83
YPR071WQ12346 IMP2'YIL154C 1041 nt9.86□□□□□ -0.83
YPR071WQ12346 PIB2YGL023C 1908 nt9.86□□□□□ -0.83
YPR071WQ12346 YMR057CYMR057C 372 nt9.85□□□□□ -0.83
YPR071WQ12346 DSK2YMR276W 1122 nt9.82□□□□□ -0.84
YPR071WQ12346 RTF1YGL244W 1677 nt9.8□□□□□ -0.84
YPR071WQ12346 RTS2YOR077W 699 nt9.79□□□□□ -0.84
YPR071WQ12346 IDH1YNL037C 1083 nt9.78□□□□□ -0.84
YPR071WQ12346 YHL050CYHL050C 2094 nt9.78□□□□□ -0.84
YPR071WQ12346 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.77□□□□□ -0.85
YPR071WQ12346 CSM2YIL132C 642 nt9.75□□□□□ -0.85
YPR071WQ12346 RPM1RPM1 483 nt9.75□□□□□ -0.85
YPR071WQ12346 Q0010Q0010 387 nt9.75□□□□□ -0.85
YPR071WQ12346 YLR236CYLR236C 324 nt9.74□□□□□ -0.85
YPR071WQ12346 YPR011CYPR011C 981 nt9.74□□□□□ -0.85
YPR071WQ12346 CUE1YMR264W 612 nt9.73□□□□□ -0.85
YPR071WQ12346 FPS1YLL043W 2010 nt9.72□□□□□ -0.85
YPR071WQ12346 BOP3YNL042W 1191 nt9.71□□□□□ -0.86
YPR071WQ12346 FMP45YDL222C 930 nt9.69□□□□□ -0.86
YPR071WQ12346 GBP2YCL011C 1284 nt9.69□□□□□ -0.86
YPR071WQ12346 RRT12YCR045C 1476 nt9.68□□□□□ -0.86
YPR071WQ12346 YJR154WYJR154W 1041 nt9.67□□□□□ -0.86
YPR071WQ12346 YNL195CYNL195C 786 nt9.65□□□□□ -0.86
YPR071WQ12346 PTK1YKL198C 1989 nt9.64□□□□□ -0.87
YPR071WQ12346 YDR433WYDR433W 441 nt9.63□□□□□ -0.87
YPR071WQ12346 YIL100WYIL100W 354 nt9.63□□□□□ -0.87
YPR071WQ12346 ERV46YAL042W 1248 nt9.62□□□□□ -0.87
YPR071WQ12346 TCD2YKL027W 1344 nt9.6□□□□□ -0.87
YPR071WQ12346 MRPL8YJL063C 717 nt9.6□□□□□ -0.87
YPR071WQ12346 LPX1YOR084W 1164 nt9.59□□□□□ -0.87
YPR071WQ12346 YKR040CYKR040C 504 nt9.57□□□□□ -0.88
YPR071WQ12346 RRD1YIL153W 1182 nt9.56□□□□□ -0.88
YPR071WQ12346 MXR2YCL033C 507 nt9.54□□□□□ -0.88
YPR071WQ12346 DED1YOR204W 1815 nt9.53□□□□□ -0.88
YPR071WQ12346 BOR1YNL275W 1731 nt9.5□□□□□ -0.89
YPR071WQ12346 ADO1YJR105W 1023 nt9.48□□□□□ -0.89
YPR071WQ12346 YJL225CYJL225C 5277 nt9.48□□□□□ -0.89
YPR071WQ12346 FMP52YER004W 696 nt9.47□□□□□ -0.89
YPR071WQ12346 NCP1YHR042W 2076 nt9.46□□□□□ -0.89
YPR071WQ12346 YFL054CYFL054C 1941 nt9.45□□□□□ -0.9
YPR071WQ12346 FMT1YBL013W 1206 nt9.44□□□□□ -0.9
YPR071WQ12346 YCL042WYCL042W 360 nt9.41□□□□□ -0.9
YPR071WQ12346 SPT8YLR055C 1809 nt9.4□□□□□ -0.9
YPR071WQ12346 SOR2YDL246C 1074 nt9.39□□□□□ -0.91
YPR071WQ12346 SOR1YJR159W 1074 nt9.39□□□□□ -0.91
YPR071WQ12346 SPP1YPL138C 1062 nt9.39□□□□□ -0.91
YPR071WQ12346 FRD1YEL047C 1413 nt9.39□□□□□ -0.91
YPR071WQ12346 CWP1YKL096W 720 nt9.36□□□□□ -0.91
YPR071WQ12346 PCM1YEL058W 1674 nt9.34□□□□□ -0.91
YPR071WQ12346 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.33□□□□□ -0.92
YPR071WQ12346 ADH2YMR303C 1047 nt9.33□□□□□ -0.92
YPR071WQ12346 PAU21YOR394W 495 nt9.33□□□□□ -0.92
YPR071WQ12346 PAU22YPL282C 495 nt9.33□□□□□ -0.92
YPR071WQ12346 UME6YDR207C 2511 nt9.33□□□□□ -0.92
YPR071WQ12346 PAB1YER165W 1734 nt9.32□□□□□ -0.92
YPR071WQ12346 UBX6YJL048C 1191 nt9.3□□□□□ -0.92
YPR071WQ12346 SNF6YHL025W 999 nt9.29□□□□□ -0.92
YPR071WQ12346 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.27□□□□□ -0.93
YPR071WQ12346 YEL076CYEL076C 651 nt9.27□□□□□ -0.93
YPR071WQ12346 YLR464WYLR464W 651 nt9.27□□□□□ -0.93
YPR071WQ12346 LCB1YMR296C 1677 nt9.26□□□□□ -0.93
YPR071WQ12346 PTH1YHR189W 573 nt9.22□□□□□ -0.93
YPR071WQ12346 YLR235CYLR235C 399 nt9.22□□□□□ -0.93
YPR071WQ12346 RTG1YOL067C 534 nt9.21□□□□□ -0.94
YPR071WQ12346 ARO7YPR060C 771 nt9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.6 ms