Protein–RNA interactions for Protein: Q12339

UTP23, rRNA-processing protein UTP23, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UTP23Q12339 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.6□□□□□ -0.87
UTP23Q12339 SIS1YNL007C 1059 nt9.6□□□□□ -0.87
UTP23Q12339 SCC4YER147C 1875 nt9.55□□□□□ -0.88
UTP23Q12339 PCH2YBR186W 1695 nt9.55□□□□□ -0.88
UTP23Q12339 GUT2YIL155C 1950 nt9.53□□□□□ -0.88
UTP23Q12339 SEC11YIR022W 504 nt9.52□□□□□ -0.89
UTP23Q12339 IRC15YPL017C 1500 nt9.48□□□□□ -0.89
UTP23Q12339 ART5YGR068C 1761 nt9.46□□□□□ -0.9
UTP23Q12339 HOM6YJR139C 1080 nt9.46□□□□□ -0.9
UTP23Q12339 GIS3YLR094C 1509 nt9.46□□□□□ -0.9
UTP23Q12339 GFD2YCL036W 1701 nt9.45□□□□□ -0.9
UTP23Q12339 PET9YBL030C 957 nt9.45□□□□□ -0.9
UTP23Q12339 UME6YDR207C 2511 nt9.45□□□□□ -0.9
UTP23Q12339 YCH1YGR203W 447 nt9.44□□□□□ -0.9
UTP23Q12339 SHU1YHL006C 453 nt9.43□□□□□ -0.9
UTP23Q12339 RTS2YOR077W 699 nt9.42□□□□□ -0.9
UTP23Q12339 PIB2YGL023C 1908 nt9.42□□□□□ -0.9
UTP23Q12339 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt9.4□□□□□ -0.9
UTP23Q12339 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.38□□□□□ -0.91
UTP23Q12339 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.38□□□□□ -0.91
UTP23Q12339 YNL195CYNL195C 786 nt9.37□□□□□ -0.91
UTP23Q12339 RKM5YLR137W 1104 nt9.35□□□□□ -0.91
UTP23Q12339 CUE1YMR264W 612 nt9.35□□□□□ -0.91
UTP23Q12339 YSC84YHR016C 1407 nt9.34□□□□□ -0.91
UTP23Q12339 MNP1YGL068W 585 nt9.34□□□□□ -0.91
UTP23Q12339 YIL100WYIL100W 354 nt9.34□□□□□ -0.91
UTP23Q12339 TIR4YOR009W 1464 nt9.3□□□□□ -0.92
UTP23Q12339 YKL097CYKL097C 411 nt9.27□□□□□ -0.93
UTP23Q12339 YLR236CYLR236C 324 nt9.27□□□□□ -0.93
UTP23Q12339 YMR057CYMR057C 372 nt9.27□□□□□ -0.93
UTP23Q12339 YJL152WYJL152W 360 nt9.24□□□□□ -0.93
UTP23Q12339 RTF1YGL244W 1677 nt9.23□□□□□ -0.93
UTP23Q12339 YHL050CYHL050C 2094 nt9.22□□□□□ -0.93
UTP23Q12339 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.21□□□□□ -0.94
UTP23Q12339 RRT12YCR045C 1476 nt9.2□□□□□ -0.94
UTP23Q12339 BOP3YNL042W 1191 nt9.19□□□□□ -0.94
UTP23Q12339 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.16□□□□□ -0.94
UTP23Q12339 YOL037CYOL037C 354 nt9.15□□□□□ -0.94
UTP23Q12339 NPL3YDR432W 1245 nt9.14□□□□□ -0.95
UTP23Q12339 BOR1YNL275W 1731 nt9.11□□□□□ -0.95
UTP23Q12339 PTK1YKL198C 1989 nt9.1□□□□□ -0.95
UTP23Q12339 MCH5YOR306C 1566 nt9.03□□□□□ -0.96
UTP23Q12339 IDH1YNL037C 1083 nt8.97□□□□□ -0.97
UTP23Q12339 WHI5YOR083W 888 nt8.94□□□□□ -0.98
UTP23Q12339 GBP2YCL011C 1284 nt8.91□□□□□ -0.98
UTP23Q12339 YFL054CYFL054C 1941 nt8.91□□□□□ -0.98
UTP23Q12339 FMP52YER004W 696 nt8.9□□□□□ -0.98
UTP23Q12339 NCP1YHR042W 2076 nt8.89□□□□□ -0.99
UTP23Q12339 TCD2YKL027W 1344 nt8.88□□□□□ -0.99
UTP23Q12339 YLR281CYLR281C 468 nt8.88□□□□□ -0.99
UTP23Q12339 SPT8YLR055C 1809 nt8.86□□□□□ -0.99
UTP23Q12339 ALG12YNR030W 1656 nt8.85□□□□□ -0.99
UTP23Q12339 SIM1YIL123W 1431 nt8.84□□□□□ -0.99
UTP23Q12339 IMP2'YIL154C 1041 nt8.84□□□□□ -0.99
UTP23Q12339 LCB1YMR296C 1677 nt8.84□□□□□ -0.99
UTP23Q12339 RPM1RPM1 483 nt8.83□□□□□ -1
UTP23Q12339 YOR139CYOR139C 393 nt8.83□□□□□ -1
UTP23Q12339 RRD1YIL153W 1182 nt8.82□□□□□ -1
UTP23Q12339 PCM1YEL058W 1674 nt8.79□□□□□ -1
UTP23Q12339 HSP60YLR259C 1719 nt8.77□□□□□ -1
UTP23Q12339 SNF6YHL025W 999 nt8.76□□□□□ -1.01
UTP23Q12339 YDR433WYDR433W 441 nt8.74□□□□□ -1.01
UTP23Q12339 CWP1YKL096W 720 nt8.74□□□□□ -1.01
UTP23Q12339 DSK2YMR276W 1122 nt8.74□□□□□ -1.01
UTP23Q12339 YCL042WYCL042W 360 nt8.72□□□□□ -1.01
UTP23Q12339 PUS2YGL063W 1113 nt8.71□□□□□ -1.02
UTP23Q12339 DED1YOR204W 1815 nt8.7□□□□□ -1.02
UTP23Q12339 ADH2YMR303C 1047 nt8.69□□□□□ -1.02
UTP23Q12339 BIO4YNR057C 714 nt8.68□□□□□ -1.02
UTP23Q12339 ERF2YLR246W 1080 nt8.67□□□□□ -1.02
UTP23Q12339 FMT1YBL013W 1206 nt8.65□□□□□ -1.02
UTP23Q12339 SWE1YJL187C 2460 nt8.64□□□□□ -1.03
UTP23Q12339 LYS4YDR234W 2082 nt8.62□□□□□ -1.03
UTP23Q12339 SOR2YDL246C 1074 nt8.62□□□□□ -1.03
UTP23Q12339 SOR1YJR159W 1074 nt8.62□□□□□ -1.03
UTP23Q12339 GLK1YCL040W 1503 nt8.6□□□□□ -1.03
UTP23Q12339 MXR2YCL033C 507 nt8.6□□□□□ -1.03
UTP23Q12339 FMP45YDL222C 930 nt8.59□□□□□ -1.03
UTP23Q12339 CRR1YLR213C 1269 nt8.58□□□□□ -1.04
UTP23Q12339 YIH1YCR059C 777 nt8.57□□□□□ -1.04
UTP23Q12339 YKR040CYKR040C 504 nt8.56□□□□□ -1.04
UTP23Q12339 RNQ1YCL028W 1218 nt8.56□□□□□ -1.04
UTP23Q12339 NAR1YNL240C 1476 nt8.56□□□□□ -1.04
UTP23Q12339 HEM12YDR047W 1089 nt8.55□□□□□ -1.04
UTP23Q12339 YLL053CYLL053C 459 nt8.55□□□□□ -1.04
UTP23Q12339 YFL067WYFL067W 528 nt8.54□□□□□ -1.04
UTP23Q12339 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt8.54□□□□□ -1.04
UTP23Q12339 IMT4tM(CAU)E 72 nt8.54□□□□□ -1.04
UTP23Q12339 IMT3tM(CAU)J3 72 nt8.54□□□□□ -1.04
UTP23Q12339 IMT1tM(CAU)O1 72 nt8.54□□□□□ -1.04
UTP23Q12339 IMT2tM(CAU)P 72 nt8.54□□□□□ -1.04
UTP23Q12339 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt8.54□□□□□ -1.04
UTP23Q12339 ERV46YAL042W 1248 nt8.54□□□□□ -1.04
UTP23Q12339 RAX1YOR301W 1308 nt8.53□□□□□ -1.04
UTP23Q12339 HSL7YBR133C 2484 nt8.52□□□□□ -1.05
UTP23Q12339 DDR2YOL052C-A 186 nt8.5□□□□□ -1.05
UTP23Q12339 LPX1YOR084W 1164 nt8.5□□□□□ -1.05
UTP23Q12339 FRD1YEL047C 1413 nt8.48□□□□□ -1.05
UTP23Q12339 YPR011CYPR011C 981 nt8.47□□□□□ -1.05
UTP23Q12339 BNA2YJR078W 1362 nt8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.9 ms